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2015 Fiscal Year Annual Research Report

人工細胞を用いた遺伝学的および合成生物学的手法の融合

Research Project

Project/Area Number 26830139
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

青木 航  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (10722184)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
KeywordsSynthetic biology / 構成的遺伝学
Outline of Annual Research Achievements

昨年度までの研究により、新規方法論「構成的遺伝学」の確立に成功した。構成的遺伝学とは、研究対象となる生物学的システムが機能するために必要十分な遺伝子セットを、一度の実験で同定するための方法論である。モデル実験として、大腸菌ガラクトシド加水分解システム(必要十分条件はLacZ遺伝子)を選択し、このシステムの完全再構成が、一週間で達成できることを示していた。
本年度の研究では、構成的遺伝学の意義を明確に示すために、いまだ全貌がわかっていないシステムに対して構成的遺伝学を適用し、その完全再構成を目指した。研究対象としては、大腸菌のlinear-linear RecET相同組換えを選択した。linear-linear RecET相同組換えは、相同配列を持つ2つの遺伝子配列間で組換えを起こすシステムであり、大腸菌を用いたハイスループットな遺伝子操作法として重要なシステムである。本システムの完全再構成を達成し、その作動原理を明らかにすれば、より高効率な遺伝子操作法を確立できると期待される。
本年度の実験では、RecET相同組換えをまず大腸菌lysate中で再構成することに成功した。また、RuvCとClpXPが重要な役割に担っていることが判明した。

  • Research Products

    (6 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Centrifugal microfluidic platform for single-cell level cardiomyocyte-based drug profiling and screening2015

    • Author(s)
      Espulgar W, Aoki W, Ikeuchi T, Mita D, Saito M, Lee JK, Tamiya E
    • Journal Title

      Lab on a Chip

      Volume: 15 Pages: 3572–3580

    • DOI

      10.1039/c5lc00652j

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single cell trapping and cell-cell interaction monitoring of cardiomyocytes in a designed microfluidic chip2015

    • Author(s)
      Espulgar W, Yamaguchi Y, Aoki W, Mita D, Saito M, Lee JK, Tamiya E
    • Journal Title

      Sensors and Actuators B: Chemical

      Volume: 207 Pages: 43–50

    • DOI

      10.1016/j.snb.2014.09.068

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Integrating reductive and synthetic approaches in biology using man-made cell-like compartments2016

    • Author(s)
      Wataru Aoki, Shun Komura, Eiichi Tamiya, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      ASBMB
    • Place of Presentation
      アメリカ、サンディエゴ
    • Year and Date
      2016-04-02 – 2016-04-06
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Integrating reductive and synthetic approaches in biology using artificial cell2016

    • Author(s)
      Wataru Aoki
    • Organizer
      Integration of Synthetic Biology and Systems Biology of Microbes
    • Place of Presentation
      奈良先端大学
    • Year and Date
      2016-03-17 – 2016-03-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Synthetic approaches for understanding biological phenomena2016

    • Author(s)
      Wataru Aoki, Mitsuyoshi Ueda
    • Organizer
      University of Bourdeaux-Kyoto University Mini-Symposium on Biomolecular Science
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2016-01-25 – 2016-01-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Integrating reductive and synthetic approaches in biology using man-made cell-like compartments2015

    • Author(s)
      Wataru Aoki、Masato Saito、Eiichi Tamiya
    • Organizer
      Pacifichem
    • Place of Presentation
      ハワイ、ホノルル
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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