胆管癌特異的長鎖ノンコーディングRNAの同定と革新的治療法開発への挑戦

2014 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 26670610
• Research Institution: Nippon Medical School
• Principal Investigator: 瀧澤 俊広 日本医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90271220)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 吉田 寛 日本医科大学, 医学部, 准教授 (60246999) ; 谷合 信彦 日本医科大学, 医学部, 准教授 (20287725) ; 水口 義昭 日本医科大学, 医学部, 助教 (70409217)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: 癌 / 胆道外科学 / 胆管癌 / ノンコーディングRNA

Outline of Annual Research Achievements

胆管癌増殖･浸潤に関与する胆管癌特異的 long non-coding RNA（lncRNA）の同定：先端次世代シーケンサーによる胆管癌の発現プロファイル解析を開始した。1）胆管癌組織、胆嚢癌組織、肝細胞癌組織（所属機関倫理審査委員会により承認済）のサンプル採取およびサンプル調製を行った。2）イルミナ社次世代シーケンサー・MiSeqを用いて、培養細胞（絨毛外栄養膜細胞、胆管癌細胞株など）のlncRNA発現解析を開始した。抽出したRNAをイルミナ社TruSeq RNAサンプル調整キットで標識し、シーケンスを行った。引き続きMiSeqから得られた1サンプル当たり約900万リードの塩基配列データをCLC bio社CLC Genomics Workbenchを用いてバイオインフォマティックス解析した。mRNAとともに十分にlncRNAの配列同定が可能であった。3）Loss-of-function解析による胆管癌増殖および浸潤･転移に関与するlncRNAの同定：胆管癌細胞株を用いたlncRNA機能解析のために、レンチウイルスを用いたsiRNA発現ベクターの作製を進めた。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

血液・胆汁中の癌特異的lncRNAを用いたバイオマーカー開発において、患者さんからの血液・胆汁サンプルの採取が遅れているため。

Strategy for Future Research Activity

遅れはあるが着実に進展しているので、計画に沿って研究を進める予定である。