2014 Fiscal Year Research-status Report
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26670472
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| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
伊川 友活 独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60450392)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | B細胞分化 / 長鎖ノンコーディングRNA / 造血幹細胞 / 運命決定 / エピジェネティクス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
B細胞を含むすべての血液・免疫細胞は造血幹細胞から作られる。その過程で多能性の造血幹細胞は徐々に分化能が限定されていき、最終的にB細胞にしかなれない前駆細胞に運命決定される。この運命決定は様々な転写因子やエピジェネティック因子によって制御されているが、詳細は明らかでない。特に、クロマチン修飾酵素複合体と相互作用することによって細胞の運命決定を制御することが示唆されている長鎖ノンコーディング（long non-coding: lnc）RNAの役割は不明である。申請者らは最近多分化能と自己複製能を兼ね備えた血液前駆細胞株（iLS細胞）を樹立した。この細胞を用いるとB細胞への運命決定における分子機構を調べることができる。そこで本研究ではこの培養系を用いてB細胞分化過程において特異的に働くlncRNAをスクリーニングし、その機能を明らかにすることを目的とする。
本年度は研究計画に従い、iLS細胞からB細胞への分化誘導、および経時サンプルの網羅的遺伝子発現解析を行った。経時サンプルはB細胞へ分化誘導後、0, 0.5, 1, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 24, 48, 72, 96, 120, 144時間後（計15ポイント）に細胞を回収し、RNAを精製した。得られたRNAはRNA-seq法を用いて網羅的な遺伝子発現解析を行った。このデータからlncRNAを探索したところ、数多くのlncRNAがB細胞への運命決定過程で発現していることが明らかとなった。さらに、B細胞分化が進むに連れて発現が上昇するlncRNAも見つかった。現在、これらのlncRNAのB細胞分化における発現推移およびその機能を解析中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究計画通り、iLS細胞からの分化誘導、RNAサンプルの採取、および網羅的遺伝子発現解析を行った。多くのlncRNAがB細胞分化過程において発現していることが明らかとなった。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究はほぼ実験計画通りに進んでいる。今後は論文にまとめることを念頭に必要な実験を行なっていきたい。
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| Causes of Carryover |
タイムコースサンプルの採取に遅れが生じ、RNA精製キットやシーケンスライブラリー調整用キットの購入を延期したため
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
RNA精製キット、シーケンスライブラリー調整用キットなど
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[Journal Article] The transcription repressors Bach2 and Bach1 promote B cell development by repressing the myeloid program2014
Author(s)
Itoh-Nakadai A, Hikota R, Muto A, Kometani K, Watanabe-Matsui M, Sato Y, Kobayashi M, Nakamura A, Miura Y, Yano Y, Tashiro S, Sun J, Ikawa T, Ochiai K, Kurosaki T, Igarashi K.
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Journal Title
Nat Immunol.
Volume: 12
Pages: 1171-1180
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 controls humoral immunity by modulating B-cell receptor signal strength2014
Author(s)
Hojyo S, Miyai T, Fujishiro H, Kawamura M, Yasuda T, Hijikata A, Bin BH, Irie T, Tanaka J, Atsumi T, Murakami M, Nakayama M, Ohara O, Himeno S, Yoshida H, Koseki H, Ikawa T, Mishima K, Fukada T
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A.
Volume: 111
Pages: 11786-11791
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] 11. Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 facilitates antiapoptotic signaling during early B-cell development2014
Author(s)
Miyai T, Hojyo S, Ikawa T, Kawamura M, Irie T, Ogura H, Hijikata A, Bin BH, Yasuda T, Kitamura H, Nakayama M, Ohara O, Yoshida H, Koseki H, Mishima K, Fukada T
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A.
Volume: 111
Pages: 11780-11785
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] 20. The epigenetic regulator Uhrf1 facilitates the proliferation and maturation of colonic regulatory T cells2014
Author(s)
Obata Y, Furusawa Y, Endo TA, Sharif J, Takahashi D, Atarashi K, Nakayama M, Onawa S, Fujimura Y, Takahashi M, Ikawa T, Otsubo T, Kawamura YI, Dohi T, Tajima S, Masumoto H, Ohara O, Honda K, Hori S, Ohno H, Koseki H, Hase K
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Journal Title
Nat Immunol.
Volume: 6
Pages: 571-579
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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