2015 Fiscal Year Research-status Report
カザフスタン在来馬を用いた家畜馬の起源に関する研究
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26660257
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
国枝 哲夫 岡山大学, その他の研究科, 教授 (80178011)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 在来馬 / カザフスタン / 遺伝的多様性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、これまでにカザフスタン在来馬の集団より採取したDNAサンプルを用いて、各種のDNA多型マーカーの解析を行うことで、これら集団の遺伝的特徴を解析し、他在来馬集団および既存品種の馬と比較することにより、本集団が他の家畜馬とは由来の異なる集団であるか否かを明らかとすることを目的とする。
カザフスタンには大きく分けて、ジャベイという主にカザフスタン中部から北東部で飼育されている寒冷地に適応した在来馬と、アダイという西部を中心に飼育されている乾燥地に適応した在来馬が存在することが知られている。前年度はこれらのジャベイ、アダイとは異なるコスタナイ種等を中心に解析をおこなったが、本年度は主にジャベイについての遺伝学的解析を行った。具体的には、マイクロサテライトマーカーのタイピングを行うとともに、ミトコンドリアDNADループ領域の塩基配列の解析を行った。その結果、ジャベイの集団の中で、これらの遺伝的マーカーの対立遺伝子あるいはハプロタイプは多様性に富んでおり、ジャベイ集団の集団内における遺伝的多様性は維持されていることが推測された。さらにこれらの遺伝的マーカーを用いることでジャベイ集団は他のウマの集団と遺伝的分離されることが明らかとなった。特にミトコンドリアDNADループ領域の配列では、これまでに報告されていないハプロタイプが検出され、ジャベイ集団は他の集団とは異なる遺伝的特性を持つ可能性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
前年度、本年度の研究を通して、当初の計画通りカザフスタンの東部の各地からサンプリングされた、ジャベイ集団およびコスタナイ種等の在来馬の解析は行うことができたが、西部のアダイ集団については、解析は十分にできていない。これは、アダイ集団のサンプル数が統計学的な解析を行うの十分ではないことによる。この点については、新たにアダイ集団のDNAサンプルを得ることについての目処がついたため、研究期間を延長してアダイ集団の解析を行うこととした。
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| Strategy for Future Research Activity |
カザフスタン西部の各地より収集されたアダイ集団のDNAサンプルを用いて、マイクロサテライトマーカーのタイピングを行うとともに、ミトコンドリアDNADループ領域の塩基配列の解析を行う。さらにアダイ集団以外のジャベイ集団、コスタナイ種のDNAサンプルも含めて、多数の一塩基多型（SNP)の解析も行い、これらの集団および世界各地のウマの集団の間の類縁関係を明らかとすることで、カザフスタン在来馬の遺伝的特徴を明らかにする。
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| Causes of Carryover |
当初、研究開始の時点で収集されているカザフスタン在来馬のDNAサンプルを用いて、家畜馬の起源に関する研究を実施する予定であったが、その後、より多くの重要なカザフスタン在来馬のDNAサンプルを入手する目処がたったため、予定を変更し、当初のサンプルを用いた予備的な解析を進めるとともに、これらの新たなサンプルの収集を待って、より本格的な解析を開始することとしたため、研究計画の遅延が生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
カザフスタン西部の各地より収集されたアダイ集団のDNAサンプルを用いて、マイクロサテライトマーカーのタイピングを行うとともに、ミトコンドリアDNADループ領域の塩基配列の解析を行う。さらにアダイ集団以外のジャベイ集団、コスタナイ種のDNAサンプルも含めて、多数の一塩基多型（SNP)の解析も行う。
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[Journal Article] Allelic frequencies and association with carcass traits of six genes in local subpopulations of Japanese Black cattle.2015
Author(s)
ishimaki, T., Ibi, T.,Siqintuya, Kobayashi, N., Matsuhashi, T., Akiyama, T., Yoshida, E., Imai, K., Matsui, M., Uemura, K.,, Eto, H., Watanabe, N., Fujita, T., Saito, Y., Komatsu, T., Hoshiba, H., Mannen, H., Sasazaki, S., Kunieda, T.
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Journal Title
Anim. Sci. J
Volume: 87
Pages: 469-476
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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