host-pathogen interactions via noncoding RNA

2016 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 26850026
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 前島 健作 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (20726062)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: ファイトプラズマ

Outline of Annual Research Achievements

ファイトプラズマ（Candidatus Phytoplasma asteris）はヨコバイ等の昆虫により伝搬され、幅広い植物の篩部細胞内に寄生する病原細菌であり、世界各地の農業生産に大きな被害をもたらしている。これまでに全ゲノム情報解読により、既知の病原性因子（エフェクター。主に分泌タンパク質）のホモログを持たないことが明らかになっている。細胞内寄生細菌であるファイトプラズマが、従来のタンパク質型エフェクター以外にも、小分子RNA型エフェクターを持ちそれらが植物のRNAサイレンシング系に取り込まれ、撹乱作用を発揮することでファイトプラズマの感染成立に関わる可能性を調べることを目的として、これまでに、ファイトプラズマゲノム上の転写起点を網羅的に予測し、ファイトプラズマに適したRNA-seq技術の開発によりORF領域及びORFが存在しないゲノム領域からも多数の転写産物が生じていることを明らかにした。今回、ファイトプラズマ感染植物からファイトプラズマのRNAのみを取り出し、ゲノム上における転写起点を網羅的に特定する手法を確立し、ORFが存在しないゲノム領域から転写されるRNAにも転写開始点が見出されることを明らかにするとともに、ファイトプラズマに共通して見出される複数のプロモーター配列を特定した。いずれも初の知見であり、ファイトプラズマの遺伝子および小分子RNA型エフェクターの発現制御の解明に直接的に寄与するものである。これら成果は現在原著論文として投稿中である。

Research Products

• [Presentation] ファイトプラズマの遺伝子発現制御のしくみをさぐる (2016)
  • Author(s): 前島健作, 三浦千裕, 岩渕望, 鯉沼宏章, 二條貴通, 北沢優悟, 煉谷裕太朗, 姫野未紗子, 大島研郎, 難波成任
  • Organizer: 日本マイコプラズマ学会
  • Place of Presentation: 長崎県医師会館（長崎県 長崎市）
  • Year and Date: 2016-06-24 – 2016-06-25
  • Invited