2014 Fiscal Year Research-status Report
乳癌臨床検体の初代スフェア培養系を用いた癌根治のための変異診断システムの構築
| Project/Area Number |
26640072
|
|---|
| Research Institution | Kanazawa University |
|---|
Principal Investigator |
後藤 典子 金沢大学, がん進展制御研究所, 教授 (10251448)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 穣 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
中田 飛鳥 金沢大学, がん進展制御研究所, 助教 (70597921)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
|
| Keywords | がん幹細胞 / 乳がん / スフィア培養 / PDXモデル / RNAシーケンス / エキソームシーケンス |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、ルミナルタイプA２例, ルミナルタイプB２例、トリプルネガティブタイプ１例について、解析を行った。それぞれスフィア培養と接着培養を行ったのちに核酸を抽出し、次世代シーケンサーを使ったRNAシーケンスならびにエキソームシーケンスを行った。その後のバイオインフォマティクス解析については、ルミナルタイプA 1例、ルミナルタイプB 1例、トリプルネガティブタイプ 1例について、完了した。それぞれ、スフィア培養もしくは接着培養特異的な変異、いずれにも共通した変異が数十個ずつ同定された。それらについて、prognoscanを使って、乳がんの遺伝子発現プロファイルを解析し、発現が高い患者の予後が悪い遺伝子で、さらにoncomineを用いて解析を行い、がん組織により発現の高い遺伝子を絞り込んだ。MCM10遺伝子に注目して、解析をはじめた。MCM10遺伝子をsiRNAにてノックダウンさせると、乳がんスフィアの形成が悪くなり、がん幹細胞機能に重要であることが示唆された。
月に２検体ほどのペースで乳がんの手術検体をいただき、培養を行っている。トリプルネガティブがんの培養並びにPDXも作製できた。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
すでに５検体の次世代シーケンサーを用いた解析を行い、３検体についてはバイオインフォマティクス解析も完了しており、予定通り進んでいる。
臨床検体培養細胞ならびにPDXのカタログ化については、これまで足りなかったトリプルネガティブ検体も収集でき、順調である。また、候補のドライバー遺伝子もみつかっている。
|
| Strategy for Future Research Activity |
次世代シーケンサーを用いた解析をより多くの臨床検体培養細胞を用いて行う。臨床検体培養細胞ならびにPDXのカタログ化をさらに進める。
候補のドライバー変異をふやし、創薬と効果判定診断薬の可能性を探って行く。
|
| Causes of Carryover |
課題研究における研究分担者との研究打合せ及び学会での情報収集が、来年度多く見込まれるため、予算の一部を次年度に使用することにした。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
研究打合せ出張旅費及び学会出張旅費
|
Research Products
(9 results)
-
[Journal Article] The ordered acquisition of Class II and Class I mutations directs formation of human t(8;21) acute myelogenous leukemia stem cell.2014
Author(s)
Shima T, Miyamoto T, Kikushige Y, Yoda J, Tochigi T, Yoshimoto G, Kato K, Takenaka K, Iwasaki H, Mizuno S, Goto N, Akashi K.
-
Journal Title
Exp Hematol
Volume: 42
Pages: 955-965
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Role of pyruvate kinase M2 in transcriptional regulation leading to epithelial-mesenchymal transition.2014
Author(s)
Hamabe A, Konno M, Tanuma N, Shima H, Tsunekuni K, Kawamoto K, Nishida N, Koseki J, Mimori K, Gotoh N, Yamamoto H, Doki Y, Mori M, Ishii H.
-
Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci., USA
Volume: 111
Pages: 15526-15531
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] MicroRNA-1246 expression associated with CCNG2-mediated chemoresistance and stemness in pancreatic cancer.2014
Author(s)
Hasegawa S, Eguchi H, Nagano H, Konno M, Tomimaru Y, Wada H, Hama N, Kawamoto K, Kobayashi S, Nishida N, Koseki J, Nishimura T, Gotoh N, Ohno S, Yabuta N, Nojima H, Mori M, Doki Y, Ishii H.
-
Journal Title
Br J Cancer
Volume: 111
Pages: 1572-1580
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Epiregulin enhances tumorigenicity activating ERK/MAPK pathway in glioblastoma.2014
Author(s)
Kohsaka S, Hinohara K, Wang L, Nishimura T, Urushido M, Yachi K, Tsuda M, Tanino M, Kimura T, Nishihara H, Gotoh N, Tanaka S.
-
Journal Title
Neuro. Oncol.
Volume: 16
Pages: 960-970
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Fgfr1-Frs2/3 Signalling Maintains Sensory Progenitors during Inner Ear Hair Cell Formation.2014
Author(s)
Ono K, Kita T, Sato S, O’Neill P, Mak S-S., Paschaki M, It, M, Gotoh, N, Kawakami K, Ladher RK.
-
Journal Title
PLOS Genetics.
Volume: 10
Pages: e1004118
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
