1988 Fiscal Year Annual Research Report

RNAウイルス遺伝子の分子進化学的研究

Research Project

Project/Area Number	63540510
Research Institution	National Institute of Genetics
Principal Investigator	五條堀孝国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教授 (50162136)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	宝来聰国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 助手 (40126157)
Keywords	RNAウイルス / 分子進化 / 塩基置換速度 / レトロウイルス / 核遺伝子 / ミトコンドリア遺伝子 / ヒトの進化
Research Abstract	本研究は、「RNAウイルス遺伝子の分子進化学的特徴を明らかにすること」を目的としている。特に、塩基置換速度に関して、RNAウイルスは、DNAをゲノムに有する生物種(例えば、ヒト、サル、マウス、ショウジョウバエ及び大腸菌)より何倍くらい高いのかは、本研究を開始した重要な動機でもあった。また、これらウイルス遺伝子の進化がヒトの進化にどう関係するかも、研究目標の一つである。これらの研究目的を達成するため、幅広い生物種の分子進化学的描像、特に塩基置換速度を、多角的に調べた。その結果、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)に代表されるレトロウイルスは、平均10^<-3>1サイト1年のオーダーの塩基置換速度を有することが、かなり一般的に判明した。ただし、このウイルスの外被糖タンパク遺伝子の同義置換(アミノ酸を変えない塩基置換)速度は、さらにその10倍も高い可能性が指摘された。また、ヒトの核DNAの遺伝子よりも塩基置換速度が高いと言われるミトコンドリアDNA遺伝子も、10^<-8>1サイト1年のオーダーであり、RNAウイルス遺伝子とは約100万倍の相違があることに変わりはなかった。さらに、ショウジョウバエ遺伝子についても、哺乳類の核DNA遺伝子より約10倍程度、塩基置換速度が高いと考えられる。大腸菌遺伝子においては、まだ不明な部分も多く、確実な推定値が出さないものの、種々の間接的解析により、哺乳類のDNA遺伝子の塩基置換速度と同じオーダーであることが推測された。このように、「RNAゲノムの遺伝子は、DNAゲノムの遺伝子よりも、約100万倍速く進化する」という知見の一般性が確実に検証されつつある。現在、逆転写酵素は有するものの、DNAゲノムを有するヒトB型肝炎ウイルス(HBV)の進化速度の推定を行なっている。

Research Products
(11 results)

All Other

All Publications (11 results)

[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.,;Yokoyama,S.: IV International Conference on Aids.Book 1. 142 (1988)
[Publications] Yokoyama,S.,;Chung,L.,;Gojobori,T.: Mol.Biol.Evol.5(3). 237-251 (1988)
[Publications] Hayakawa,K.,;Horai,S.,;Gojobori,T.,et al.: Mol.Biol.Evol.5(3). 270-281 (1988)
[Publications] Aota,S.,;Gojobori,T.,;Ikemura,T.,et al.: Nuel.Acids.Res.16. r315-r402 (1988)
[Publications] Harihara,S.,;Gojobori,T.,;Omoto,K.,et al: Amer.J.Hum.Genet.43. 134-143 (1988)
[Publications] Hayasaka,K.,;Gojobori,T.,;Horai,S.: Mol.Biol.Evol.5(3). 626-644 (1988)
[Publications] Shimizu,N.,;Gojobori,T.,et al.: FEBS Lett.
[Publications] Moriyama,E.N.,;Gojobori,T.: J.Mol.Evol.
[Publications] Yamato,T.,;Gojobori,T.,et al.: "Discontinuous evolution of bacterial pathogens:Evidence for species-species transfer in evolution of pathogenic determinants of Escherichia coli and Vibrio cholerae 01.In:Advances" KTK Scientific Publishers, 195-212 (1988)
[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.,;Kimura,M.: "Statistical method for estimating sequence divergence. In:Methods in Enzymology." Academic Press,Inc.,
[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.: "Molecular phylogeny of AIDS viruses and its application to vaccine development. In:Population Biology of Genes and Molecules" Baifu-kan/Cambridge Univ.Press.,

1988 Fiscal Year Annual Research Report

RNAウイルス遺伝子の分子進化学的研究

Principal Investigator

五條堀 孝 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教授 (50162136)

Research Products

[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.,;Yokoyama,S.: IV International Conference on Aids.Book 1. 142 (1988)

[Publications] Yokoyama,S.,;Chung,L.,;Gojobori,T.: Mol.Biol.Evol.5(3). 237-251 (1988)

[Publications] Hayakawa,K.,;Horai,S.,;Gojobori,T.,et al.: Mol.Biol.Evol.5(3). 270-281 (1988)

[Publications] Aota,S.,;Gojobori,T.,;Ikemura,T.,et al.: Nuel.Acids.Res.16. r315-r402 (1988)

[Publications] Harihara,S.,;Gojobori,T.,;Omoto,K.,et al: Amer.J.Hum.Genet.43. 134-143 (1988)

[Publications] Hayasaka,K.,;Gojobori,T.,;Horai,S.: Mol.Biol.Evol.5(3). 626-644 (1988)

[Publications] Shimizu,N.,;Gojobori,T.,et al.: FEBS Lett.

[Publications] Moriyama,E.N.,;Gojobori,T.: J.Mol.Evol.

[Publications] Yamato,T.,;Gojobori,T.,et al.: "Discontinuous evolution of bacterial pathogens:Evidence for species-species transfer in evolution of pathogenic determinants of Escherichia coli and Vibrio cholerae 01.In:Advances" KTK Scientific Publishers, 195-212 (1988)

[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.,;Kimura,M.: "Statistical method for estimating sequence divergence. In:Methods in Enzymology." Academic Press,Inc.,

[Publications] Gojobori,T.,;Moriyama,E.N.: "Molecular phylogeny of AIDS viruses and its application to vaccine development. In:Population Biology of Genes and Molecules" Baifu-kan/Cambridge Univ.Press.,

五條堀孝国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教授 (50162136)