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2016 Fiscal Year Annual Research Report

選択標識による宿主とウイルスの蛋白質間相互作用の構造基盤の解明とその阻害剤の探索

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular basis of host cell competency in virus infection
Project/Area Number 15H01256
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

片平 正人  京都大学, エネルギー理工学研究所, 教授 (70211844)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
KeywordsVif / APOBEC3 / リアルタイムNMR / CBFβ
Outline of Annual Research Achievements

ヒトのAPOBEC3Gタンパク質(A3G)は、DNAのシトシン塩基(C)を脱アミノ化してウラシル塩基(U)に変換する。これによりA3Gは、抗HIV活性を発揮する。しかしHIVのVifタンパク質はA3Gをユビキチン化しプロテアソームにおける分解に導く事で、A3Gの活性を阻害する。さらにVifはA3GとDNAの相互作用を阻害する事によっても、A3Gの活性を阻害する事が提唱されている。そこで我々は、Vif, CBFβ, EloB, EloC及びCul5の5つのタンパク質の複合体を調製し、このVif 5者複合体によるA3Gの脱アミノ化反応の阻害を、リアルタイムNMR法によって検証した。その結果、Vif 5者複合体による阻害効果が認められた。標的配列がかなり過剰な条件下にもかかわらず阻害効果が見られた事から、Vif 5者複合体は、A3Gと直接相互作用する事によって阻害を引き起こす事が示唆された。
ヒトのAPOBEC3Bタンパク質(A3B)は、A3Gと同様な脱アミノ化活性を有している。A3Bによって生じたヒトDNAの変異は、癌を引き起こす。我々はこれまでNMRシグナルを用いる事で、A3Gの塩基変換反応をリアルタイムでモニタリングし、酵素の挙動に関する新しい知見を得てきた。今回同法をA3Bに適用した。その結果A3Bは、短いDNA中の標的配列ほど高効率で脱アミノ化する事が分かった。これは、A3Gが長いDNA中の標的配列を高効率で脱アミノ化する事と、全く逆の挙動である。またA3Bは、DNA鎖の中央付近に配置された標的配列を、最も高効率で脱アミノ化する事が分かった。これは、A3Gが5'端近くに配置された標的配列ほど高効率で脱アミノ化する事と、全く異なる挙動である。A3BはA3Gに比べて、DNAへの親和性が低い。この事に基づいて、上述のA3Bの特性を合理的に説明するモデルを構築した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution2016

    • Author(s)
      Okamura, H., Nishimura, H., Nagata, T., Kigawa, T., Watanabe, T. and Katahira M.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 6 Pages: 21742

    • DOI

      10.1038/srep21742

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Characterization of the deamination coupled with sliding along DNA of anti-HIV factor APOBEC3G on the basis of the pH-dependence of deamination revealed by real-time NMR monitoring2016

    • Author(s)
      Kamba, K., Nagata, T. and Katahira, M.
    • Journal Title

      Front. Microbiol.

      Volume: 7 Pages: 587

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.00587

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G2017

    • Author(s)
      Wan, L., Nagata, T., Morishita, R., Takaori-Kondo, A. and Katahira, M.
    • Organizer
      The 7th Asia-Pacific NMR Symposium
    • Place of Presentation
      Bangalore (インド)
    • Year and Date
      2017-02-16 – 2017-02-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Real-time monitoring of APOBEC3G activity by NMR2016

    • Author(s)
      Katahira, M.
    • Organizer
      The 2nd International Symposium on Molecular Basis of Virus-Host Interactions
    • Place of Presentation
      ACU(札幌)
    • Year and Date
      2016-10-22 – 2016-10-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse compounds, and real-time monitoring of enzymatic reaction2016

    • Author(s)
      Okamura, H., Kamba, K., Nishimura, H., Kigawa, T., Watanabe, T., Nagata, T. and Katahira, M.
    • Organizer
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      2016-08-21 – 2016-08-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Deamination mechanism coupled with sliding along single-stranded DNA of anti-HIV factor APOBEC3G as investigated by real-time NMR spectroscopy2016

    • Author(s)
      Kamba, K., Nagata, T. and Katahira M.
    • Organizer
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      2016-08-21 – 2016-08-26
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 片平研究室

    • URL

      http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/bio/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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