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2014 Fiscal Year Research-status Report

遺伝性網膜変性疾患のtarget exon sequencing

Research Project

Project/Area Number 26861445
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

荻野 顕  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (70622629)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords網膜色素変性 / 遺伝性網膜変性疾患 / 遺伝子解析 / 原因遺伝子 / 次世代シークエンサー
Outline of Annual Research Achievements

遺伝性網膜変性疾患427症例に対して、次世代シークエンサーを用いて、これまでに報告されている網膜及び視神経疾患の原因遺伝子268個を含む369遺伝子の全エクソン解析を行った。H26年度は、既報の変異データベース(HGMD professional)の契約を行い、検出された変異についての照会を行った。また、日本人1000名のexome sequencingによるコントロールデータベース(Human Genetic Variation Browser)により頻度を確認し、原因変異の抽出を行った。結果、網膜色素変性329症例のうち、121症例で原因変異を特定した。原因遺伝子としてはEYS, USH2A, RHOなどが多く認められた。副産物としての結果であるが、海外でこれまでに原因変異とされていた189変異のうち、55変異については正常日本人で頻度が高く、網膜色素変性の原因変異ではない可能性が示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

遺伝性網膜変性疾患のうち、網膜色素変性についてはH26年度中にpublicationに至っており、錐体桿体ジストロフィーにおいても、現在論文投稿直前である。

Strategy for Future Research Activity

①錐体桿体ジストロフィーについての遺伝子解析の原稿を投稿する。②網膜変性疾患の原因遺伝子として知られていない新規101の遺伝子についての解析を行う。③新規遺伝子が原因遺伝子として疑われた場合は、動物モデルの作成を行う。

  • Research Products

    (2 results)

All 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Comprehensive Molecular Diagnosis of a Large Cohort of Japanese Retinitis Pigmentosa and Usher Syndrome Patients by Next-Generation Sequencing2014

    • Author(s)
      大石 真秀
    • Journal Title

      Investigative Ophthalmology & Visual Sciences

      Volume: 55 Pages: 7343-7354

    • DOI

      doi: 10.1167/iovs.14-15458

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 次世代シークエンサーを用いた遺伝性網膜変性疾患の網羅的遺伝子診断2014

    • Author(s)
      大石真秀
    • Organizer
      第68回日本臨床眼科学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアホテル
    • Year and Date
      2014-11-13 – 2014-11-16

URL: 

Published: 2016-06-01  

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