2015 Fiscal Year Research-status Report
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26861847
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Research Institution | Tsurumi University |
Principal Investigator |
宮之原 真由 鶴見大学, 歯学部, 学部助手 (70460186)
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Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | 人類進化モデル / チンパンジー / ミュータンスレンサ球菌 / ピロシーケンシング法 / 口腔衛生 |
Outline of Annual Research Achievements |
チンパンジー口腔細菌叢解析の中で、う蝕の原因菌であるミュータンスレンサ球菌群に属す菌種を調べた結果、チンパンジー11個体中4個体からStreptococcus troglodytae,3個体からStreptococcus dentirousettiが分離され、論文に発表した(Microbiol. Immunol. 2013, 57, 359)。 ミュータンスレンサ球菌群のグルコシルトランスフェラーゼ遺伝子の系統進化は宿主哺乳類の生物学的進化と同様に進行することが報告されている(PLoS One, 2013, e56305)。S. dentirousettiは、オオコウモリ口腔から分離されたが(IJSEM,2008,160)、進化程度の異なるチンパンジー口腔になぜ存在するのか疑問が残った。近年、アフリカでエボラ出血熱が流行し、チンパンジーもエボラ出血熱に感染する。オオコウモリが最もこのウイルスキャリアーと考えられ(Nature, 2005, 438, 575)、チンパンジーがオオコウモリと接触、あるいは捕食する可能性が考えられた。捕食関係で動物間の口腔細菌の感染が起こるのか、又この細菌はコウモリ由来のS. dentirousettiと同じなのか疑問に思った。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成27年度の課題として、チンパンジーから分離されたS. dentirousetti TKU32の全遺伝子解析をピローシーケンス法で行い、詳細に検討した。 その結果、TKU32は2,248,552 bpの連続した1つのscaffoldが得られ、GC含量は43.80%であった。DDBJのMiGAPアノテーションソフトによるドラフト解析では、2078個のCDS、6個のrRNA loci、68個のtRNAが存在した。チンパンジーから分離されたS. dentirousettiは細菌分類の定義である16S rRNA遺伝子相同性ではオオコウモリのそれと100%一致し、細菌学的分類ではS. dentirousettiと考えられるが、グルコシルトランスフェラーゼ遺伝子など他の遺伝子の解析ではオオコウモリのものとは異なり、分類学的に異なる菌種と考えられた。 このことから感染経路は捕食によるものではないことが推測されたが、分類的位置関係は今後の課題となった。 平成27年度には、更にミチスグループに属する新菌種を発見し、Streptococcus panodentisと命名した(Microbiol. Immunol. 2015)。ミチスグループに属する細菌は、病原性がなく、むしろ病原菌の侵入を防ぐ働きの口腔常在菌が多い中、唯一病原性が強い肺炎レンサ球菌が含まれ、今後これらの菌の遺伝子を調べることにより、肺炎レンサ球菌の病原性遺伝獲得のメカニズム解析に役立つものと考えられる。
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Strategy for Future Research Activity |
本年度は本研究課題の最終年度である。口腔細菌はその宿主の生物学的な進化と共に変化していることが明らかとなり、これらの関係を総合的にまとめ、考察し、論文に発表したい。S. dentirousetiiの分類的位置関係、ミチスグループ細菌群の病原性遺伝子獲得のメカニズムなどミチスグループ細菌群の病原性遺伝子獲得のメカニズムなどが新たな課題と考えられた。
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Causes of Carryover |
一度で十分なサンプルの数の解析が出来なかったため。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
チンパンジー(n=5)の口腔細菌叢をピロシーケンス法により外部業者に委託し、口腔細菌叢の解析を行う予定である。
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[Journal Article] Streptococcus panodentis sp. nov. from the oral cavities of chimpanzees.2015
Author(s)
Okamoto M, Imai S, Miyanohara M, Saito W, Momoi Y, Nomura Y, Ikawa T, Ogawa T, Miyabe-Nishiwaki T, Kaneko A, Watanabe A, Watanabe S, Hayashi M, Tomonaga M, Hanada N.
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Journal Title
Microbiology and Immunology
Volume: 9
Pages: 526-32
DOI
Acknowledgement Compliant
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