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2014 Fiscal Year Research-status Report

オートファゴソーム形成を駆動するユビキチン様タンパク質脂質化反応機構の解明

Research Project

Project/Area Number 26840017
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

中戸川 万智子  東京工業大学, フロンティア研究機構, 先進研究員 (90402461)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsオートファジー / ユビキチン様タンパク質 / E2酵素 / E3酵素 / 結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

オートファジーによる分解には被分解物を包み込む二重膜胞オートファゴソームの形成が必須であり、そこではユビキチン様タンパク質Atg8と脂質分子ホスファチジルエタノールアミン(PE)が結合したAtg8-PEが重要な役割を果たす。Atg8は、E1酵素およびE2酵素を介するユビキチン結合反応と同様の反応を経てPEと結合する。興味深いことに、Atg8のE2酵素Atg3からPEへの転移を促進するE3酵素は、ユビキチン様タンパク質Atg12とAtg5の結合体Atg12-Atg5である。我々は最近、Atg12-Atg5結合体がAtg3の活性中心に構造変化を引き起こし、その活性を上昇させることを見出した(Sakoh-Nakatogawa et al., 2013)。本研究では、活性化の作用機序を明らかにするため、Atg12-Atg5結合体とAtg3の複合体の結晶構造解析に取り組む。
まず、Atg12-Atg5~Atg3複合体を安定化させるため、化学架橋剤による結合を試みた。Atg12とAtg3の相互作用に重要なアミノ酸残基に立体的に近接する残基をCys残基に置換したAtg12-Atg5結合体の変異体とAtg3変異体を精製し、最適な化学架橋剤を検討した。その結果、およそ50%の効率でAtg12-Atg5~Atg3の架橋産物を得ることに成功した。さらにHisタグ精製、イオン交換カラム、ゲル濾過カラムによる精製を行うことでAtg12-Atg5~Atg3架橋産物の精製にも成功し、現在、より高純度の精製サンプルを得る条件を検討している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

Atg12-Atg5結合体とAtg3の相互作用が弱い可能性を考慮し、これらの化学架橋産物の結晶構造解析に取り組んでいる。変異体および化学架橋剤の検討によって架橋産物を得ることに成功したが、Atg3単体の等電点や分子量が架橋産物と近いため、Atg12-Atg5~Atg3架橋産物の精製サンプルに混入したAtg3単体の分離に難航している。

Strategy for Future Research Activity

Atg12-Atg5~Atg3架橋産物とAtg3単体を分離させるため、精製条件を検討する。具体的には、バッファー組成や精製タグを検討する。あるいは、Atg12とAtg3をタンデムに繋いだ変異体の作成、耐熱性酵母K. maarxianusなどに種を変えて精製を試みる。

  • Research Products

    (7 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Localization of Atg3 to autophagy-related membranes and its enhancement by the Atg8-family interacting motif to promote expansion of the membranes.2015

    • Author(s)
      Machiko Sakoh-Nakatogawa, Hiromi Kirisako, Hitoshi Nakatogawa, Yoshinori Ohsumi
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 589 Pages: 744-749

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2015.02.003.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A novel role for 12/15-lipoxygenase in regulating autophagy.2015

    • Author(s)
      Alwena H. Morgan, Victoria J. Hammond, Machiko Sakoh-Nakatogawa, Yoshinori Ohsumi, Christopher P. Thomas, Fabien Blanchet, Vincent Piguet, Kirill Kiselyov, Valerie B. O’Donnell
    • Journal Title

      Redox Biology

      Volume: 4 Pages: 40-47

    • DOI

      10.1016/j.redox.2014.11.005.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Hrr25 triggers selective autophagy-related pathways by phosphorylating receptor proteins.2014

    • Author(s)
      Chikara Tanaka, Li-Jing Tan, Keisuke Mochida, Hiromi Kirisako, Michiko Koizumi, Eri Asai, Machiko Sakoh-Nakatogawa, Yoshinori Ohsumi, Hitoshi Nakatogawa
    • Journal Title

      The Journal of Cell Biology

      Volume: 207 Pages: 91-105

    • DOI

      10.1083/jcb.201402128

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] オートファゴソーム形成を駆動するユビキチン様タンパク質脂質化反応のメカニズム2014

    • Author(s)
      中戸川万智子、的場一晃、野田展生、稲垣冬彦、中戸川仁、大隅良典
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア(横浜)
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • Invited
  • [Presentation] Regulation of lipidation of the ubiquitin-like protein Atg8 that drives autophagosome formation2014

    • Author(s)
      Machiko Sakoh-Nakatogawa, Kazuaki Matoba, Nobuo Noda, Fuyuhiko Inagaki, Hitoshi Nakatogawa, Yoshinori Ohsumi
    • Organizer
      The 4th Asia Pacific Protein Association Conference 2014
    • Place of Presentation
      The 4th Asia Pacific Protein Association Conference 2014 (Jeju, Korea)
    • Year and Date
      2014-05-17 – 2014-05-20
    • Invited
  • [Remarks] Atg3はAIMを介してPAS及び隔離膜に蓄積し膜の伸張を促進する

    • URL

      http://proteolysis.jp/a_forum/thread.php?id=56

  • [Remarks] 出芽酵母における Hrr25 による選択的オートファジーの制御機構

    • URL

      http://proteolysis.jp/a_forum/thread.php?id=50

URL: 

Published: 2016-06-01  

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