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2014 Fiscal Year Research-status Report

胃癌組織分化に関わる遺伝子の網羅的探索

Research Project

Project/Area Number 26860235
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

中村 律子  金沢大学, 医学系, 助教 (20632657)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords胃癌 / 組織型
Outline of Annual Research Achievements

胃癌の病理組織型には管腔形成が比較的保たれたもの、癌細胞が充実性あるいはびまん性に増生するものなどがある。本研究では、胃癌の形態形成に相違をもたらす遺伝子の検索を目的とし、同一胃癌患者内における組織型の異なる部位(管状腺癌、低分化腺癌)および非癌部の胃組織からmRNAを抽出後、マイクロアレイにて各組織間で発現量の異なる候補遺伝子を検出した。当初は未固定凍結組織からのRNA抽出を予定していたが、少量の凍結組織内に異なる組織型の胃癌を探し出すことが困難なため、ホルマリン固定パラフィン切片からmRNAを抽出することとした。多くの進行胃癌症例は管状腺癌・低分化腺癌が混在しており、各々の組織が混ざらないよう組織回収することが難しく、レーザーマイクロダイセクションの使用も試みたもののマイクロアレイ解析に必要量のmRNA回収が難しかった。そのため過去1年分の手術検体を再度検討し、管状腺癌と低分化腺癌が比較的明瞭に分かれていた症例よりmRNAを抽出し、回収量・保存状態ともに比較的良好であった1例をマイクロアレイにて解析した。ホルマリン固定パラフィン切片からのRNAは修飾や断片化等により品質が悪く、その影響により正確に発現の差異が判定できない可能性がある。マイクロアレイ結果のなかで、非癌部・管状腺癌・低分化腺癌間で大きく発現の差が認められた遺伝子のうちいくつかは過去の論文と合致する発現傾向であったため、信頼できるアレイ結果であると推測される。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ホルマリン固定パラフィン切片からのmRNAを使用せざるを得なかったため、できるだけ状態の良いmRNAを選別するのに時間を要したが良好なマイクロアレイ結果が得られ、候補遺伝子の解析に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

マイクロアレイで検出された、胃癌組織型で発現量の異なる候補遺伝子を、他症例の胃癌切片を含め、免疫染色やRNA in situ hybridizationにて発現状態を検索する。発現量に差が認められた遺伝子について、形態形成を含め細胞動態への影響を培養細胞での強制発現やノックダウンにて確認する。

  • Research Products

    (4 results)

All 2014

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] MLPAとFISHを用いた胃癌における増幅遺伝子の準網羅的検索2014

    • Author(s)
      大井 章史、田尻 亮輔、尾山 武、中村 律子、伏田 幸夫、土橋 洋
    • Organizer
      第73回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] アレイCGH法による癌関連遺伝子発現の腫瘍内ヘテロ不均一性を示す部分間におけるゲノムコピー数異常解析2014

    • Author(s)
      尾山 武、中村 律子、田尻 亮輔、大井 章史
    • Organizer
      第73回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] ヒト胃癌における癌関連遺伝子発現の腫瘍内不均一性を示す部分間における遺伝子発現の相違2014

    • Author(s)
      尾山武、中村律子、田尻良輔、大井章史
    • Organizer
      第103回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場
    • Year and Date
      2014-04-25
  • [Presentation] Multiple ligation-dependent probe amplificationとFISHを用いた胃癌における遺伝子増幅の準網羅的検索2014

    • Author(s)
      大井章史、田尻亮輔、中村律子、尾山武、池田博子、土橋洋
    • Organizer
      第103回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      ANAクラウンホテルプラザ広島
    • Year and Date
      2014-04-24

URL: 

Published: 2016-06-01  

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