2016 Fiscal Year Annual Research Report
Comparative genomics and phenome analysis of closely related Acetic acid bacteria
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26830126
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| Research Institution | Yamaguchi University |
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Principal Investigator |
松谷 峰之介 山口大学, 創成科学研究科, 学術研究員 (70380558)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 同一種多菌株比較ゲノム / 酢酸菌 / 表現型解析 / Acetobacter pasteurianus |
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| Outline of Annual Research Achievements |
酢酸菌Acetobacter pasteurianusは自然発酵系で見出されており、食酢の醸造など産業的に広く用いられている。我々は，これまで酢酸菌の酸化発酵能を，酢酸菌属間および種間の違いを明らかにするという一般的な視点で研究を進めてきた。しかし、今回単一の種に限定し、その中の多菌株の比較ゲノムおよびフェノーム（網羅的表現型）解析から、その機能を解析する新しい研究手法の確立を目指している。
研究室にストックされている9株とゲノム情報が既知の3株を加えた12株について、これらの菌株の表現形（特に耐熱性）の解析を行った。これら12株でドラフトゲノムの共通遺伝子を用いたゲノムレベルの系統樹を構築したところ少なくとも４つのサブグループに別れることが明らかとなった。表現型解析についてはゲノム情報が既知の３株と合わせて計12株間での生育限界温度の解析を試みた。その結果、非常に近縁なサブグループ内においてさえ耐熱性が大きく異なるものが見出された。
既知の酢酸菌の耐熱性保持に必須であると報告されている遺伝子群（耐熱遺伝子）をそれぞれの株から抽出して比較した。その結果、耐熱性が失われている近縁株のグループ、NBRC 3277、NBRC 3278、NRBC 3280株においては、耐熱性保持に必須なキサンチン脱水素酵素のオペロンが失われていることが明らかとなった。また、他の株と比較してより高い耐熱性を示したタイのフルーツ由来の株、SKU1108株においては、キサンチン脱水素酵素オペロンのパラログ遺伝子が存在していることが見出された。そのため、特定の耐熱遺伝子の欠損変異、またはそのパラログ遺伝子などが近縁株間の耐熱性の違いに深く関与していることが強く示唆された。
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Research Products
(4 results)
