2016 Fiscal Year Annual Research Report
植物の発生を支えるmicroRNAネットワークの解明
Publicly Offered Research
| Project Area | Multidimensional Exploration of Logics of Plant Development |
|---|
| Project/Area Number |
16H01229
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
濱田 隆宏 東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (20452534)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | microRNA / ゼニゴケ / シロイヌナズナ / tudor |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
平成２８年度のゼニゴケmicroRNA研究では、CRISPR/Cas9技術により作出したmicroRNA変異体のうち、主に通常の分化過程では起こらない「葉状体が生殖器様に分化する表現型」を示したmicroRNA欠失変異体に注目し、その詳細な解析を行った。その結果、ゼニゴケのmicroRNAと標的遺伝子の関係性は、維管束植物の栄養成長期から生殖成長期への転換に関わるmicroRNAと標的遺伝子ファミリーの関係性と類似していた。この結果より、過去の報告（Cho et al. 2012 Plant Cell）により示唆されていたコケ植物独特のmicroRNAと標的遺伝子ファミリーの関係性のみでなく、陸上植物全体で進化的に保存された経路が存在することが明確に示された。
平成２８年度のシロイヌナズナTARPタンパク質に関する研究では、tarp欠失変異体におけるsmall RNAシーケンスの結果を詳細に解析した。その結果、tarp欠失変異体で減少したトランスポゾンを標的とするsmall RNA の大半は、セントロメア周辺領域のトランスポゾンではなく、多くのタンパク質をコードする遺伝子間領域のトランスポゾンを標的としていることが示唆された。この結果を基にすることで、これまでに示されていたtarp欠失変異体の個体レベル・遺伝子発現レベルの多様な表現型を解釈することが可能となった。そのため、今年度の発見は、今後の更なる研究の発展へ向けた重要な礎になると思われる。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
ゼニゴケmicroRNA及びシロイヌナズナTARP研究において、一定の結論が得られ、論文として発表できる目処がたっている。さらに今年度の研究の準備が着実に進行しているため、さらなる成果が得られることが期待される。
|
| Strategy for Future Research Activity |
ゼニゴケに関しては、別のmicroRNA変異体では「杯状体および無性芽が欠如する表現型」を示しており、今年度はこのmicroRNA欠失変異体の解析を本格化させる。具体的には、変異体と野生型を用いた詳細なトランスクリプトーム解析を行い、ターゲットRNAの同定及びその下流で制御され得る遺伝子の同定を行う。
シロイヌナズナに関しては、これまでの成果を論文として発表するために必要な実験を行う。また更なるTARPの機能解析として、TARPがどのようなクロマチン領域に局在し機能しているかを明らかにするために、TARPとヒストンの相互作用解析及びChIP解析を行う。
|
