2014 Fiscal Year Annual Research Report
がん発症、悪性化におけるnon-coding RNAの新しい役割
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26893093
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
寺島 農 金沢大学, がん進展制御研究所, 助教 (80507434)
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| Project Period (FY) |
2014-08-29 – 2016-03-31
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| Keywords | 癌 / エピジェネティクス / non-coding RNA / レトロウイルス挿入変異 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、レトロウイルス挿入変異によって同定された癌に関わる遺伝子候補のうち、タンパク質をコードしないnon-coding RNAを新たに発見し、それらの癌における役割を明らかにすることを目的とした。
同定した候補non-coding RNAのうち、急性前骨髄球性白血病での関与が推測されているNEAT1、X染色体の不活性化に関わるJPXの解析をまずは進めている。両者とも悪性度の高い乳癌患者で発現が低く、さらに乳癌細胞株を、悪性度の高い癌微小環境の1つである低酸素条件下においても発現が低下することを見いだした。これらの結果はNEAT1、およびJPXの発現低下が乳癌の悪性化に関わる可能性を示唆している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度は、
1. ウイルス標的non-coding RNAのうち、ヒト癌組織で発現異常を示すものを探す。
2. 絞りこんだ候補non-coding RNAのうち、癌細胞の性質への影響（細胞増殖、上皮-間葉転換など）を調べる。
ことを計画していた。
上述したとおり、1は、悪性度の高い乳癌患者、低酸素条件下での乳癌細胞株での発現を調べるなど、計画どおり進んだといえる。他にもヒト肺癌組織などで発現異常を示すnon-coding RNAを調べており、さらに多くの新しい癌関連non-coding RNAをまさに得ている最中である。現在、1で得られた候補non-coding RNAの過剰発現、およびノックダウンさせた癌細胞株を樹立しており、2も順調に進展しているといえる。
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| Strategy for Future Research Activity |
上述の2で絞られた候補non-coding RNAが、癌細胞の性質への影響があることが分かれば、そのメカニズムを分子レベルで明らかにしたいと考えている。例えば、NEAT1やJPXがどのような遺伝子の発現を制御しているのかを、マイクロアレイ解析により調べる。また、RNA精製によるクロマチン分離解析法によって、NEAT1、JPXのゲノム結合領域や相互作用するタンパク質を同定し、non-coding RNAによる詳細な遺伝子発現制御の分子機構を明らかにする。
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[Journal Article] CG hypomethylation in Lsh-/- mouse embryonic fibroblasts is associated with de novo H3K4me1 formation and altered cellular plasticity.2014
Author(s)
Yu W, Briones V, Lister R, McIntosh C, Han Y, Lee EY, Ren J, Terashima M, Leighty RM, Ecker JR, Muegge K.
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A.
Volume: 111
Pages: 5890-5895
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Genome-wide DNA methylation patterns in LSH mutant reveals de-repression of repeat elements and redundant epigenetic silencing pathways.2014
Author(s)
Yu W, McIntosh C, Lister R, Zhu I, Han Y, Ren J, Landsman D, Lee E, Briones V, Terashima M, Leighty R, Ecker JR, Muegge K.
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Journal Title
Genome Res.
Volume: 24
Pages: 1613-1623
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Book] Epigenetics and Dermatology2015
Author(s)
Qianjin Lu, Christopher C. Chang, Bruce C. Richardson, Yu Liu, Jieyue Liao, Jeung-Hoon Lee, Bin Liu, Xin Sheng Wang, Hui-Min Chen, M. Eric Gershwin, Patrick S.C. Leung, Haijing Wu, Christian M. Hedrich, Alexander Lo, Melissa Serravallo, Yixing Han, Jianke Ren, Weishi Yu, Kathrin Muegge, Minoru Terashima, et al.
Total Pages
520 (113-135)
Publisher
Academic Press
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