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2016 Fiscal Year Annual Research Report

リボソームとトランスロコンの協調による新生鎖の膜組み込み機構の解明

Publicly Offered Research

Project AreaNascent-chain Biology
Project/Area Number 15H01541
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

阪口 雅郎  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (30205736)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Keywordsシグナル配列 / トランスロコン / 膜タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

真核細胞内で、リボソームから伸長する新生鎖のオルガネラ局在化前の存在状況や存在時間を知ることを目的に、SFVのカプシドプロテアーゼドメイン(CP)を使った新規プローブを開発した。CPドメインはリボソームのトンネル出口から全長が出た段階で、後続のポリペプチド鎖の合成状態に関わらず、CPドメイン直後のペプチド結合を切断する。CP-EGFP融合タンパク質を、ミトコンドリアに輸入させると、50%以上のポリペプチド鎖が細胞質でフォールドし、後方のレポータードメイン(EGFP)を細胞質に残した。一方、動物細胞小胞体のタンパク質輸入に適応すると、合成されたすべてのレポーターは小胞体内腔に達し、細胞質に残るものはなかった。合成に共役した小胞体での膜透過ではCP-ドメインは膜透過以前にはフォールドしないことが判明した。この実験系では、CPが切り離したEGFPドメインは前半の配列によって影響を受けないため、任意の人工配列を導入したモデルタンパク質の振る舞いを容易に調べることができる。これで、任意の疎水性度の配列の透過程度、正荷電配列の透過、その他配列の組み合わせなどの任意配列の、生きている細胞での挙動を、定量的に調べることが可能となった。さらに、この系を出芽酵母系に適応することによって、CP-ドメインのタンパク質合成共役型の透過現象を定量的に評価可能となった。疎水性度が低めのシグナル配列では合成後の膜透過が進行し、疎水性度が高くなるにつれて、合成共役型の透過機構へと透過様式がスイッチすることを示した。さらに興味深いことに、これまで翻訳後の膜透過に関わるとされ、それが教科書にも記されているSEC71, SEC72について、合成共役型膜透過に関わることを見出した。これを駆使して、タンパク質新生鎖の膜透過や膜組み込みに関わる因子群の特性解析を網羅的に実行できる道が開けた。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Stability and flexibility of marginally hydrophobic segments stalling at the endoplasmic reticulum translocon2016

    • Author(s)
      Kida, Y., Ishihara, Y., Fujita, H., Onishi, Y. and Sakaguchi, M.
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 27 Pages: 930-940

    • DOI

      10.1091/mbc.E15-09-0672

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The N-terminal motif of PMP70 suppresses cotranslational targeting to the endoplasmic reticulum2016

    • Author(s)
      Sakaue, H., Iwashita, S., Yamashita, Y., Kida, Y., Sakaguchi, M.
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 159 Pages: 539-551

    • DOI

      10.1093/jb/mvv132

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Capsid protease domain as a tool for assessing protein-domain folding during organelle import of nascent polypeptides in living cells2016

    • Author(s)
      Kang, K., Takahara, M., Sakaue, H., Sakaguchi, M.
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 159 Pages: 497-508

    • DOI

      10.1093/jb/mvv129

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Identification of cis-acting signals required for the apical tergeting of ABCC72016

    • Author(s)
      衣斐義一、阪口雅郎
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス・仙台国際センター
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンでの新生鎖認識へのリボソームの関与について2016

    • Author(s)
      木田祐一郎, 高橋千恵, 大西由希子, 阪口雅郎
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス・仙台国際センター
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
  • [Presentation] The N-terminal motif of PMP70 suppresses cotranslational targeting to the endoplasmic reticulum2016

    • Author(s)
      Haruka Sakaue, Shohei Iwashita, Yukari Yamashita, Yuichiro Kida, and Masao Sakaguchi
    • Organizer
      Nascent Chain Biology Meeting 2016
    • Place of Presentation
      富士レークホテル(山梨県南都留郡)
    • Year and Date
      2016-09-01 – 2016-09-03
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Recognition of nascent chain at the endoplasmic reticulum translocon is affected by the ribosome2016

    • Author(s)
      Yuichiro kida, Chie Takahashi, Yukiko Onishi and Masao Sakaguchi
    • Organizer
      Nascent Chain Biology Meeting 2016
    • Place of Presentation
      富士レークホテル(山梨県南都留郡)
    • Year and Date
      2016-09-01 – 2016-09-03
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 出芽酵母におけるシグナルペプチド作用および膜透過様式とSEC71/72との関連2016

    • Author(s)
      菅 公秀, 十倉麻友子, 吉久 徹, 阪口雅郎
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都市)
    • Year and Date
      2016-06-15 – 2016-06-17
  • [Presentation] 出芽酵母小胞体トランスロコンへの標的化様式のシグナル配列による変化について2016

    • Author(s)
      十倉麻友子, 菅 公秀, 阪上春花, 吉久 徹, 阪口雅郎
    • Organizer
      第68回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都市)
    • Year and Date
      2016-06-15 – 2016-06-17
  • [Presentation] 小胞体トランスロコンによる“低”疎水性配列の膜内保持機構2016

    • Author(s)
      木田祐一郎, 石原裕大, 藤田英伸, 大西由希子, 阪口雅郎
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-07 – 2016-06-09

URL: 

Published: 2018-01-16  

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