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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Investigation for the mechanism of the gastric proton pump that generates the steepest cation gradient

Research Project

Project/Area Number 26711005
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

阿部 一啓  名古屋大学, 細胞生理学研究センター, 准教授 (60596188)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
KeywordsP-type ATPase / 能動輸送体 / 膜タンパク質 / 胃プロトンポンプ / 電子顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

生命の根幹である物質不均衡を形成する能動輸送体の中でも、ヒト組織において最大のカチオン濃度勾配を達成することができる胃プロトンポンプを研究対象とした。この分子の作動機構理解の為、反応中間体の構造を明らかにすること、得られた構造情報を検証する為の変異体発現系およびクリーンバイオケミストリーを実践する為の精製系の確立を目指した。
電子線結晶学により、E2P状態におけるいくつかのsub-stateの構造解析に成功し、胃内腔へ向けたプロトンの排出及びカリウムイオンの取り込みに必要なゲーティングの為の構造変化を理解した(2014 J. Biol. Chem.)。
また、胃酸抑制剤のプロトタイプ化合物が結合した構造を以前より高い分解能(6.5Å)で解析した。この構造から得られた情報に基づいた変異体の解析により、胃酸抑制剤との相互作用に重要なアミノ酸を同定した(論文投稿中)。
さらに、本研究課題で確立した動物細胞による大量発現精製系の確立に成功し、高分解能構造解析への見通しが立ったので、研究最終年度の前年度において他の研究課題に切り替えて研究を推進する。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (2 results)

All 2016

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Cryo-electron microscopy for structure analyses of membrane proteins in the lipid bilayer2016

    • Author(s)
      Abe K. & Fujiyoshi Y.
    • Journal Title

      Current Opinion in Structural Biology

      Volume: 39 Pages: 71-79

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2016.06.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 胃プロトンポンプの構造生理学2016

    • Author(s)
      阿部一啓
    • Organizer
      千里ライフサイエンスセミナーK2 トランスポーターと創薬~構造と病態からのアプローチ~
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター 大阪
    • Year and Date
      2016-05-06 – 2016-05-06
    • Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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