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2015 Fiscal Year Research-status Report

国内淡水魚の遺伝子かく乱予測モデルの開発―共存関係に基づくリスク評価

Research Project

Project/Area Number 26660190
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

福田 信二  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (70437771)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鬼倉 徳雄  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (50403936)
向井 貴彦  岐阜大学, 地域科学部, 准教授 (80377697)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords遺伝子かく乱 / 生物多様性 / 生息環境 / 数値地図情報 / 空間分布モデリング
Outline of Annual Research Achievements

今年度は、関東の主要河川のうち、多摩川(9地点地点)、荒川(3地点)、利根川(8地点)の各水系における計20地点において、モツゴの遺伝子かく乱の現状調査を実施した。各地点10個体の遺伝子分析の結果、多摩川水系では大陸型および西日本型の個体の移入が確認され、特に、大陸型の遺伝子を有するモツゴが多かった。荒川では、場所により、大陸型と西日本型の遺伝子を有するモツゴが確認された。利根川水系では、手賀沼および印旛沼において調査したが、結果として、一部のモツゴで大陸型の遺伝子が確認されたものの、多くは東日本型の遺伝子を有しており、遺伝子かく乱の進行は進んでいないことが示唆された。以上の分析結果を総魚種数や移入種数と比較したところ、明瞭な関係性はみられず、水域ごとに特徴づけられる結果となった。これは、外来遺伝子の移入が、他魚種(例えば、商業価値の高いアユ等)の放流に付随して発生したことを示唆している。すなわち、商業価値の高い魚種の放流履歴(時期と放流量)によって各調査地点における遺伝子かく乱度を特徴づけられる可能性がある。しかしながら、捕食-被食等の種間関係も考慮する必要があり、遺伝子かく乱のメカニズムの解明には更なる研究が必要である。
その他、モツゴが海外においては侵略的外来種として認識されていることから、モツゴが有する移入種としての特性を評価するために、functional responseの一つとして捕食特性を実験的に評価した。結果として、餌生物や地域ごとに捕食特性が異なることが明らかになり、体サイズによって捕食量が異なることが確認できた。個体数の影響は限定的であった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

対象生物であるモツゴの採捕が遅れたため、研究期間を延長することになったが、着実に成果が出てきており、今後の定量的な評価結果によって、遺伝子かく乱リスクの高精度モデリングの基盤が強化できる。

Strategy for Future Research Activity

今後は、これまでの成果をとりまとめ、遺伝子かく乱予測モデルを構築するとともに、捕食特性に関する成果のとりまとめと論文化を進める。予測モデルの構築の際には、ランダムフォレスト等の高精度な機械学習を援用し、変数の重要度や応答曲線等により、支配要因等に関する定量的な情報を抽出する。

Causes of Carryover

本研究では、研究対象であるモツゴを多摩川水系、荒川水系、および利根川水系で採捕し、遺伝子解析を進める予定だったが、当初予定していた期間中にほとんど採捕できなかったため、調査期間を9月まで延長した。また、Functional responseに関する実験を追加したため、その成果発表のためにも期間の延長が必要である。

Expenditure Plan for Carryover Budget

遺伝子解析の結果から、遺伝子かく乱予測モデルのプロトタイプを構築し、成果を発表する。また、Functional responseの成果をとりまとめ、学術誌に発表する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Ghent University(Belgium)

    • Country Name
      Belgium
    • Counterpart Institution
      Ghent University
  • [Int'l Joint Research] Polytech University of Valencia(Spain)

    • Country Name
      Spain
    • Counterpart Institution
      Polytech University of Valencia
  • [Journal Article] Comparing four methods for decision-tree induction: a case study on the invasive Iberian gudgeon (Gobio lozanoi; Doadrio & Madeira, 2004)2016

    • Author(s)
      Munoz-Mas, R., Fukuda, S., Vezza, P., Martinez-Capel, F.
    • Journal Title

      Ecological Informatics

      Volume: 34 Pages: 22-34

    • DOI

      10.1016/j.ecoinf.2016.04.011

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Molecular analysis of the distributions of the invasive Asian clam, Corbicula fluminea (Müller), and threatened native clam, C. leana (Prime), on Kyushu Island, Japan2016

    • Author(s)
      Okawa T, Kurita Y, Kanno K, Onikura N
    • Journal Title

      BioInvasions Records

      Volume: 5 Pages: 25-29

    • DOI

      10.3391/bir.2016.5.1.05

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Habitat suitability of eight threatened gobies inhabiting tidal flats in temperate estuaries: model development in the estuary of the Kuma River in Kyushu Island, Japan2016

    • Author(s)
      Koyama A, Inui R, Iyooka H, Akamatsu Y, Onikura N
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Volume: 63 Pages: 307-314

    • DOI

      10.1007/s10228-015-0490-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phylogeography of Opsariichthys platypus in Japan based on mitochondrial DNA sequences2016

    • Author(s)
      Kitanishi, S., Hayakawa, A., Takamura, K., Nakajima, J., Kawaguchi, Y., Onikura, N., Mukai, T.
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Pages: in press

    • DOI

      10.​1007/​s10228-016-0522-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contrasting life history patterns of the goby Rhinogobius similis in central Japan indicated by otolith Sr: Ca ratios2016

    • Author(s)
      Ishizaki, D., Mukai, T., Kikko, T., Yodo, T.
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s10228-015-0499-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Data prevalence matters when assessing species’ responses using data-driven species distribution models2016

    • Author(s)
      Fukuda, S., De Baets, B.
    • Journal Title

      Ecological Informatics

      Volume: 32 Pages: 69-78

    • DOI

      10.1016/j.ecoinf.2016.01.005

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] エコインフォマティクス―データ駆動型モデルの生態学への応用―2015

    • Author(s)
      福田信二
    • Journal Title

      システム/制御/情報

      Volume: 59(10) Pages: 363-368

    • Peer Reviewed
  • [Remarks] 水資源計画学研究室ホームページ

    • URL

      http://shinjifukuda-medaka.com/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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