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2014 Fiscal Year Research-status Report

アミロイドペプチドの凝集を規格化した細胞アッセイシステムの構築

Research Project

Project/Area Number 26750375
Research InstitutionKonan University

Principal Investigator

臼井 健二  甲南大学, フロンティアサイエンス学部, 講師 (70543792)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsマイクロアレイ / バイオ関連機器 / タンパク質・ペプチド / アミロイド / 細胞アレイ / 光切断リンカー
Outline of Annual Research Achievements

高齢化社会に突入した我が国において、アミロイド病の原因物質といわれるアミロイドペプチド・タンパク質(アミロイド)に関する研究は、治療や診断といった分野はもちろん、ナノスケールの繊維や凝集体を形成することに着目したナノ材料分野など、各方面で重要になってくる。しかし、現在においてもアミロイド研究は遅々として進展しておらず、その最大の理由として、凝集体の形成条件が各研究で異なることが挙げられる。そこで本研究では、従来の手法では難しかったこれらアミロイドの凝集プロトコルを規格化することで、いつでも誰でも同条件で、物理化学的アッセイや細胞アッセイなどが行えるシステムの構築を目指す。今年度は、ペプチド合成樹脂を担体として用いた本系の構築を試みることにした。ペプチド合成樹脂を用いることにより、樹脂に直接ペプチド合成を高純度に行うことにより、固定化作業を経ずに樹脂にモノマーのまま、アミロイドを固定化することが可能となる。こうすることで、比較的難しい精製ステップを省けるほか、固定化時の凝集の懸念もなくなる。本系がうまくいくかどうか検討するために、比較的扱いやすい、アミロイドβペプチドの部分配列をモデルとして用いた。また樹脂からの切断が可能となる光切断リンカーをペプチドと樹脂間リンカーとして用い、固相合成によるペプチドの固定化とモノマー化、そして、光照射によるペプチド遊離による凝集開始が可能であるか各種実験を行った。ペプチド合成の最適化を行い、ある程度高純度にペプチドを樹脂上に配置することに成功した。次に、最適な光照射条件の検討を行った。その後、既存のモノマー化法(DMSO法)との比較を行った。その結果、既存のモノマー化法に比べて、簡便にかつ、確実にモノマー化が行えていることが判明し、さらに、モノマー化剤などが測定系に混入することなく、凝集反応が行えることがわかった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の予定とは異なりガラス基板ではなく、より簡便に操作もしやすい固相合成用樹脂を担体に使用するなどの予定の変更があったものの、それでも1年間で本コンセプトの有用性が証明された。既存の方法よりも確実、簡便にモノマー化できることが判明したほか、光照射によるペプチドの線維化開始も比較的短時間で行うことができ、凝集時間を実験ごとに揃えることも可能であることが示唆できた。また、線維化実験も既存の方法よりも簡便に確実に再現性良く行えることもわかった。以上の成果は、複数の学会で発表を行えたほか、本研究に関連する総説も執筆し現在発行中、また関連研究の原著論文も投稿中であり、当初予想していたものよりも多くの成果が得られた。ただ2年目へ向け本法の問題点なども分かり始めてきたので、それらを解決すべく本システムの改良を行う必要がある。以上より、当初予定していた研究内容から多少の変更はあったものの、成果は確実に得られており、1年目は、2年目もほぼ当初の計画通り進められる程度の進展具合であることから、「おおむね順調に進展している」と判断した。

Strategy for Future Research Activity

以下の3つを2年目に行う予定である。
1.構築できたシステムの更なる改良 1年目は光照射による遊離法を用いたが更なる効率化、簡便化などを目指し、別法を用いることを模索する。また、樹脂の導入率を下げることによる、合成時の純度向上と、ペプチド遊離時の効率化も模索する。
2.本システムを用いた細胞培養と細胞毒性評価 細胞毒性を有するペプチドを固定化したプレートでの培養は通常培養と同じように細胞が生育することがこれまでの我々の知見で明らかになっているが、アミロイドペプチドを固定化したプレートでも通常培養と同様の培養が可能であるか、固定化ペプチドの毒性評価測定をを行う。以上が問題なく行えれば、そこでペプチドを遊離させ、オリゴマー化・線維化を誘起して、細胞への影響を調べる。ペプチド遊離前後の生細胞数を調べることにより細胞毒性評価を行う。
3.本装置を用いたアミロイドβペプチドの細胞近傍挙動解析 本システムが有効であるかを示すために、代表的なアミロイドペプチドであるアルツハイマー病の原因物質と言われているアミロイドβペプチドを題材に、実際に固定化、細胞培養、凝集を行い、細胞への影響を調べていく。まず、比較的測定しやすい、細胞毒性実験を行う。これまでに最適化された固定化法、細胞培養法、光照射法を採用し、遊離後の細胞生存率を求め毒性を評価する。次に、細胞近傍での挙動解析を試みる。まず観察が可能となるよう、ペプチドに蛍光色素を導入したペプチドを合成し、これを固定化する。細胞培養などで毒性がないことを確認後、光照射し、共焦点顕微鏡を用いることで、これらペプチドの細胞導入具合や細胞膜吸着具合などをリアルタイムで観察する。また、遊離ペプチド濃度を確認することで、細胞導入・吸着量を見積もる。以上を試みることで、実際に本装置によって簡便に一連の細胞アッセイが可能であるかを評価し、本課題をまとめていきたい。

Causes of Carryover

本研究とは別の課題において民間助成金が採択され、消耗品においては共通試薬・器具などの購入をそちらで賄えたほか、旅費においても複数課題の発表を伴う学会発表参加が多かったため、単年度使いきりであったその助成金使用を優先した結果、主に物品費、旅費において当初見込み額よりも経費が小さくなった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度においては、進捗状況も概ね順調であることから、新しい機器の購入により当初2年間の予定通り物品費を使用したい。また、成果発表も積極的に行うために、旅費を当初2年間の予定額通り使用したい。

  • Research Products

    (25 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Control of guanine-rich DNA secondary structures depending on the protease activity using a designed PNA peptide2015

    • Author(s)
      K. Usui*, A. Okada, K. Kobayashi, N. Sugimoto
    • Journal Title

      Org. Biomol. Chem.

      Volume: 13 Pages: 2022-2025

    • DOI

      10.1039/C4OB02535K

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-Specific Mineralization of Silica and Calcium on DNAs Using a Designed Peptide2015

    • Author(s)
      K. Usui*, H. Nishiyama, A. Yamada, M. Ozaki, T. Tsuruoka, K.-y. Tomizaki
    • Journal Title

      Peptide science 2014

      Volume: 2014 Pages: 325-326

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptides Targeting G-Quadruplex Structures2014

    • Author(s)
      A. Okada, K. Usui*
    • Journal Title

      Chemical Biology of Nucleic Acids:Fundamentals and Clinical Applications

      Volume: 2014 Pages: 459-475

    • DOI

      10.1007/978-3-642-54452-1_25

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cellular differentiation assessments by measuring the degree of cellular internalization and membrane adsorption using designed peptides2014

    • Author(s)
      K. Usui*, T. Kikuchi, K. Kikuchi, M. Mie, E. Kobatake, H. Mihara
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. lett.

      Volume: 24 Pages: 4129-4131

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2014.07.053

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 設計ペプチドおよびDNAを用いた二種の無機物の位置特異的ミネラリゼーション制御2015

    • Author(s)
      尾崎誠、圓東那津実、西山浩人、山田葵、鶴岡孝章、富崎欣也、臼井健二
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 蛍光標識部位を含むペプチド集合体の細胞送達2015

    • Author(s)
      岸岡紘平、今井崇人、臼井健二、富崎欣也
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] アミロイドβペプチドとグアニンリッチDNAを用いた新規ナノ構造体の作製2015

    • Author(s)
      下岡正幸、岡田亜梨沙、柳原太志、臼井健二
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 光切断リンカーを介した固定化によるアミロイドペプチドの新規モノマー化法及び線維化アッセイ法の構築2015

    • Author(s)
      疋田晋也、岡平理湖、臼井健二
    • Organizer
      日本化学会第95春季年会
    • Place of Presentation
      千葉県船橋市
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 甲南大学におけるペプチド工学2015

    • Author(s)
      臼井健二
    • Organizer
      東京工業大学三原研究室講演会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2015-03-15 – 2015-03-15
    • Invited
  • [Presentation] ペプチドを用いたバイオミネラリゼーション制御2014

    • Author(s)
      圓東那津実、尾崎誠、臼井健二
    • Organizer
      2014年ハイペップ研究所紅葉ワークショップ
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2014-12-29 – 2014-12-29
  • [Presentation] プロテインフィンガープリント法における統計学的解析の基礎2014

    • Author(s)
      臼井健二
    • Organizer
      2014年ハイペップ研究所紅葉ワークショップ
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2014-12-29 – 2014-12-29
    • Invited
  • [Presentation] 光切断リンカーを用いた検出システムの構築2014

    • Author(s)
      岡平理湖、疋田晋也、臼井健二
    • Organizer
      2014年ハイペップ研究所紅葉ワークショップ
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2014-12-29 – 2014-12-29
  • [Presentation] ペプチド-DNA複合体上へのシリカ-カルシウムミネラリゼーション制御2014

    • Author(s)
      尾崎誠、臼井健二
    • Organizer
      第31回関西地区ペプチドセミナー
    • Place of Presentation
      大阪府吹田市
    • Year and Date
      2014-11-29 – 2014-11-29
  • [Presentation] 核酸塩基導入ペプチドとプロテアーゼを用いたDNAナノ構造体のスイッチング2014

    • Author(s)
      下岡正幸、岡田亜梨沙、臼井健二
    • Organizer
      第31回関西地区ペプチドセミナー
    • Place of Presentation
      大阪府吹田市
    • Year and Date
      2014-11-29 – 2014-11-29
  • [Presentation] 光科学とペプチド工学によるナノバイオへの展開2014

    • Author(s)
      臼井健二
    • Organizer
      第12回光科学若手研究会
    • Place of Presentation
      大阪府大阪市
    • Year and Date
      2014-11-29 – 2014-11-29
    • Invited
  • [Presentation] Site-Specific Mineralization of Silica and Calcium on DNAs Using a Designed Peptide2014

    • Author(s)
      K. Usui, H. Nishiyama, A. Yamada, M. Ozaki, T. Tsuruoka, K.-y. Tomizaki
    • Organizer
      第51回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      徳島県徳島市
    • Year and Date
      2014-10-22 – 2014-10-24
  • [Presentation] PNA含有ペプチドとプロテアーゼを用いた核酸ナノワイヤーの形成制御2014

    • Author(s)
      臼井 健二、下岡 正幸、岡田 亜梨沙
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山県岡山市
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] PNA含有ペプチドを用いたDNA上でのシリカ-カルシウムの位置特異的沈殿制御2014

    • Author(s)
      臼井健二、尾崎誠、山田葵、鶴岡孝章、富崎欣也
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山県岡山市
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] 設計ペプチドとプロテアーゼ、核酸を用いてナノワイヤー構造を制御する2014

    • Author(s)
      下岡正幸、岡田亜里沙、臼井健二
    • Organizer
      第46回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      京都府宮津市
    • Year and Date
      2014-08-03 – 2014-08-05
  • [Presentation] 人工ペプチドを用いて位置特異的沈殿制御を行いダンベル型シリカ-カルシウムナノ構造体を作製する2014

    • Author(s)
      尾崎誠、山田葵、熊野未里、鶴岡孝章、臼井健二
    • Organizer
      第46回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      京都府宮津市
    • Year and Date
      2014-08-03 – 2014-08-05
  • [Presentation] 様々な二次構造を持つDNAとヒストン模倣ペプチドの相互作用解析2014

    • Author(s)
      村田耕平、Pramanik Smritimoy、臼井健二、杉本直己、三好大輔
    • Organizer
      第46回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      京都府宮津市
    • Year and Date
      2014-08-03 – 2014-08-05
  • [Presentation] Designed small protein for controlling site-specific mineralization of silica and calcium on DNAs2014

    • Author(s)
      K. Usui, K. Nagai, H. Nishiyama, A. Yamada, M. Ozaki, T. Tsuruoka, K.-y. Tomizaki
    • Organizer
      The 28th Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA
    • Year and Date
      2014-07-27 – 2014-07-30
  • [Presentation] Control of cellular uptake activities using conjugates of cell-penetrating peptides and organelle-targeting signal peptides with peptide nucleic acids2014

    • Author(s)
      K. Usui, R. Kawatahara, M. Komada
    • Organizer
      The 28th Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego, California, USA
    • Year and Date
      2014-07-27 – 2014-07-30
  • [Remarks] 甲南大学フロンティアサイエンス学部臼井研究室

    • URL

      http://www.usui-lab.com

  • [Remarks] 甲南大学フロンティアサイエンス学部

    • URL

      http://www.konan-first.jp

URL: 

Published: 2016-06-01   Modified: 2023-03-16  

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