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2014 Fiscal Year Research-status Report

Every gene is everywhere, but the environment selects

Research Project

Project/Area Number 26660152
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

伊知地 稔  東京大学, 大気海洋研究所, 研究員 (10633894)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsメタオミクス / マルチオミクス / メタゲノム / メタプロテオーム / メタメタボローム / 西部北太平洋
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、申請者が海水淡水化施設のバイオフィルムを対象としたメタマルチオミクスによる研究から見いだした「Every gene is everywhere, but the environment selects」という仮説を時空間的に異なる海水試料で検討し、海洋生態系で実証することを目的とする。平成26年度は分析に必要な試料量と質を担保する試料採取法と抽出法について検討し、海水試料を用いたメタマルチオミクスを実現させる計画であった。しかし、学術研究船白鳳丸の西部北太平洋航海において、現場濾過器(マクレーン社製)を利用できたので、分析に必要な試料量と質を担保する試料採取法を検討せずに試料採取が行えた。さらに、それらの試料の一部を用いて、分析に必要な試料量と質を担保する抽出法について検討し、メタプロテオームとメタメタボロームについては分析を実施した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初、一年間かけて行う予定であった試料採取法の検討を、現場濾過器を用いることで一気に解決することができた。さらに、次年度に行う予定であった実験の一部を前倒して実施することができた。

Strategy for Future Research Activity

メタゲノム分析を行い前年度に得られた情報と共に情報解析を進め、「Every gene is everywhere, but the environment selects」という仮説を海洋生態系で実証する。

Causes of Carryover

当該年度に前倒し請求を行った際、10万円単位での請求をするというルールに乗っ取って行った。そして、その際の差額を年度末の「使い切り」をせずに次年度に使用することにしたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度に実施予定の研究に予定通り使用する。

  • Research Products

    (3 results)

All 2014

All Presentation (3 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Presentation] Every gene is everywhere, but the environment selects2014

    • Author(s)
      伊知地稔、町山麻子、高橋唯、千浦博、伊藤世人、北出有、花田茂久、田中祐之、岩崎渉、木暮一啓
    • Organizer
      環境微生物系学会合同大会2014
    • Place of Presentation
      静岡
    • Year and Date
      2014-10-21 – 2014-10-24
  • [Presentation] Meta-omics approach to biofilm communities on the membrane of seawater reverse osmosis system2014

    • Author(s)
      Minoru Ijichi, Asako Machiyama, Yui Takahashi, Hiroshi X. Chiura, Yohito Ito, Tamotsu Kitade, Shigehisa Hanada, Yuji Tanaka, Wataru Iwasaki and Kazuhiro Kogure
    • Organizer
      15th International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-29
  • [Presentation] Every gene is everywhere, but the environment selects2014

    • Author(s)
      伊知地稔、町山麻子、高橋唯、千浦博、伊藤世人、北出有、花田茂久、田中祐之、岩崎渉、木暮一啓
    • Organizer
      第8回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      北海道
    • Year and Date
      2014-08-06 – 2014-08-08
    • Invited

URL: 

Published: 2016-05-27  

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