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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Bacterial catabolic system for the prevention of dead-end product formation

Research Project

Project/Area Number 26850046
Research InstitutionNagaoka University of Technology

Principal Investigator

上村 直史  長岡技術科学大学, 工学研究科, 助教 (50646528)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywordsβ-アリールエーテル / リグニン / Sphingomonadaceae / カルボキシラーゼ / アセトフェノン / 細胞毒性 / バニリン酸 / AraC型転写制御因子
Outline of Annual Research Achievements

リグニン由来芳香族分解菌であるSphingobium sp. SYK-6株はβ-アリールエーテル化合物をエーテル開裂と側鎖酸化を経て、vanilloyl acetic acid (VAA)へと変換した後、vanillic acid (VA)を経由して代謝する。このときVAAの一部は非酵素的に脱炭酸され、acetovanillone (AV)を生成するが、AVはカルボキシラーゼによりVAAへと変換される。昨年度までに、AVのカルボキシル化にacvABCDEFが関与することを明らかにした。最終年度ではAVのカルボキシラーゼ成分がacvABCDEFの6遺伝子で担われるかどうか明らかにするために、本遺伝子クラスターをAV変換能およびacvABCDEF相同遺伝子を持たないSphingobium japonicum UT26S株にて発現させた。その結果、本形質転換体においてAVのVAAへの変換活性が観察され、acvABCDEF遺伝子産物がAVカルボキシル化能を有することが明らかとなった。またAVの化学構造から予想された細胞毒性について調査したところ、SYK-6株の芳香族化合物等の栄養代謝時における呼吸活性がAV存在下で低下することが示された。
本研究により、SYK-6株のβ-アリールエーテル代謝系におけるVAA以降の分解経路に関して、AVのカルボキシル化がacvABCDEFにより担われており、本遺伝子群の転写がAraC型転写制御因子のAcvRにより正に制御され、AVにより誘導されることが明らかとなった。また、AVによる細胞毒性の無害化がβ-アリールエーテル代謝の進行促進に寄与することが推察された。さらにVAAがCoAの付加を経てVAに変換されることを見出し、中心代謝系に至るまで20近い酵素反応が関わる長大なβ-アリールエーテル代謝経路の全体像を把握することに成功した。

  • Research Products

    (6 results)

All 2017 2016 Other

All Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] Sphingobium sp. SYK-6株におけるβ-aryl ether代謝中間体・β-hydroxypropiovanillone変換酵素遺伝子の機能解析2017

    • Author(s)
      樋口 雄大
    • Organizer
      2017年度 日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-18 – 2017-03-18
  • [Presentation] Characterization of the catabolic pathway and genes for acetovanillone in Sphingobium sp. strain SYK-62017

    • Author(s)
      樋口 雄大
    • Organizer
      STI-GIGAKU 2017 international conference
    • Place of Presentation
      新潟県長岡市
    • Year and Date
      2017-01-05 – 2017-01-05
  • [Presentation] Sphingobium sp. SYK-6株における acetovanillone変換酵素遺伝子群の機能と転写制御2016

    • Author(s)
      竹浪 寛樹
    • Organizer
      第61回リグニン討論会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2016-10-28 – 2016-10-28
  • [Presentation] Sphingobium属細菌におけるリグニン・β-アリールエーテル下流代謝系の解明2016

    • Author(s)
      樋口 雄大
    • Organizer
      第57回新潟生化学懇話会
    • Place of Presentation
      新潟県新潟市
    • Year and Date
      2016-06-25 – 2016-06-25
  • [Presentation] Investigation of the catabolic pathway for acetovanillone in Sphingobium sp. strain SYK-62016

    • Author(s)
      樋口 雄大
    • Organizer
      Lignobiotech IV symposium
    • Place of Presentation
      Spain, Madrid
    • Year and Date
      2016-06-21 – 2016-06-21
  • [Remarks] 微生物代謝工学研究室 web page

    • URL

      http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/index.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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