遺伝子DNAを基礎とした蛋白質の機能と構造

1988 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 63111003
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 小川 英行 大阪大学, 理学部, 教授 (70028207)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 井口 八郎 京都大学, 理学部, 助教授 (20028195) ; 桂 勲 東京大学, 教養部, 助教授 (00107690) ; 二井 将光 大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (50012646) ; 石浜 明 国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究部門, 教授 (80019869) ; 溝淵 潔 東京大学, 理学部, 助教授 (00092346)
• Keywords: RecA蛋白質 / purL遺伝子の構造 / H^+-ATPaseのβサブユニット / RNAポリメラーゼのβサブユニット / UGAサプレッサー / 機能ドメイン

Research Abstract

最終年度の本年は、公募研究で参加した7名を新たに班員に加え一層充実した研究が行なわれた。成果の主なものは以下のとうりである。
多機能蛋白質のドメイン構造解析:遺伝子操作や遺伝子内抑制変異の位置の解析等から、RecA蛋白質のドメイン構造が明らかにされ、N末端とC末端が相互作用している可能性も示された(小川)。遺伝子がどのように編成され形成されて来たか、遺伝子中の機能の配列順序の共通性から理論が組みたてられたが、プリン生合成レギュロンの遺伝子群を解析した結果、その理論が更に裏付けられた(溝淵)。Artemia salinaのmRNAキャッピング酵素は、単一ポリペプチド鎖である。しかしトリプシン限定分解をすると酵母の様に、それぞれ独立の機能を持った二つの断片に分割され、ドメイン構造が明確になった(水本)。サブユニットの分担機能とその特異的相互作用部位:H^+ーATPaseの分子集合に重要な部位、βサブユニットのATP燐酸基との相互作用部位、H^+輸送に関与する部位等の同定がなされた(二井)。大腸菌のRNAポリメラーゼβのppGpp作用部位、プロモーターの認識特異性を持つ部位、αサブユニットと結合してホロ酵素を形成するのに必要な部位等が同定された(石浜)。コリシン生産菌はコリシン免疫蛋白質(Imm)を同時に生産してコリシンによる自殺を免れている。E3コリシンとImmE6の組み合わせで生存できる変異の解析から免疫特異性を決定する構造がつきとめられた(正木)。大きな分子集合体の形と大きさを決定する機構:λファージ尾部の「ものさし蛋白質」gpHは、その全長で長さを測っていることが明らかになった(桂)。蛋白質の耐熱性制御部位と活性部位:好熱菌B.Stearothermophilusの耐熱性中性プロテアーゼ遺伝子をクローニングして一次構造を決定した。遺伝子操作でその蛋白の二つのドメインを結ぶαヘリックスが安定化する様に変えると耐熱性が上昇した(今中)。

Research Products

• [Publications] 玄行恵子,泰悌裕,香川弘昭: 生物物理. 27. 42-46 (1987)
• [Publications] Hiroaki kagawa;Keiko Gengyo: Y.Yamamoto;T.Ogawa;H.Shinagawa;T.Nakayama;H.Matsuo;H.Ogawa: Nucleic Acid Research Symposium Seriese. J.Biochem.19. 99,6. 81-84 1579-1590 (1888)(1986)
• [Publications] H.Ogawa;T.Ogawa: H.Kagawa,K.Gengyo;A.McLachlan;S.Brener;J.Karn: Adv.Biophys.J.Mol.Biol.in press. 21. 135-148 (1986)(1899)
• [Publications] Hiroaki Kagawa;Koken Sugimoto: 小川英行: J.Mol.Biol.遺伝. 41. 6-10 (1987)
• [Publications] 香川弘昭,玄行恵子: T.Ogawa;H.Ogawa;J.Tomizawa: J.Mol.Biol.蛋白質 核酸 酵素. 202. 34. 537-550 59-65 (1989)(1988)
• [Publications] 安藤秀樹,香川弘昭: Y.Eguchi;T.Ogawa;H.Ogawa: 蛋白質 核酸 酵素. J.Mol.Biol.34. 202. 145-146 565-573 (1988)(1989)
• [Publications] Y.Eguchi;T.Ogawa;H.Ogawa: J.Mol.Biol.204. 61-67 (1988)
• [Publications] Y.Eguchi;T.Ogawa;H.Ogawa: J.Mol.Biol.204. 69-77 (1988)
• [Publications] 藤田信之,永田恭介,石浜明: 遺伝. 40. 20-30 (1986)
• [Publications] Glass,R.E.;Jones,S.T.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.203. 265-268 (1986)
• [Publications] Glass,R.E.;Jones,S.T.;Nene,V.;Nomura,T.;Fujita,N.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.203. 487-491 (1986)
• [Publications] Glass,R.E.;Honda,A.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.203. 492-495 (1986)
• [Publications] Nomura,T.;Kujita,N.;Ishihama,A.: Nucleic Acids Res.14. 6857-6870 (1986)
• [Publications] Tachibana,H.;Ishihama,A.: Nucleic Acids Res.13. 9031-9042 (1986)
• [Publications] Glass,R.E.;Jones,S.T.;Nomura,T.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.210. 1-4 (1987)
• [Publications] Ishihama,A.;Fujita,N.;Glass,R.E.: Proteins:Structure,Function and Genetics. 2. 42-53 (1987)
• [Publications] Ishihama,A.;Honda,A.;Nagasawa-Fujimori,H.;Glass,R.E.;Maekawa,T.;Imamoto,F.: Mol.Gen.Genet.206. 185-191 (1987)
• [Publications] Fujita,N.;Nomura,T.;Ishihama,A.: J.Biol.Chem.262. 1855-1859 (1987)
• [Publications] Fujita,N.;Ishihama,A.;Nagasawa,Y.;Ueda,S.: Mol.Gen.Genet.210. 5-9 (1987)
• [Publications] Fujita,N.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.210. 10-15 (1987)
• [Publications] Nomura,T.;Fujita,N.;Ishihama,A.: J.Mol.Biol.197. 659-670 (1987)
• [Publications] 石浜明: 日本農芸化学会誌.
• [Publications] Glass,R.E.;Ralphs,N.T.;Fujita,N.;Ishihama,A.: Eur.J.Biochem.176. 403-407 (1988)
• [Publications] Ishihama,A.: Trends in Genet.4. 282-286 (1988)
• [Publications] Makino,K.;Shinagawa,H.;Amemura,M.;Kimura,S.;Nakata,A.;Ishihama,A.: J.Mol.Biol.203. 85-95 (1988)
• [Publications] Ueshima,R.;Fujita,N.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.in press.
• [Publications] Yamao,F.;Iwagami,S.;Azumi,Y.;Muto,A.;Osawa,S.;Fujita,N.;Ishihama,A.: Mol.Gen.Genet.212. 364-369 (1988)
• [Publications] Nomura,T.;Ishihama,A.: EMBO J.7. 3539-3545 (1988)
• [Publications] T.Noumi;N.Oka;H.Kanazawa;M.Futai: J.Biol.Chem.261. 7070-7075 (1986)
• [Publications] T.Noumi;M.Taniai;H.Kanazawa;M.Futai: J.Biol.Chem.261. 9196-9201 (1986)
• [Publications] J.Miki;M.Takeyama;T.Noumi;H.Kanazawa;M.Maeda;M.Futai: Arch.Biochem.Biophys.251. 458-464 (1986)
• [Publications] M.Futai;S.Shimomura;M.Maeda: Arch.Biochem.Biophys.254. 313-318 (1987)
• [Publications] T.Noumi;M.Tagaya;K.Miki-Takeda;M.Maeda;T.Fukui;M.Futai: J.Biol.Chem.262. 7686-7692 (1987)
• [Publications] S-Y.Hsu;T.Noumi;M.Takeyama;M.Maeda;S.Ishibashi;M.Futai: FEBS Lett.218. 222-226 (1987)
• [Publications] T.Noumi;M.Maeda;M.Futai: FEBS Lett.213. 381-384 (1987)
• [Publications] T.Noumi;M.Azuma;S.Shimomura;M.Maeda;M.Futai: J.Biol.Chem.262. 14978-14982 (1987)
• [Publications] J.Miki;M.Maeda;M.Futai: J.Bacteriol.170. 179-183 (1988)
• [Publications] M.Futai;T.Noumi;M.Maeda: J.Bioenerg.Biomemb.20. 41-58 (1988)
• [Publications] M.Maeda;M.Tagaya;M.Futai: J.Biol.Chem.263. 3652-3656 (1988)
• [Publications] J.Miki;M.Maeda;Y.Mukohata;M.Futai: FEBS Lett.232. 221-226 (1988)
• [Publications] M.Takeyama;T.Noumi;M.Maeda;M.Futai: J.Biol.Chem.263. 16106-16112 (1988)
• [Publications] T.Noumi;M.Maeda;M.Futai: J.Biol.Chem.263. 8765-8770 (1988)
• [Publications] M.Futai;T.Noumi;M.Maeda: J.Bioenerg.Biomemb.20. 469-480 (1988)
• [Publications] M.Tagaya;T.Noumi;K.Nakano;M.Futai;T.Fukui: FEBS Lett.233. 347-351 (1988)
• [Publications] M.Kuki;T.Noumi;M.Maeda;A.Amemura;M.Futai: J.Biol.Chem.263. 17437-17442 (1988)
• [Publications] S.Eya;T.Noumi;M.Maeda;M.Futai: J.Biol.Chem.263. 10056-10062 (1988)
• [Publications] M.Maeda;S.Ishizaki;M.Futai: Biochem.Biophys.Res.Commun.157. 203-209 (1988)
• [Publications] M.Tagaya;T.Yagami;T.Noumi;M.Futai;F.Kishi;A.Nakazawa;T.Fukui: J.Biol.Chem.264. 990-994 (1989)
• [Publications] S.Soga;T.Noumi;M.Takeyama;M.Maeda;M.Futai: Arch.Biochem.Biophys.268. 643-648 (1989)
• [Publications] S.Tamura;M.Tagaya;M.Maeda;M.Futai: J.Biol.Chem.
• [Publications] Isao Katsura: J.Mol.Biol.190. 577-586 (1986)
• [Publications] Isao Katsura: Nature. 327. 73-75 (1987)
• [Publications] 桂勲: 化学と生物. 25. 14-22 (1987)
• [Publications] Isao Katsura: J.Mol.Biol.205. 397-405 (1989)
• [Publications] Z.Chang;H.Inokuchi;H.Ozeki: J.Bacteriol.
• [Publications] H.Inokuchi;K.Kondoh;M.Yoshimura;H.Ozeki: Molec.Gen.Gent.
• [Publications] Mizobuchi,K.: Adv.Biophys.21. 3-18 (1986)
• [Publications] G.Sampei;K.Mizobuchi: Nucleic Acids Research. 16. 8717 (1988)
• [Publications] K.Mizobuchi;T.Nagasu: J.Virol.62. 4554-4560 (1988)
• [Publications] T.Nagasu;K.Yoshinari;S.Kikuchi;K.Mizobuchi: J.Virol.62. 4561-4568 (1988)
• [Publications] S.Kikuchi;K.Yoshinari;H.Ishimaru;K.Mizobuchi: J.Virol.62. 4569-4576 (1988)
• [Publications] W.Watanabe;G.Sampei;A.Aiva;K.Mizobuchi: J.Bacteriol.171. 198-204 (1989)
• [Publications] G.Sampei;K.Mizobuchi: J.Biol.Chem.(1989)
• [Publications] A.Aiba;K.Mizobuchi: J.Biol.Chem.(1989)
• [Publications] G.Sampei;A.Aiba;W.Watanabe;K.Mizobuchi: J.Biol.Chem.(1989)
• [Publications] 水本清久: 細胞工学. 5. 351-359 (1986)
• [Publications] A.Honda;K.Mizumoto;A.Ishihama: J.Biol.Chem.261. 5987-5991 (1986)
• [Publications] A.Ishihama;K.Mizumoto;K.Kawakami;A.Kato;A.Honda: J.Biol.Chem.261. 10417-10421 (1986)
• [Publications] Y.Yoshikawa;K.Mizumoto;K.Yamanouchi: J.Gen.Virol.67. 2807-2812 (1986)
• [Publications] N.Itoh;H.Yamada;Y.Kaziro;K.Mizumoto: J.Biol.Chem.262. 1989-1995 (1987)
• [Publications] K.Mizumoto;Y.Kaziro: Prog.Nucleic Acid Res.Mol.Biol.34. 1-34 (1987)
• [Publications] H.Sakamoto;M.Ohno;K.Yasuda,K.Mizumoto;Y.Shimura: J.Biochem.102. 1289-1301 (1987)
• [Publications] 水本清久: 代謝. 24. 757-768 (1987)
• [Publications] 水本清久: 代謝. 25. 665-681 (1988)
• [Publications] H.Gotoh;T.Shioda;Y.Sakai;K.Mizumoto;H.Shibuta: Virology.
• [Publications] H.Tachibana;Y.Inoue;T.Kanehisa;Y.Fukami: J.Biochemistry. 104. 869-872 (1988)
• [Publications] Hirono,M.;Kumagai,Y.;Numata,O.;Watanabe,Y.: proc.Natl.Acad.Sci.(USA). 86. 75-79 (1989)
• [Publications] Kobayashi,T.;Takagi,T.;Konishi,K.;Ohnishi,K.;Watanabe,Y.: Eur.J.Biochem.174. 579-584 (1988)
• [Publications] Hirano-Ohnishi,J.;Watanabe,Y.: Exptl.Cell Res.178. 18-24 (1988)
• [Publications] Tsunemoto,T.;Numata,O.;Sugai,T.;Watanabe,Y.: Zool.Sci.5. 119-131 (1988)
• [Publications] Hirono,M.;Endoh,H.;Okada,N.;Numata,O.;Watanabe,Y.: J.Mol.Biol.194. 181-192 (1987)
• [Publications] Hirono,M.;Nakamura,M.;Tsunemoto,M.;Ohba,H.;Numata,O.;Watanabe,Y.: J.Biochem.102. 537-545 (1987)
• [Publications] M.Toba;H.Masaki;T.Ohta: J.Bacteriol.170. 3237-3242 (1988)
• [Publications] 正木春彦: 生物物理. 28. 115-118 (1988)
• [Publications] A.Akutsu;H.Masaki;T.Ohta: (J.Bacteriol.).
• [Publications] T.Imanaka;M.Shibazaki;M.Takagi: Nature. 324. 695-697 (1986)
• [Publications] M.Kubo;K.Murayama;K.Seto;T.Imanaka: J.Ferment.Technol.66. 13-17 (1988)
• [Publications] M.Kubo;T.Imanaka: J.Gen.Microbiol.134. 1883-1892 (1988)
• [Publications] 今中忠行: 細胞工学. 7. 533-538 (1988)
• [Publications] T.Miki;T.Horiuchi;T.Yasukochi;M.Inoue;H.Nagatani;H.Yamada;T.Imoto: Protein Engineering.
• [Publications] T.Imoto;H.Yamada;E.Yamada;S.Sakumoto;T.Yasukochi;T.Miki;H.Nagatani;T.Horiuchi: J.Biochem.
• [Publications] T.Miki;T.Yasukochi;H.Nagatani;M.Furuno;T.Orita;H.Yamada;T.Imoto;T.Horiuchi: Protein Engineering. 1. 327-332 (1987)
• [Publications] T.Imoto;H.Yamada;T.Yasukochi;E.Yamada;Y.Ito;T.Ueda;H.Nagatani;T.Miki;T.Horiuchi: Protein Engineering. 1. 333-338 (1987)
• [Publications] 香川弘昭: 科学. 56. 478-485 (1986)
• [Publications] 松原央,小川英行: "自然のしくみー化学の眼" 化学同人, 258 (1987)
• [Publications] Ishihama,A.: "Adv.Biophys." Japan Scientific Societies Press Elsevier, 296 (1986)
• [Publications] Ishihama,A.;Fujita,N.;Nomura,T.: "RNA Polymerase and the Regulation of Transcription" Elsevier Science Publishing Company, 355 (1986)
• [Publications] Glass,R.E.;Jones,S.T.;Ishihama,A.: "RNA Polymerase and the Regulation of Transcription" Elsevier Science Publishing Company, 355 (1987)
• [Publications] Ishihama,A.;Fujita,N.;Nomura,T.: "RNA Polymerase and the Regulation of Transcription" Elsevier Science Publishing Company, 355 (1987)
• [Publications] 石浜明: "生命科学の新しい展開を求めて" 出版科学総合研究所, 299 (1987)
• [Publications] M.Futai;H.Kanazawa: "Methods in Enzymology 126" Academic Press Inc., 588-594 (1986)
• [Publications] H.Kanazawa;T.Noumi;M.Futai: "Methods in Enzymology 126" Academic Press Inc., 595-603 (1986)
• [Publications] M.Futai;T.Noumi;M.Maeda: "Advances in Biophysics 23" 日本生物物理学会, 1-37 (1987)
• [Publications] M.Futai;T.Noumi;M.Maeda: "Ann.Rev.Biochem.58" Ann.Rev.Inc., 111-136 (1989)
• [Publications] M.Maeda;M.Futai: "Annals of the New York Academy of Sciences" The New York Academy of Sciences, inpress (1989)
• [Publications] 溝渕潔: "バイオテクノロジーと社会 I.バイオテクノロジーの基礎" 東京大学出版会(東京大学公開講座編), 1-25 (1987)
• [Publications] 溝渕潔: "核酸・蛋白質の構造情報 遺伝子編成とゲノムの進化" 東京大学出版会(内田久雄編), (1989)
• [Publications] T.Imanaka: "Horizons in Biochemical Engineering" University of Tokyo Press, 374 (1987)
• [Publications] 今中忠行: "タンパク質工学" 啓学出版(大島、三浦、渡辺編), 301 (1988)
• [Publications] 香川弘昭: "生物科学の新しい展開ーー分子から細胞へーー科学編集部ー分担ー" 岩波書店, 22-29 (1987)
• [Publications] 水本清久 他: "続生化学実験講座 第1巻(I) 遺伝子研究法" 東京化学同人(日本生化学会編), 434 (1986)
• [Publications] 水本清久 他: "微生物学実習提要" 丸善(東京大学医科学研究所学友会編), 386 (1988)
• [Publications] 水本清久 他: "毒性試験講座" 地人書館(田辺恒義監修),
• [Publications] 水本清久 他: "分子生物学の進歩 第5巻 遺伝子の発現と制御II" 丸善(志村令郎、村松正美、鈴木義昭、近藤寿人編),