2015 Fiscal Year Annual Research Report
糖尿病患者遺伝子解析に基づくゲノムコピー数維持機構の解明
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26670447
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
片桐 秀樹 東北大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (00344664)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | エネルギー・糖質代謝異常 / コピー数多型 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
35歳未満発症の２型糖尿病患者に非常に高い寄与度・特異度で見出されるゲノム構造異常について検討している。その中でも100人の35歳未満発症２型糖尿病患者のうち、13人に認められ、100人の正常対照者のうち1人しか認められなかった（オッズ比14）、特に寄与度、特異度の高い4p16.3に焦点をあてた解析を進めた。まずこの異常の発見のきっかけはタイリングアレイやカスタムメイドオリゴヌクレオチドアレイでの結合率低下であった。さらに、前年度PCRマスアレイでも部分的ながら低下は確認された。
そこで、本年度はその実態を明らかにするべく、アレイ解析で4p16.3のコピー数に有意な異常が見出された11名と対照4名について、この領域のゲノムシークエンス、および、全エキソームシークエンスを行った。ビッグデータであるため、まだ解析はすべては完了してはいない。これまでのところ、両者の解析において、アレイでの異常検出者に共通する異常は見出されていない。アレイ解析で異常が見出され、シークエンス解析ではその異状が確認できないということは、従来の解析技法では説明のつかないゲノム異常の存在を示唆していると考えられる。このことは、これまでの報告とは桁違いの寄与度特異度の異常を我々が見出していることの理由とも考えられ、大変興味深いものである。引き続きビッグデータ解析を行う一方、シークエンスサンプルの調整段階の詳細な分析などを進めることで、これらの一見矛盾する結果が意味する真のゲノム構造異常の実態解明につなげる。
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[Journal Article] Involvement of resistin-like molecule β in the development of methionine-choline deficient diet-induced non-alcoholic steatohepatitis in mice.2016
Author(s)
Okubo H, Kushiyama A, Sakoda H, Nakatsu Y, Iizuka M, Taki N, Fujishiro M, Fukushima T, Kamata H, Nagamachi A, Inaba T, Nishimura F, Katagiri H, Asahara T, Yoshida Y, Chonan O, Encinas J, Asano T
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 28
Pages: 20157
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Maternal dietary imbalance between omega-6 and omega-3 polyunsaturated fatty acids impairs neocortical development via epoxy metabolites.2016
Author(s)
Sakayori N, Kikkawa T, Tokuda H, Kiryu E, Yoshizaki K, Kawashima H, Yamada T, Arai H, Kang JX, Katagiri H, Shibata H, Innis SM, Arita M, Osumi N.
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Journal Title
Stem Cells
Volume: 34
Pages: 470-482
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Dapagliflozin, a sodium-glucose co-transporter 2 inhibitor, acutely reduces energy expenditure in BAT via neural signals in mice.2016
Author(s)
Chiba Y, Yamada T, Tsukita S, Takahashi K, Munakata Y, Shirai Y, Kodama S, Asai Y, Sugisawa T, Uno K, Sawada S, Imai J, Nakamura K, Katagiri H
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Journal Title
PLoS One
Volume: 11
Pages: e0150756
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Impacts of the Great East Japan earthquake on diabetic patients.2015
Author(s)
Tanaka M, Imai J, Satoh M, Hashimoto T, Izumi T, Sawada S, Uno K, Hasegawa Y, Kaneko K, Yamada T, Ishigaki Y, Imai Y, Katagiri H
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Journal Title
Journal of Diabetes Investigation
Volume: 6
Pages: 577-586
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Prolyl Isomerase Pin1 Negatively Regulates AMPK by Associating with the CBS Domain in the γ-subunit.2015
Author(s)
Nakatsu Y, Iwashita M, Sakoda H, Ono H, Nagata K, Matsunaga Y, Fukushima T, Fujishiro M, Kushiyama A, Kamata H, Takahashi S, Katagiri H, Honda H, Kiyonari H, Uchida T and Asano T.
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Journal Title
J Biol Chem
Volume: 290
Pages: 24255-66
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of pathogenic cardiac CD11c+ macrophages in Nod1-mediated acute coronary arteritis.2015
Author(s)
Motomura Y, Kanno S, Asano K, Tanaka M, Hasegawa Y, Katagiri H, Saito T, Hara H, Nishio H, Hara T, Yamasaki S
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Journal Title
Arterioscler Thromb Vasc Biol
Volume: 35
Pages: 1423-33
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] NAFLDにおけるhypoxia-inducible factor 1αの活性化はコレステロール胆石形成を促進する2015
Author(s)
浅井洋一郎、山田哲也, 突田壮平, 高橋圭, 前川正充, 本間緑, 宗像佑一郎, 白井勇太, 児玉慎二郎, 椙澤貴志, 千葉弓子, 近藤泰輝, 金子慶三, 宇野健司, 澤田正二郎, 今井淳太, 中村保宏, 山口浩明, 笹野公伸, 眞野成康, 上野義之, 下瀬川徹, 片桐秀樹
Organizer
第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
Place of Presentation
神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
Year and Date
2015-12-01 – 2015-12-04
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