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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanism of the clustering-dispersion dynamics coupled to the channel gating.

Publicly Offered Research

Project AreaDynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions
Project/Area Number 16H00759
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

老木 成稔  福井大学, 学術研究院医学系部門, 教授 (10185176)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywordsイオンチャネル / 脂質二重膜 / in vitro転写翻訳 / チャネル形成毒素 / コレステロール
Outline of Annual Research Achievements

チャネルの動態を一分子レベルで明らかにするために、脂質平面膜にチャネルを再構成し、チャネル機能と構造変化、さらに膜内での離合集散状態を原子間力顕微鏡によってとらえることが目的である。
まず技術的に向きを揃えてチャネルを膜に組み込むことに成功した。原子間力顕微鏡でチャネルの細胞外表面構造を明らかにしただけでなく、この面に特異的に結合するペプチド毒を作用させ、その結合を捉えることでチャネルの向きを証明した。集合・離散に関しては向きをそろえた場合にも起こることを確認することができた。この方法を元に、膜組成を変えたときにチャネルの集合・離散がどう変化するか、を系統的に実験し、リン脂質組成で集合状態が大きく変わることを明らかにした。原子間力顕微鏡による実験は高速測定も含めさらに精度が上がった。
一方、チャネル機能に関しては新しく開発した液滴接触2重膜法によって、膜の脂質組成を急速に変化させることに成功した。この方法により脂質2重膜に急速にコレステロールを加えるとKcsAカリウムチャネルは直ちにその活性を消失した。しかしコレステロールの注入を止めると、チャネル機能は短時間で回復した。このような可逆的なチャネル機能制御が明らかになったのは初めてである。
他のリン脂質組成では脂質2重膜を形成できないことがあった。これは当該リン脂質の相転移温度が室温より高いからである。このような場合、チェンバーの温度を急速に上げることで脂質2重膜が形成された。十分高い温度になればどんなリン脂質組成でも脂質2重膜が形成できることになり、実験の多様性が広がった

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

  • [Journal Article] Concurrent In Vitro Synthesis and Functional Detection of Nascent Activity of the KcsA Channel under a Membrane Potential2018

    • Author(s)
      Iwamoto Masayuki、Elfaramawy Maie A.、Yamatake Mariko、Matsuura Tomoaki、Oiki Shigetoshi
    • Journal Title

      ACS Synthetic Biology

      Volume: 7 Pages: 1004~1011

    • DOI

      10.1021/acssynbio.7b00454

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure and dynamics of solvent molecules inside the polytheonamide B channel in different environments: a molecular dynamics study2018

    • Author(s)
      Kalathingal Mahroof、Sumikama Takashi、Mori Toshifumi、Oiki Shigetoshi、Saito Shinji
    • Journal Title

      Physical Chemistry Chemical Physics

      Volume: 20 Pages: 3334~3348

    • DOI

      10.1039/C7CP06299K

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Channel-Membrane Interplay in Lipid Bilayer Membranes Manipulated through Monolayer Technologies2018

    • Author(s)
      Shigetoshi Oiki, Masayuki Iwamoto
    • Journal Title

      Biological & Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 58 Pages: 303~311

    • DOI

      10.1248/bpb.b17-00708

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] チャネルの入口がイオンの透過速度を決める2018

    • Author(s)
      炭竈 享司、老木 成稔
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 58 Pages: 012~016

    • DOI

      10.2142/biophys.58.012

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Channel Formation and Membrane Deformation via Sterol-Aided Polymorphism of Amphidinol 32017

    • Author(s)
      Iwamoto Masayuki、Sumino Ayumi、Shimada Eri、Kinoshita Masanao、Matsumori Nobuaki、Oiki Shigetoshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 10782

    • DOI

      10.1038/s41598-017-11135-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Membrane Perfusion of Hydrophobic Substances Around Channels Embedded in the Contact Bubble Bilayer2017

    • Author(s)
      Iwamoto Masayuki、Oiki Shigetoshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 6857

    • DOI

      10.1038/s41598-017-07048-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Oriented Reconstitution of the Full-Length KcsA Potassium Channel in a Lipid Bilayer for AFM Imaging2017

    • Author(s)
      Sumino Ayumi、Uchihashi Takayuki、Oiki Shigetoshi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 8 Pages: 785~793

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.6b03058

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 生物物理学会における多様性2017

    • Author(s)
      中村 春木
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 57 Pages: 001~001

    • DOI

      10.2142/biophys.57.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] コレステロールがKcsAカリウムチャネル機能に及ぼす影響(Effects of cholesterol on the function of the KcsA potassium channel)2017

    • Author(s)
      岩本真幸、老木成稔
    • Organizer
      第94回日本生理学会大会(アクトシティ浜松、浜松)
  • [Presentation] 脂質二重膜がカリウムチャネル開閉に及ぼす多様な影響(Specific and non-specific actions of membrane lipids on the gating of the potassium channel)2017

    • Author(s)
      岩本真幸、老木成稔
    • Organizer
      日本生物物理学会第55回年会(熊本大学、熊本)シンポジウム「いろんなスケールで働く膜タンパク質の作動原理:実験と理論の新展開(Operating principles of membrane proteins at multiscale resolutions)」
  • [Presentation] KcsAカリウムチャネル膜相と作用のための一分子実験法2017

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      蛋白研セミナー(招待講演)
  • [Presentation] Ion Permeation and Gating of the KcsA Potassium Channel Reconstituted in the Manipulated Membrane.2017

    • Author(s)
      Oiki,S.
    • Organizer
      Ion Channel Modulation Symposium,Cambridge,UK (招待講演) (国際学会)
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 接触液胞2重膜法による膜物性変化の実時間測定法2017

    • Inventor(s)
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Holder
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-246976号
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 脂質二重膜形成装置、脂質二重膜形成方法、および評価システム2017

    • Inventor(s)
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Holder
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-063796号
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 脂質二重膜形成器2017

    • Inventor(s)
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Holder
      老木 成稔・岩本真幸
    • Industrial Property Rights Type
      意匠
    • Industrial Property Number
      意願2017-006362号

URL: 

Published: 2018-12-17  

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