2015 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンサーを用いた遺伝子統合解析による食道癌化学放射線療法耐性の解明
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26861003
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
平田 秀成 九州大学, 大学病院, その他 (90721267)
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2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 食道癌 / エキソームシークエンス / RNAシークエンス / メチル化シークエンス / 化学放射線治療 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
食道扁平上皮癌へ化学放射線療法(CRT)は高い抗腫瘍効果を示すが、治療抵抗性が臨床上の問題であり、耐性獲得機構の解明および予測バイオマーカーの同定が喫緊の課題である。本研究では、遺残・再発のドライバーとなる原因遺伝子(機構)を明らかにするために以下の網羅的遺伝子解析を実施している。食道癌原発巣のCRT前およびCRT後の遺残・再発病変より組織を採取し、エキソームシークエンス, RNAシークエンス, メチル化シークエンスを施行し、エピゲノム・ゲノムレベルから転写産物異常が表現型（実際の治療感受性）に及ぼす影響について数理学的に統合解析を行う。症例登録・検体集積はほぼ完了し、各症例から抽出したDNA・RNAを用いたシークエンスを実施した。包括的ゲノム解析により、治療耐性への関与が示唆される遺伝子変異をしめした。さらに置換塩基のパターンから推察される変異シグネチャーを明らかにし、食道扁平上皮癌の発現で重要とされるCpGサイトにおけるC＞T置換や、APOBECシグネチャーの意義について検討した。一方、本研究では全症例（治療感受性群・耐性群）でTP53変異を認め、CRT感受性に重要とされて来たTP53変異の有無のみでは、実際の臨床症例におけるCRT感受性を規定する因子にはなり得ないことが示唆された。引き続きトランスクリプトーム解析・メチル化解析を実施し、包括的遺伝子解析を行うことで、耐性獲得に至る遺伝子異常を同定し、CRT耐性獲得機構を明らかにする。最終的には臨床的に有用な感受性バイオマーカーや治療標的の発見に繋げたい。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Decreased Expression of Fructose-1,6-bisphosphatase Associates with Glucose Metabolism and Tumor Progression in Hepatocellular Carcinoma2016
Author(s)
Hirata H, Sugimachi K, Komatsu H, Ueda M, Masuda T, Uchi R, Sakimura S, Nambara S, Saito T, Shinden Y, Iguchi T, Eguchi H, Ito S, Terashima K, Sakamoto K, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
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Journal Title
Cancer Res.
Volume: in press
Pages: in press
Peer Reviewed
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[Journal Article] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.2015
Author(s)
Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K.
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Journal Title
PLoS One.
Volume: 10
Pages: e0139808.
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Downregulation of PRRX1 Confers Cancer Stem Cell-Like Properties and Predicts Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma.2015
Author(s)
Hirata H, Sugimachi K, Takahashi Y, Ueda M, Sakimura S, Uchi R, Kurashige J, Takano Y, Nanbara S, Komatsu H, Saito T, Shinden Y, Iguchi T, Eguchi H, Atsumi K, Sakamoto K, Doi T, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
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Journal Title
Ann Surg Oncol.
Volume: 3
Pages: S1402-9
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] FBP1 suppresses tumor progression and retrieves altered glucose metabolism in Hepatocellular carcinoma2015
Author(s)
Hirata H, Sugimachi K, Komatsu H, Ueda M, Uchi R, Sakimura S, Masuda T, Iguchi T, Eguchi H, Ito S, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
Organizer
第74回日本癌学会学術総会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2015-10-08 – 2015-10-10
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[Presentation] Comprehensive Mutation Analysis of Response to Chemoradiothrapy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.2015
Author(s)
H Hirata, R Uchi, M Ueda, S Sakimura, Y Shinden, T Iguchi, K Atsumi, D Tsurumaru, K Sakamoto, K Sugimachi, M Hirakawa, T Sasaki, K Nakamura, H Honda, K Mimori.
Organizer
15th International Congress of Radiation Research
Place of Presentation
京都
Year and Date
2015-05-25 – 2015-05-29
Int'l Joint Research
