腎線維化に寄与する非翻訳RNAの同定およびその転写制御機構の解明

2015 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 26860627
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 三村 維真理 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (00727084)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: 腎尿細管間質 / 線維化 / ヒストン / non-coding RNA

Outline of Annual Research Achievements

本研究の研究代表者は、腎尿細管間質の線維化に寄与するエピジェネティックなメカニズムおよび因子を同定するため、in vivoおよびin vitroの両方の実験を進めている。実験方法はヒストン修飾の中でも遺伝子発現の抑制マークであるH3K27me3を阻害する役割を持つDznepを慢性腎不全モデルマウスに投与し、その効果を観察した。本研究1年目に、laser capture microdisectionを用いて近位尿細管細胞のみを切りだし、高速シークエンサーによりmRNAおよびmicroRNAの網羅解析を施行した。最終年度であるH27年度には、bioinformatics専門の技術員と相談、討論しながら、虚血再灌流による急性障害によって発現が変化する遺伝子群、およびlincRNA群を同定した。さらにNCBIのデータベースに登録されているマウスのlincRNAのうち、急性虚血再灌流障害後8週間の慢性腎障害出現時点で尿細管細胞において発現が低下するlincRNA群、Dznepの8週間継続投与によりvehicle投与に比べて発現が上昇するlincRNA群を同定した。また、in vitroのサンプルにおいても、同様にRNA-seqの結果を解析したところ、低酸素刺激により発現が上昇するもののDznep投与に伴い発現が低下する遺伝子として複数の線維化関連遺伝子群を同定した。Dznepを投与することにより、in vivoにおいてもin vitroにおいても線維化関連遺伝子群が変化することにより腎尿細管間質の線維化が軽減する可能性が考えられた。

Research Products

• [Journal Article] Epigenetic memory in kidney diseases. (2016)
  • Author(s): Mimura I.
  • Journal Title: Kidney International. Volume: 89 Pages: 274-277
  • DOI: 10.1016/j.kint.2015.12.026.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Epigenetic Changes Induced by Hypoxia-Inducible Factor: a Long Way Still To Go as a Target for Therapy? (2015)
  • Author(s): Nangaku M, Inagi R, Mimura I, Tanaka T.
  • Journal Title: Journal of American Society of Nephrology. Volume: 26 Pages: 1478-1480
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolution of epigenetics in kidney diseases. (2015)
  • Author(s): Mimura I.
  • Journal Title: Nihon Jinzo Gakkai Shi. Volume: 57 Pages: 241-247
• [Journal Article] How the Target Hemoglobin of Renal Anemia Should Be. (2015)
  • Author(s): Mimura I, Tanaka T, Nangaku M.
  • Journal Title: Nephron. Volume: 131 Pages: 202-209
  • DOI: 10.1159/000440849.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Quantitating intracellular oxygen tension in vivo by phosphorescence lifetime measurement. (2015)
  • Author(s): Hirakawa Y, Yoshihara T, Kamiya M, Mimura I, Fujikura D, Masuda T, Kikuchi R, Takahashi I, Urano Y, Tobita S, Nangaku M.
  • Journal Title: Scientific Report. Volume: 5 Pages: 17838
  • DOI: 10.1038/srep17838.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 腎臓領域におけるエピジェネティクスの進展 (2016)
  • Author(s): 三村 維真理
  • Organizer: 第17回神田川腎セミナー
  • Place of Presentation: 経団連会館（東京都千代田区）
  • Year and Date: 2016-01-29 – 2016-01-29
  • Invited
• [Presentation] Identification of novel microRNAs inhibiting tubulointerstitial fibrosis. (2015)
  • Author(s): 三村 維真理
  • Organizer: Kidney Summit
  • Place of Presentation: 第一ホテル東京（東京都港区）
  • Year and Date: 2015-12-20 – 2015-12-20
• [Presentation] りん光寿命測定を用いた腎臓尿細管細胞内酸素分圧の測定 (2015)
  • Author(s): 平川陽亮、三村維真理、吉原利忠、神谷真子、浦野泰照、飛田成史、南学正臣
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-04 – 2015-12-04
• [Presentation] 低酸素とTGF-βは、下流にあるIGFBP3を介して、尿細管上皮細胞にapoptosisを誘導する (2015)
  • Author(s): 串田夏樹、野村征太郎、藤田隆教、三村維真理、南学正臣、油谷浩幸
  • Organizer: 第38回日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-12-01 – 2015-12-01
• [Presentation] Quantitating intracellular oxygen tension in kidney by phosphorescence lifetime measurement. (2015)
  • Author(s): Yosuke, Hirakawa, Imari, Mimura, Toshitada, Yoshihara, Mako, Kamiya, Yasuteru, Urano, Seiji, Tobita, Masaomi, Nangaku
  • Organizer: American Society of Nephrology
  • Place of Presentation: SanDiego（アメリカ合衆国）
  • Year and Date: 2015-11-03 – 2015-11-08
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Estimation of intracellular oxygen concentration in diabetic kidney by phosphorescence lifetime measurement (2015)
  • Author(s): Yosuke, Hirakawa, Imari, Mimura, Toshitada, Yoshihara, Mako, Kamiya, Yasuteru, Urano, Seiji, Tobita, Masaomi, Nangaku
  • Organizer: Keystone Symposia 2015
  • Place of Presentation: ウェスティン都ホテル京都（京都府京都市）
  • Year and Date: 2015-10-25 – 2015-10-29
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] りん光寿命測定を用いた生体内での尿細管細胞内低酸素の検出 (2015)
  • Author(s): 平川陽亮、三村維真理、吉原利忠、神谷真子、浦野泰照、飛田成史、南学正臣
  • Organizer: 第6回分子腎臓フォーラム
  • Place of Presentation: グランフロント大阪（大阪府大阪市）
  • Year and Date: 2015-09-05 – 2015-09-05
• [Presentation] Detection and quantification of intracellular hypoxia of kidney by phosphorescence lifetime measurement using BTPDM1. (2015)
  • Author(s): 平川陽亮、三村維真理、吉原利忠、神谷真子、浦野泰照、飛田成史、南学正臣
  • Organizer: 第3回低酸素研究会
  • Place of Presentation: 早稲田大学先端生命医科学センター（東京都新宿区）
  • Year and Date: 2015-07-25 – 2015-07-25
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] りん光寿命測定を用いた腎の低酸素の検出と定量化 (2015)
  • Author(s): 平川陽亮、三村維真理、吉原利忠、神谷真子、浦野泰照、飛田成史、南学正臣
  • Organizer: 第58回日本腎臓学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知県名古屋市）
  • Year and Date: 2015-06-05 – 2015-06-05
• [Book] Biomarkers in Diseases.: Methods, Discoveries and Applications. Biomarkers in Kidney Disease. (2015)
  • Author(s): Imari Mimura, Masaomi Nangaku
  • Total Pages: 21
  • Publisher: Springer