2014 Fiscal Year Research-status Report
前房水短鎖RNAの網羅的解析による新規緑内障マーカー探索と機能評価
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26670263
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| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
田中 佑治 独立行政法人理化学研究所, 情報基盤センター, センター研究員 (40625513)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
河合 純 独立行政法人理化学研究所, 予防医療・診断技術開発プログラム, 副プログラムディレクター (30391923)
國方 彦志 東北大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (40361092)
藤田 幸輔 東北大学, 大学病院, 助手 (80708115) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 短鎖RNA / 網羅的解析 / バイオマーカー / 前房水 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成２６年度前半は、次世代シーケンサーによるSmall-RNAシーケンス解析のために患者からの前房水サンプルのサンプリングと動物実験の予備検討を実施した。平成２６年度後半は研究計画の見直しを行った。
まず倫理委員会で承認を得たプロトコルに従って、同意を得た白内障患者、白内障を伴う狭義原発解放隅角緑内障患者、白内障を伴う正常眼圧緑内障患者から手術中に前房水サンプルのサンプリングを実施した。細胞成分を遠心分離で除去した後、RNA抽出用の試薬と混和して凍結保存した。平成２６年度前半までにSmall-RNAシーケンス研究で計画したサンプル数に到達した。動物実験に関しては前半までに視神系挫滅モデルを用いた予備検討を実施し、検証に活用するモデルの妥当性を確認した。
平成２６年度後半は研究代表者の異動に伴う研究計画の見直しを行った。本研究は主に次世代シーケンサーによる前房水サンプルのRNA解析に特化して動物実験を実施しないこととした。研究者異動や次世代シーケンサーによる解析の対象サンプルを増量するなどの変更に伴い、本研究の臨床検体解析に関連する研究倫理に関わる諸必要手続きを終えてサンプルの移動を行った。また詳細な解析条件の検討、シーケンスやデータ解析などは平成２７年度に実施することとした。
またマイクロアレイによる前房水の解析結果や動物モデルの予備検討を含む研究内容に関する複数の学術論文を発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
研究代表者の異動に伴い実施可能な研究内容が変わったため、成果の最大化を目指して研究計画の見直しを行った。着任先は次世代シーケンサーによる受託解析を実施する機関でもあり、次世代シーケンサーによる解析に特化した研究に変更した方が大きな研究成果を得ることができると判断したことから、それに伴う諸手続きなどを行った。サンプルの移動等にも時間を要し、一部の研究に遅れが生じている。
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| Strategy for Future Research Activity |
前述の通り、研究代表者の移動に伴い、成果の最大化を目指して、次世代シーケンサーによる臨床検体の解析に特化した研究内容に変更する。平成２７年度は次世代シーケンサーによる臨床検体のシーケンスとデータ解析を主に実施する。
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| Causes of Carryover |
研究代表者の異動に伴い次世代シーケンサーによる解析を平成２７年度に実施することとなったため、研究費の大半を平成２７年度に繰り越した。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
次世代シーケンサーによる解析に使用する。
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Research Products
(4 results)
