2015 Fiscal Year Annual Research Report
Imputation法を利用したサルコイドーシスのゲノムワイド関連解析
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26860226
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Research Institution | Yokohama City University |
Principal Investigator |
目黒 明 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任講師 (60508802)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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Keywords | サルコイドーシス / 遺伝子 / GWAS / imputation |
Outline of Annual Research Achievements |
サルコイドーシスは、全身の諸臓器・組織に、非乾酪性類上皮細胞肉芽腫が形成され、様々な臓器傷害を呈する疾患である。本邦において、ぶどう膜炎の原因疾患として上位を占め、心臓病変を主因とする死亡の割合が高い。そのため、サルコイドーシスの予防および迅速な診断法を確立することは、非常に有意義なものといえる。私たちは、日本人集団を対象としたサルコイドーシスのゲノム全域にわたる遺伝子解析(genome-wide association study:GWAS)を完了し、サルコイドーシスの新たな遺伝因子を同定している。本研究では、Imputation法を利用して、既に取得しているGWASデータの再評価を実行し、サルコイドーシスの遺伝因子のさらなる同定を行う。 平成26年度までに、既に取得している日本人集団のGWASデータを対象としたImputation解析を完了し、日本人のサルコイドーシスと相関を示すSNPを網羅的に検出している。平成27年度は、網羅的に検出したSNPについて、新たな日本人集団およびチェコ人集団を用いた再現性の検討(Replication study)を実行し、サルコイドーシスと真に相関を示す新たな遺伝因子を網羅的に同定した。 本研究で同定された遺伝情報は、サルコイドーシスの発症メカニズムの解明に大きく貢献すると考えられる。さらに、同定された遺伝情報はサルコイドーシスの新たな治療薬の開発にもつながることが期待される。
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