2015 Fiscal Year Annual Research Report
CDISC標準対応症例データレポジトリーシステムの構築と運用・評価
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26670346
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
木内 貴弘 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (10260481)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大津 洋 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 医療情報解析研究部・臨床疫学研究室, 室長 (40372388)
岡田 昌史 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (70375492)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | CDISC / 症例データレポジトリ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
個別症例生データを作成しそのデータをCDISC ODM形式で構築した。XMLデータベースサーバーシステムとしてBaseXを用いたステムを構築した。このシステムに前述の個別症例生データを蓄積した。BaseXが持っているGUIモードを使いXQuery等を用いて試験検索を実施した。その結果を用いてフロントエンドWebアプリケーションの仕様を策定した。その結果は、XQueryは強力で多様な検索ができ標準規格化済みではあるものの多様な検索を実施するにはXQueryの文法と記述を習得する必要がありメタアナリシスが目的の臨床研究者にその技能の習得を課すのは大きな負担になると思われた。
そこで、フロントエンドWebアプリケーションの仕様設計方針としてXQueryの記述をアプリケーション内に隠蔽化しユーザーがXQueryを意識しなくても利用可能なものにした。アプリケーションを運用・評価したところ狙い通りにユーザーがXQueryを全く意識することなく検索キーワードを指定し検索ボタンを押下するだけの簡単な方法で複数の試験を跨った検索が実現できたことより目標は達せられたと考える。
研究計画時点には無かった追加のフロントエンドアプリケーションも開発した。これはフロントエンドWebアプリケーションと同等以上の機能を提供するがWebアプリケーションではない通常の実行可能形式のアプリケーションとした。
本研究で構築したシステムを利活用することで例えば各医療機関ごとにデータ表現形式にある程度の齟齬が含有されるようなデータであっても取り込み可能であって簡単な操作で検索が可能なことが確認された。
検索結果は抽出可能でその抽出したデータを新たなデータベースのデータとして再利用可能であった。これら成果を踏まえるとXQuery等の技能を習得せずとも簡単にメタアナリシスや再統計解析が可能な環境が提供できた。
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