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2015 Fiscal Year Annual Research Report

乳酸ポリマー中のモノマー分率を高度に制御する微生物酵素の進化工学研究

Research Project

Project/Area Number 26660080
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

田口 精一  北海道大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70216828)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsポリヒドロキシアルカン酸 / 乳酸ポリマー / 乳酸分率 / アセトアセチルCoA還元酵素 / 進化工学 / 速度論的解析 / ポリマー物性 / コリネ型細菌
Outline of Annual Research Achievements

実用化されているバイオベースポリマーの代表格であるポリ乳酸を発展させた乳酸ポリマーの生合成系は、独自に開発した乳酸重合酵素を微生物に遺伝子導入することで駆動する。一方で、乳酸ユニットと共重合化される3-hydroxybutyrate(3HB)との分率がコポリマー P(LA-co-3HB)の物性に直接影響を与えることが知られている。この共重合組成は、乳酸重合酵素の基質特異性に加えて2種のモノマーの供給力にも強く依存する。本研究では、acetoacetyl-CoAから3HB-CoAの合成をNADPHに依存して触媒するacetoacetyl-CoA reductase (PhaB)酵素に着目し、本酵素に進化工学を適用することで基質特異性の改変を試みている。昨年度までに、エラー誘発PCRによるランダム突然変異とプレートアッセイによる人工進化実験により、2種類の優良変異体(Q47LとT173S)を取得していた。本年度は、両変異酵素をHis-tagをN末端に付加した形で大腸菌で機能発現させ、速度論的解析に基づく酵素化学的な知見を得ることを計画した。2種の酵素は、活性型で組換え発現することに成功し、actoacetyl-CoA天然基質に対して、特徴的な反応性を示した。すなわち、kcat値に関しては、野生型酵素に比してQ47Lが2.4倍、T173S変異酵素が3.5倍の向上を示した。実際、その効果はCorynebacterium glutamicum細菌中で発現させた時にP(3HB)ポリマーの合成向上に反映した。すでに解明されている野生型酵素の立体構造上でそれら変異効果を考察したところ、基質認識に関与する領域での構造柔軟性に起因しているのではないかという推察がなされた。

  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 7 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Microbial production of poly(lactate-co-3-hydroxybutyrate) from hybrid Miscanthus-derived sugars2016

    • Author(s)
      J. Sun, C. Utsunomia, S. Sasaki, K. Matsumoto, T. Yamada, T. Ooi, S. Taguchi
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 80 Pages: 818-820

    • DOI

      10.1080/09168451.2015.1116933

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Enhanced cellular content and lactate fraction of the P(lactate-co-3-hydroxybutyrate) produced in recombinant Escherichia coli by the deletion of sigma factor RpoN2015

    • Author(s)
      R. Kadoya, Y. Kodama, K. Matsumoto, S. Taguchi
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 119 Pages: 427-429

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.09.001

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] MtgA deletion-triggered cell enlargement of Escherichia coli for enhanced intracellular polyester accumulation2015

    • Author(s)
      R. Kadoya, Matsumoto, T. Ooi, S. Taguchi
    • Journal Title

      PLos ONE

      Volume: 10 Pages: 1-8

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0125163

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Indirect positive effects of a sigma factor RpoN deletion on the lactate-based polymer production in Escherichia coli2015

    • Author(s)
      R. Kadoya, Y. Kodama, K. Matsumoto, S. Taguchi
    • Journal Title

      Bioengineered

      Volume: 6 Pages: 307-311

    • DOI

      10.1080/21655979.2015.1069449

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Molecular weight-dependent degradation of D-lactate-containing polyesters by polyhydroxyalkanoate depolymerases from Variovorax sp. C34 and Alcaligenes faecalis T12015

    • Author(s)
      J. Sun, K. Matsumoto, Y. Tabata, R. Kadoya, T. Ooi, H. Abe, S. Taguchi
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol.

      Volume: 99 Pages: 555-9563

    • DOI

      0.1007/s00253-015-6756-1

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Biosynthesis and properties of PLA-related polymers2016

    • Author(s)
      S. Taguchi
    • Organizer
      ICES Seminar
    • Place of Presentation
      Pesek Road, Jurong Island, Singapore
    • Year and Date
      2016-04-15 – 2016-04-15
    • Invited
  • [Presentation] Advances in microbial system for production of PLA-related polymers2015

    • Author(s)
      S. Taguchi
    • Organizer
      American Chemical Society, Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Engineering of Bacteria and pathways toward efficient plastic production from renewable feedstock2015

    • Author(s)
      K. Matsumoto, J. M. Nduko, J. Sun, S. Taguchi
    • Organizer
      5th Symposium on Academic Exchange and Collaborative Research
    • Place of Presentation
      ETH, Zurich, Switzerland
    • Year and Date
      2015-11-27 – 2015-11-27
    • Invited
  • [Presentation] 風船大腸菌でバイオプラスチックを作る2015

    • Author(s)
      田口精一
    • Organizer
      BioJapan2015、主催者セミナー「グリーンバイオ分野の新たなイノベーション創出に向けて」
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、アネックスホール、横浜
    • Year and Date
      2015-10-15 – 2015-10-15
    • Invited
  • [Presentation] Biosynthesis and properties of eco-friendly polymers2015

    • Author(s)
      S. Taguchi
    • Organizer
      Taiwan Bilateral Polymer Symposium 2015
    • Place of Presentation
      Sapporo, Hokkaido
    • Year and Date
      2015-09-03 – 2015-09-03
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 多元ポリ乳酸のバイオマス原料からの微生物合成一貫プロセス開発2015

    • Author(s)
      田口精一
    • Organizer
      第5回 合成生物工学シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸大学統合研究拠点コンベンションホール
    • Year and Date
      2015-08-05 – 2015-08-05
    • Invited
  • [Presentation] Biosynthetic PLA-related polymers improved by the metabolic engineering and enzyme engineering2015

    • Author(s)
      S. Taguchi
    • Organizer
      The 5th International Conference on Bio-based Polymers
    • Place of Presentation
      The National University of Singapore (NUS), Faculty of Engineering, Singapore
    • Year and Date
      2015-06-25 – 2015-06-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] Encyclopedia of Polymeric Nanomaterials2015

    • Author(s)
      Ken’ichiro Matsumoto, Kenji Tajima, Seiichi Taguchi
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      Springer Berlin Heidelberg,
  • [Book] ACS Symposium Series, Green Polymer Chemistry: Biobased Materials and Biocatalysis2015

    • Author(s)
      J. Masani Nduko, J. Sun, S. Taguchi
    • Total Pages
      19
    • Publisher
      American Chemical Society
  • [Book] Corynebacterium glutamicum: From Systems Biology to Biotechnological Applications2015

    • Author(s)
      Y. Song, J. Masani Nduko, K. Matsumoto, S. Taguchi
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      Caister Academic Press
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 高分子量微生物産生ポリエステルの合成法2015

    • Inventor(s)
      松本謙一郎、田口精一
    • Industrial Property Rights Holder
      松本謙一郎、田口精一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-153415
    • Filing Date
      2015-08-08
  • [Patent(Industrial Property Rights)] MtgA遺伝子の欠損した微生物2015

    • Inventor(s)
      田口精一、門屋亨介
    • Industrial Property Rights Holder
      田口精一、門屋亨介
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2015-110777
    • Filing Date
      2015-05-10

URL: 

Published: 2017-01-06  

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