• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

新興病原生物の進化における宿主個体群の遺伝的構造の役割

Research Project

Project/Area Number 26881007
Research InstitutionOsaka Ohtani University

Principal Investigator

内井 喜美子  大阪大谷大学, 薬学部, 助教 (90469619)

Project Period (FY) 2014-08-29 – 2016-03-31
Keywords新興感染症 / コイヘルペスウイルス / 環境DNA
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、2003年に日本へと導入された新興感染症コイヘルペスウイルスをモデルシステムとし、宿主個体群遺伝構造と新興病原体の相互作用を評価するための解析手法の確立と基礎的知見の取得を行った。
宿主個体群の遺伝的構造を迅速に評価するため、環境DNA(水に含まれる、生物に由来するDNA)を利用した解析手法の開発を試みた。まず、一塩基の違いを高感度に区別できるサイクリングプローブ技術を用いたリアルタイムPCRにより、一塩基多型に基づいて2つの遺伝子型を判別するとともに、両者の頻度を定量する環境DNA手法を水槽実験レベルで確立した。さらに本手法の実用性を確認するため、本手法を自然水域へと適用したところ、複数のコイ地域個体群の遺伝的構造を広域的かつ迅速に評価することに成功した。環境DNAによる宿主個体群遺伝構造解析に関わる研究成果は、平成27年度に国際学術誌に公表された。また、2008年から2009年にかけて自然水域から採取されたコイヘルペスウイルスの遺伝子解析を行った。すると、日本には単一系統のコイヘルペスウイルスのみが導入されたのにも関わらず、導入数年後には複数の遺伝子型が存在することが明らかとなった。つまり、日本への導入後、コイヘルペスウイルスに遺伝的変異が生じたことが示唆された。
以上の成果より、宿主コイ個体群遺伝構造とコイヘルペスウイルスの相互作用プロセスを検証するための土台を構築することができた。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2016 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] A novel environmental DNA approach to quantify the cryptic invasion of non-native genotypes2016

    • Author(s)
      Uchii K, Doi H, Minamoto T
    • Journal Title

      Molecular Ecology Resources

      Volume: 16 Pages: 415-422

    • DOI

      10.1111/1755-0998.12460

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Use of droplet digital PCR for estimation of fish abundance and biomass in environmental DNA surveys2015

    • Author(s)
      Doi H, Uchii K, Takahara T, Matsuhashi S, Yamanaka H, Minamoto T
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 10(3) Pages: e0122763

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0122763

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] SNPの定量的解析による遺伝子型頻度の推定2016

    • Author(s)
      内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹
    • Organizer
      第63回日本生態学会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-24
  • [Presentation] コイヘルペスウイルスの野外における増殖/潜伏サイクル2015

    • Author(s)
      酒井涼, 内井喜美子, 谷佳津治
    • Organizer
      第65回日本薬学会近畿支部総会・大会
    • Place of Presentation
      大阪大谷大学(富田林)
    • Year and Date
      2015-10-17 – 2015-10-17
  • [Presentation] 環境DNA分析によるコイの季節移動の推定2015

    • Author(s)
      内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文
    • Organizer
      日本陸水学会第80回大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(函館)
    • Year and Date
      2015-09-26 – 2015-09-29
  • [Book] コイヘルペスウイルス. 川端善一郎他 (編) "感染症の生態学" pp. 241-2532016

    • Author(s)
      内井喜美子, 川端善一郎
    • Total Pages
      356
    • Publisher
      共立出版

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi