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2016 Fiscal Year Annual Research Report

The molecular mechanism of uniparental inheraitance of mtDNA analyzed by combining the optical tweezers and microfluidic device.

Research Project

Project/Area Number 26650111
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

西村 芳樹  京都大学, 理学研究科, 助教 (70444099)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords遺伝学 / 光ピンセット / ミトコンドリアDNA / 葉緑体DNA
Outline of Annual Research Achievements

生物は、多様な組織・細胞・細胞内小器官から構成される一つの複雑な社会である。個々の細胞や細胞内小器官のもつミクロな「個性」を分子レベルで理解するためには、顕微鏡で狙った細胞を選択的に試験管内に取り込む技術の開発が必須となる。本研究課題では、赤外線レーザーによって細胞を生きたまま操作することができる光ピンセットと、飛躍的な進歩を遂げているマイクロ流路を組み合わせることにより、新たな細胞回収法の開発を目指した。具体的な対象としては、酵母様菌類クリプトコッカスやクラミドモナスにおける葉緑体やミトコンドリア核様体の遺伝に注目した。
これまで光ピンセットによる細胞単離に用いてきたガラス製マイクロチャンバー(Nishimura et al, PNAS 1999, PNAS 2006, Plant Cell 2012)は、1つ1つ手作業で作成する必要があり、1つのチャンバーで1個の細胞しか回収出来ず、さらにガラス面に細胞が接着しやすく短時間しか作業ができないなど、多くの未解決な問題点があった。本研究においてマイクロチャンバーの構造から材質まで検討した結果、透明樹脂製のマイクロチャンバー(ibidi社)を応用することで光ピンセットによる操作性や捕捉力を損なうことなく、細胞接着を著しく抑制し、長い作業時間を実現した。さらに細胞の回収にマイクロピペットを用い、1度に複数の細胞を回収することも可能となった。以上の技術を用いて、酵母用菌類クリプトコッカスの接合時におけるミトコンドリア核様体の動態を解析し、片親のミトコンドリア核様体の消失とミトコンドリアDNA分解の瞬間を1細胞で捉えることに成功した(Nishimura et al., 論文準備中)。

  • Research Products

    (11 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ブリティッシュコロンビア大学(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      ブリティッシュコロンビア大学
  • [Journal Article] Dynamic interplay between nucleoid segregation and genome integrity in Chlamydomonas chloroplasts.2016

    • Author(s)
      Odahara, M., Kobayashi,Y., Shikanai, T., *Nishimura, Y.
    • Journal Title

      Plant Physiol.

      Volume: 172 Pages: 2337-2346

    • DOI

      10.1104/pp.16.01533

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] C-Terminal Region of Sulfite Reductase Is Important to Localize to Chloroplast Nucleoids in Land Plants.2016

    • Author(s)
      Kobayashi, Y., Otani, T., Ishibashi, K., Shikanai, T., *Nishimura, Y.
    • Journal Title

      Genome Biol. Evol.

      Volume: 22 Pages: 1459-1466

    • DOI

      10.1093/gbe/evw093

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Sequence of the Gonium pectorale mating locus reveals a complex and dynamic history of changes in Volvocine algal mating haplotypes.2016

    • Author(s)
      Hamaji, T., Mogi, Y., Ferris, P. J., Mori, T., Miyagishima, S., Kabeya, Y., Nishimura, Y., Toyoda, A., Noguchi, H., Fujiyama, A., Olson, B.J., Marriage, T.N., Nishii, I., Umen, J.G., Nozaki, H.
    • Journal Title

      G3

      Volume: 115 Pages: e026229

    • DOI

      10.1534/g3.115.026229.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of a Holliday junction resolvase in chloroplasts2017

    • Author(s)
      Kobayashi, Y., Misumi, O., Odahara, M., Hirono, M., Hidaka, K., Endo, M., Sugiyama, H., Kuroiwa, T., Shikanai, T., Nishimura, Y.
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学、鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] Dynamics of chloroplast nucleoid divisions captured by microfluidic device2017

    • Author(s)
      Kamimura, Y., Kobayashi, Y., Shikanai, T., Nishimura, Y.
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学、鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] Mechanism for the cell-type specific expression of the chloroplast ndh genes in Zea mays.2017

    • Author(s)
      Yano, H., Ishibashi, K., Nishimura, Y., Shikanai, T.
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学、鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] Visualization of chloroplast-targeted autophagy in Chlamydomonas reinhardtii2017

    • Author(s)
      Li, N., Nishimura, Y., Ramundo, S., Hidema, J., Izumi, M.
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学、鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] オルガネラ核様体のダイナミズム2017

    • Author(s)
      西村芳樹
    • Organizer
      京都産業大学 バイオフォーラム
    • Place of Presentation
      京都産業大学、京都
    • Year and Date
      2017-02-16
    • Invited
  • [Presentation] 亜硫酸還元酵素のC 末端領域は葉緑体核様体局在に重要である2016

    • Author(s)
      小林優介, 鹿内利治, 西村芳樹
    • Organizer
      日本植物学会第80回大会
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター、沖縄
    • Year and Date
      2016-09-16 – 2016-09-19
  • [Presentation] Restructuring of chloroplast nucleoid factors during the green plant evolution2016

    • Author(s)
      Nishimura, Y.
    • Organizer
      The 13th international colloquium of Endocytobiology and Symbiosis
    • Place of Presentation
      京都府立大学、京都
    • Year and Date
      2016-09-10 – 2016-09-14
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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