多段階DNAメチル化異常を来す肺がんの新規候補遺伝子解析

2015 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 26870569
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: 佐藤 崇 慶應義塾大学, 医学部, 共同研究員 (20464836)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: 肺がん / DNAメチル化 / エピジェネティクス

Outline of Annual Research Achievements

研究代表者らはこれまで、肺多段階発がん過程におけるDNAメチル化異常の網羅的解析を行い、前がん段階からのDNAメチル化異常が腫瘍の悪性度および予後を規定していることを明らかにした。また、肺腺がん症例より得られた非がん肺組織のDNAメチル化プロファイルに基づいて発がん経路・臨床病理像とよく相関する症例の分類を行った。これらの研究に基づいて、DNAメチル化異常を来たし肺がんに関与する候補遺伝子を抽出した。
すでに着目していたADCY5、GFRA1に関して機能解析を行い、細胞株において過剰発現およびノックダウンにより形質に変化を来たすか検討したが、有意な形質変化を示すことはできなかった。一方、がん組織におけるDNAメチル化異常が予後と相関する候補遺伝子PTPRHについて、臨床検体における発現がDNAメチル化レベルと逆相関していることを見出した。細胞株の脱メチル化剤処理によってPTPRHの発現が回復することを示し、さらにMassARRAYによって臨床検体のDNAメチル化レベルを調べた。これらの結果より、肺腺がんでのPTPRH発現がDNA低メチル化によって制御され、そのDNAメチル化状態が肺腺がんの予後予測因子となるということが示された。PTPRHに関しても肺がん細胞株を用いてin vitroでの機能解析を行ったが、有用な結果は得られていない。
再度、候補遺伝子の抽出に戻り、EGFR遺伝子変異等のドライバー遺伝子異常と相関するDNAメチル化異常の解析を行っている。

Research Products

• [Journal Article] Prognostic implication of PTPRH hypomethylation in non-small cell lung cancer (2015)
  • Author(s): Sato T, Soejima K, Arai E, Hamamoto J, Yasuda H, Arai D, Ishioka K, Ohgino K, Naoki K, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Kanai Y, Betsuyaku T
  • Journal Title: Oncology Reports Volume: 34 Pages: 1137-1145
  • DOI: 10.3892/or.2015.4082
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Hypomethylation and prognostic implication of PTPRH in non-small cell lung cancer (2015)
  • Author(s): Sato T, Soejima K, Arai E, Hamamoto J, Yasuda H, Arai D, Ishioka K, Ohgino K, Naoki K, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Kanai Y, Betsuyaku T
  • Organizer: IASLC 16th World Conference on Lung Cancer
  • Place of Presentation: Denver, Colorado, USA
  • Year and Date: 2015-09-06 – 2015-09-09
  • Int'l Joint Research