2017 Fiscal Year Annual Research Report
ヌクレオソームの多様な構造を解析する技術の開発
Publicly Offered Research
| Project Area | Dynamic chromatin structure and function |
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| Project/Area Number |
16H01316
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| Research Institution | Meisei University |
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Principal Investigator |
香川 亘 明星大学, 理工学部, 准教授 (70415123)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | ヌクレオソーム / X線結晶構造解析 / DNA配列 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
真核生物のゲノムDNAは，クロマチンと呼ばれる高度に凝縮した構造体を形成して細胞核の中に収まっている。クロマチンの構造変化は，生命活動の維持に極めて重要であり，DNA複製，転写，修復，組換えなどのDNA代謝に応じてクロマチン構造がほどけたり，凝縮したりする。クロマチンの構造変化を理解するためには，クロマチンの基本単位であるヌクレオソームにおける構造変化の詳細を明らかにすることが重要だが，クロマチンダイナミクスの理解に必要な構造基盤はよく分かっていない。本研究では，多様なヌクレオソーム構造やヌクレオソームとその結合因子との複合体の構造を，X線結晶構造解析法を用いて明らかにするために必要な技術の開発を行った。
我々は，まず多様なヌクレオソーム構造を決定する際に問題となることが予想される位相決定の方法に着目した。位相決定はX線結晶構造解析において必要不可欠なステップであるが，ヌクレオソーム内でヒストンやDNAの配置が既知のヌクレオソームのそれと異なる場合，従来用いられてきた分子置換法による位相決定は困難であることが予想される。本研究ではヒトのヒストンH3，H2AおよびH2Bに合計12個のセレノメチオニンを導入し，セレン原子から得られる位相情報をもとにカノニカルヌクレオソームのX線結晶構造解析に成功した。さらに，様々な塩基配列を含むヌクレオソームを比較的簡便に大量調製する方法を検討した。そのボトルネックとなっているDNAの調製方法として，オリゴDNAを用いたOne-Pot反応を確立した。この方法を用い，繰り返し配列を持つDNAを含むヌクレオソームの再構成を行った。また，ヌクレオソームとその結合因子との複合体として，相同組換えで働くクロマチンリモデリング因子Rad54とヌクレオソームとの複合体の大量調製を行った。今後これらのヌクレオソームについてX線結晶構造解析を行う予定である。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Novel function of HATs and HDACs in homologous recombination through acetylation of human RAD52 at double-strand break sites.2018
Author(s)
Yasuda T, Kagawa W, Ogi T, Kato TA, Suzuki T, Dohmae N, Takizawa K, Nakazawa Y, Genet MD, Saotome M, Hama M, Konishi T, Nakajima NI, Hazawa M, Tomita M, Koike M, Noshiro K, Tomiyama K, Obara C, Gotoh T, Ui A, Fujimori A, Nakayama F, Hanaoka F, Sugasawa K, Okayasu R, Jeggo PA, Tajima K.
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Journal Title
PLoS Genet.
Volume: 14
Pages: e1007277
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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