• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

霊長類疾患モデル作製にむけた霊長類パーソナルゲノム・トランスクリプトーム解析

Research Project

Project/Area Number 26640065
Research InstitutionCenter for Novel Science Initatives, National Institutes of Natural Sciences

Principal Investigator

郷 康広  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター), 新分野創成センター, 特任准教授 (50377123)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords疾患モデル / 霊長類モデル / 認知ゲノム / ゲノム / マーモセット / エクソーム / 精神・神経疾患
Outline of Annual Research Achievements

ヒト精神・神経疾患の霊長類モデル動物の開発のために、マーモセットを対象とした実験的認知ゲノミクス研究を行った。マーモセットはマウスのように近交系がなく、遺伝的に統制のとれた均質な集団ではないため、表現型にばらつきが生じる可能性が高いことが予想される。そこで、マーモセットのエキソーム解析を行い、精神・神経疾患関連遺伝子における自然発症機能喪失(Loss-of-Function; 以下LoF)変異を有する個体・家系の同定を行った。エキソーム解析を行う際に、ゲノム情報以外の表現型情報を有する個体からその原因遺伝子の同定を行う“Phenotype-Driven Approach”と、ヒトの精神・神経疾患関連遺伝子として同定されている遺伝子とマーモセットにおける相同遺伝子の変異解析を行う“Genotype-Driven Approach”の両面からの研究手法があるが、本研究では、“Genotype-Driven Approach”を用いて、日本国内において飼育・繁殖されている数百頭規模のマーモセットの網羅的遺伝的解析を行い、自然発症的なLoF変異を有する個体・家系の同定を行うことにより、ヒト精神・神経疾患をターゲットとした霊長類モデル動物の開発を研究の目的とした。具体的には、以下の配列解析を行った。
精神・神経疾患に関与が強く疑われる479遺伝子を解析対象とし、マーモセット369個体において精神・神経疾患関連遺伝子の配列解析を行った。その結果、41遺伝子においてマーモセット内において稀な(頻度5%以下)LoF変異を持つ個体がいることを明らかにした。さらに、精神・神経疾患に関与する可能性がより高い遺伝子に絞り込むと19遺伝子においてLoF変異を持つ個体を同定した。そのうち多くの個体はヘテロ接合でLoF変異を持つが、2遺伝子においては、LoF変異をホモで保有する個体がいることを明らかにした。

  • Research Products

    (15 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 6 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] The life history of retrocopies illuminates the evolution of new mammalian genes2016

    • Author(s)
      Carelli FN, Hayakawa T, Go Y, Imai H, Warnefors M, Kaessmann H.
    • Journal Title

      Genome research

      Volume: 26 Pages: 301-314

    • DOI

      10.1101/gr.198473.115

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Rapid Expansion of Phenylthiocarbamide Non-Tasters among Japanese Macaques2015

    • Author(s)
      Suzuki-Hashido N, Hayakawa T, Matsui A, Go Y, Ishimaru Y, Misaka T, Abe K, Hirai H, Satta Y, Imai H.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: e0132016

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0132016

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 霊長類における精神・神経疾患関連遺伝子解析と認知ゲノミクスの展望2016

    • Author(s)
      郷康広
    • Organizer
      京都大学霊長類研究所共同利用研究会「霊長類脳科学の新しい展開とゲノム科学との融合」
    • Place of Presentation
      京都大学霊長類研究所(愛知県・犬山市)
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-12
    • Invited
  • [Presentation] マーモセットにおける精神・神経疾患関連遺伝子多様性解析2016

    • Author(s)
      郷康広
    • Organizer
      第5回日本マーモセット研究会
    • Place of Presentation
      東京慈恵会医科大学(東京都・港区)
    • Year and Date
      2016-01-27 – 2016-01-28
    • Invited
  • [Presentation] ゲノムを通して我が身を知る-ヒトとサルの間にあるもの2015

    • Author(s)
      郷康広
    • Organizer
      第64回インシリコ・メガバンク研究会
    • Place of Presentation
      東北大学東北メディカル・メガバンク機構(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-11-24 – 2015-11-24
    • Invited
  • [Presentation] Spatiotemporal gene expression trajectory in the human and non-human ape brains2015

    • Author(s)
      Yasuhiro Go, Qian Li, Shoji Tatsumoto, Philipp Khaitovich
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Symposium ~Behavior & Neurogenetics of Nonhuman Primates
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY, USA
    • Year and Date
      2015-11-17 – 2015-11-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヒト脳と類人猿脳における時空間的比較トランスクリプトーム解析2015

    • Author(s)
      辰本将司、郷康広、Qian Li、Liu He、大石高生、鵜殿俊史、重信秀治、柿田明美、那波宏之、Philipp Khaitovich
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
    • Invited
  • [Presentation] チンパンジー親子トリオ全ゲノム解析による世代間直接変異率の推定および構造変化の同定2015

    • Author(s)
      郷康広、辰本将司、福多賢太郎、野口英樹、早川卓志、友永雅己、平井啓久、松沢哲郎、阿形清和、藤山秋佐夫
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
    • Invited
  • [Presentation] ヒト脳と類人猿脳における時空間的比較トランスクリプトーム解析2015

    • Author(s)
      郷康広,Qian Li、Liu He、大石高生、鵜殿俊史、重信秀治、柿田明美、那波宏之、Philipp Khaitovich
    • Organizer
      第17回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      中央大学(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
  • [Presentation] ヒト脳と類人猿脳における時空間的比較トランスクリプトーム解析2015

    • Author(s)
      郷康広,Qian Li、Liu He、大石高生、鵜殿俊史、重信秀治、柿田明美、那波宏之、Philipp Khaitovich
    • Organizer
      第31回日本霊長類学会学術大会
    • Place of Presentation
      京都大学百周年時計台記念館(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2015-07-18 – 2015-07-20
  • [Presentation] ヒト脳と類人猿脳における時空間的比較トランスクリプトーム解析2015

    • Author(s)
      郷康広,Qian Li、Liu He、大石高生、鵜殿俊史、重信秀治、柿田明美、那波宏之、Philipp Khaitovich
    • Organizer
      NGS現場の会第4回研究会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • Year and Date
      2015-07-01 – 2015-07-03
  • [Presentation] ゲノムを通して我が身を知る-ヒトとサルの間にあるもの2015

    • Author(s)
      郷康広
    • Organizer
      東北大学脳神経科学コアセミナー
    • Place of Presentation
      東北大学医学研究科(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-05-22 – 2015-05-22
    • Invited
  • [Remarks] 自然科学研究機構新分野創成センターブレインサイエンス研究分野(郷研究室)のHP

    • URL

      http://cnsi.nins.jp/pcg/

  • [Remarks] 自然科学研究機構新分野創成センター活動報告書ダウンロードサイト

    • URL

      http://www.nins.jp/cnsi/download/index.php

  • [Remarks] 自然科学研究機構生理学研究所認知行動発達機構研究部門(併任)のHP

    • URL

      http://www.nips.ac.jp/research/group/post-48/

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi