2015 Fiscal Year Annual Research Report
大腸癌初代培養を用いたリン酸化定量プロテオミクスによる分子標的薬効果予測
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26670614
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| Research Institution | National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition |
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Principal Investigator |
朝長 毅 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, プロテオームリサーチプロジェクト, プロジェクトリーダー (80227644)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | プロテオミクス / 大腸がん / 薬効予測 / リン酸化タンパク質 / 初代培養細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
昨年度まで、EGFR抗体薬セツキシマブに対する感受性株と耐性株間で差のあるリン酸化タンパク質、及びセツキシマブ処理後に経時的に変化する大腸がん細胞中のリン酸化タンパク質の網羅的比較定量を行った。本年度は、その解析結果をもとに、変動するリン酸化ペプチド（基質）の情報からキナーゼ活性を予測し、感受性株と耐性株間で違いのあるキナーゼが薬効予測マーカーとならないか検討するとともに、その機能的検証を行った。
その結果、セツキシマブ感受性細胞株と耐性細胞株で発現の異なるリン酸化タンパク質及び活性が異なると予測されたキナーゼ群が同定され、これらのリン酸化タンパク質やキナーゼ活性は薬剤効果予測マーカーとして有用であると考えられた。
また、上記の解析で、セツキシマブ耐性細胞株で活性が高いと予測されたキナーゼに対する阻害剤を用いて、マーカーキナーゼが本当に薬剤耐性に関与しているかどうかの検証を行った。それらの阻害剤を耐性株に用いたところ、いくつかのキナーゼ阻害剤処理によって細胞の増殖が抑えられた。このことから、それらのキナーゼが大腸がん細胞株のセツキシマブ耐性に関与していることが検証できた。
さらに、臨床検体に近い大腸がん初代培養細胞（平面培養、三次元培養）を用いたEGFR抗体薬の薬効予測マーカーの探索を行う目的で、大腸がん組織検体約40例から初代培養細胞を樹立した。
本年度予定していた初代培養細胞を用いた薬剤効果予測マーカー、薬剤耐性関連キナーゼの同定・検証を完了することはできなかったが、当初の目的であるリン酸化シグナル定量系による薬効予測モニタリングの基盤技術の構築及び大腸がん培養細胞株を用いたEGFR抗体薬の効果予測マーカーの探索と検証について達成することができた。今後実臨床に応用していく予定である。
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Research Products
(18 results)
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[Journal Article] Cell surface localization of importin α1/KPNA2 affects cancer cell proliferation by regulating FGF1 signalling.2016
Author(s)
Yamada K., Miyamoto Y., Tsujii A., Moriyama T., Ikuno Y., Shiromizu T., Serada S., Fujimoto M., Tomonaga T., Naka T., Oka M.
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Journal Title
Sci Rep
Volume: 6
Pages: 24823
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Data for Proteomic Analysis of ATP-Binding Proteins and Kinase Inhibitor Target Proteins Using an ATP Probe.2015
Author(s)
Adachi, J., Kishida, M., Watanabe, S., Hashimoto, Y., Fukamizu, K., and Tomonaga, T
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Journal Title
Data in Brief
Volume: 5
Pages: 726-729
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Nuclear accumulation of annexin A2 contributes to chromosomal instability by coilin-mediated centromere damage.2015
Author(s)
Kazami, T., Nie, H., Satoh, M., Kuga, T., Matsushita, K., Kawasaki, N., Tomonaga, T*., and Nomura, F
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Journal Title
Oncogene
Volume: 34
Pages: 4177-4189
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Differential Proteome Analysis Identifies TGF-beta-Related Pro-Metastatic Proteins in a 4T1 Murine Breast Cancer Model.2015
Author(s)
Sato, M., Matsubara, T., Adachi, J., Hashimoto, Y., Fukamizu, K., Kishida, M., Yang, Y.A., Wakefield, L.M., and Tomonaga, T
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Journal Title
PloS One
Volume: 10
Pages: e0126483
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] c-Abl induces stabilization of histone deacetylase 1 (HDAC1) in a kinase activity-dependent manner.2015
Author(s)
Aoyama, K., Yamaguchi, N., Yuki, R., Morii, M., Kubota, S., Hirata, K., Abe, K., Honda, T., Kuga, T., Hashimoto, Y., and Tomonaga, T
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Journal Title
Cell Biol Int
Volume: 39
Pages: 446-456
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Role for Tyrosine Phosphorylation of A-kinase Anchoring Protein 8 (AKAP8) in Its Dissociation from Chromatin and the Nuclear Matrix.2015
Author(s)
Kubota, S., Morii, M., Yuki, R., Yamaguchi, N., Yamaguchi, H., Aoyama, K., Kuga, T., and Tomonaga, T
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Journal Title
J Biol Chem
Volume: 290
Pages: 10891-10904
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] c-Abl-mediated tyrosine phosphorylation of JunB is required for Adriamycin-induced expression of p21.2015
Author(s)
Yamaguchi, N., Yuki, R., Kubota, S., Aoyama, K., Kuga, T., Hashimoto, Y., and Tomonaga, T
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Journal Title
Biochem J
Volume: 471
Pages: 67-77
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Transcriptional Dynamics of Immortalized Human Mesenchymal Stem Cells during Transformation.2015
Author(s)
Takeuchi, M., Higashino, A., Takeuchi, K., Hori, Y., Koshiba-Takeuchi, K., Makino, H., Monobe, Y., Kishida, M., Adachi, J., Takeuchi, J., Tomonaga, T., Umezawa, A., Kameoka, Y., and Akagi, K.
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Journal Title
PloS one
Volume: 10
Pages: e0126562
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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