2016 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive analysis of oral bacterial flora using human evolution model
| Project/Area Number |
26861847
|
|---|
| Research Institution | Tsurumi University |
|---|
Principal Investigator |
宮之原 真由 鶴見大学, 歯学部, 学部助手 (70460186)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2017-03-31
|
| Keywords | 人類進化モデル / 口腔微生物叢 / ホールゲノムシークエンス / チンパンジー / う蝕 / 歯周疾患 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
チンパンジーの口腔からミュータンスレンサ球菌の新菌種を見つけ、S. troglodytaeと命名しInt J Syst Evol Microbiol. (2013)に発表した。
平成28年度はこの菌の全遺伝子を詳細に調べ、Microbiol Immunol,; 60 (12): 811-816. 2016に報告した。方法は、チンパンジー口腔から分離されたS. troglodytae TKU31株を対象とし、Roche GS FLXにより得られた配列からアセンブル作業とGap closingにより全ゲノム配列を決定した。その結果、S. troglodytaeTKU31の遺伝子は、全長2,097,874 bp, DNA GC含量は37.18%であった。アノテーションの結果、CDSは2,082で、S. mutansの遺伝子と非常に類似していた。病原因子遺伝子として、グルコシルトランスフェラーゼ遺伝子（gtfB, gtfCおよびgtfD）、グルカン結合蛋白遺伝子（gbpA, gbpB, gbpCおよびgbpD）を持っていた。しかし、コラーゲン結合蛋白cnmおよびcbm遺伝子は持っていなかった。Rhamnose-glucose polysaccharide (rgp)遺伝子はStreptococcus属のセロタイプを決定する有用な遺伝子と考えられる。TKU31株のrgp遺伝子はS. mutans serotype c, e, f より、S. mutans LJ23株（serotype k）と最も類似していた。
以上のことから、チンパンジーにはヒト口腔に存在するS. mutansと類似の細菌が存在し、病原遺伝子も類似することが明らかとなった。S. troglotytaeTKU31の全遺伝子はDDBJ/ENA/GenBank accession no AP014612に登録した。
|
-
[Journal Article] Complete genome sequence of Streptococcus troglodytae TKU31 isolated from the oral cavity of a chimpanzee (Pan troglodytes)2016
Author(s)
Okamoto M, Naito M, Miyanohara M, Imai S, Nomura Y, Saito W, Momoi Y, Takada K, Miyabe-Nishiwaki T, Tomonaga M, Hanada N.
-
Journal Title
Microbiol Immunol
Volume: 60(12)
Pages: 811-816.
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
