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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Research on polymer topology via knot theory

Research Project

Project/Area Number 26800081
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

石原 海  山口大学, 教育学部, 講師 (40634762)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords格子結び目
Outline of Annual Research Achievements

環状高分子の立体構造やDNA の組み換えを研究する観点から、制限された空間内の格子結び目を考えることが有効である。高さのみが制限された領域(スラブ)においては、既に格子結び目の配置や最小の長さに関して結果を得ていた。本年度は高さだけでなく幅も制限された領域(チューブ)に入る格子結び目に関して以下の結果をまとめ、専門誌への掲載が決定した。また、国際会議において、化学への応用を見据えたグラフに対する数学的な命名法と数え上げについて発表を行った。
結び目がある大きさのチューブに格子結び目として入ることと、trunkと呼ばれる不変量がチューブの大きさで制限できることとが必要十分であることを得た。これにより、スラブの場合とは異なり、どんな大きさのチューブに対しても、そこに格子結び目として入らない結び目も無限個存在することが示された。特に、非自明な結び目が入るような最も小さいチューブである(2x1)チューブに関しては、さらに細かく調べている。まず先に述べた必要十分条件により(2x1)チューブに格子結び目として入る素な結び目は2橋結び目であることがわかる。2橋結び目を(2x1)チューブ内の格子結び目として実現するために必要な最小の長さ(最小ステップ数)を決定するアルゴリズムを与え、実際10交点以下の2橋結び目に対して最小ステップ数を決定した。また、(2x1)チューブ内での最小ステップ数に対して、交点数の1次式による上界と下界をそれぞれ与えた。

  • Research Products

    (3 results)

All 2017 2016

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Bounds for minimum step number of knots confined to tubes in the simple cubic lattice2017

    • Author(s)
      Ishihara, Kai; Pouokam, Maxime; Suzuki, Atsumi; Scharein, Robert; Vazquez, Mariel; Arsuaga, Javier; Shimokawa, Koya
    • Journal Title

      Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical

      Volume: 50 Pages: 1,28

    • DOI

      doi:10.1088/1751-8121/aa6a4f

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] The nomenclature of graphs and its application in polymer chemistry2016

    • Author(s)
      石原海
    • Organizer
      Topology and graphs in polymer chemistry
    • Place of Presentation
      東京工業大学 東工大蔵前会館 (東京都目黒区)
    • Year and Date
      2016-08-06 – 2016-08-06
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNAの部位特異的組換えと絡み目のバンド手術2016

    • Author(s)
      石原海
    • Organizer
      生命ダイナミクスの数理とその応用
    • Place of Presentation
      東京大学玉原国際セミナーハウス(群馬県沼田市)
    • Year and Date
      2016-07-28 – 2016-07-28
    • Invited

URL: 

Published: 2018-01-16  

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