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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Development of improved ZIP tag-probe system for fluorescent imaging of protein synthesis in cells

Publicly Offered Research

Project AreaResonance Biology for Innovative Bioimaging
Project/Area Number 16H01420
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

野村 渉  東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 准教授 (80463909)

Project Period (FY) 2016-06-30 – 2018-03-31
Keywords蛍光イメージング / ゲノム編集 / CRISPR-Cas9 / 分子進化 / タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

生体高分子や代謝産物などを標的とした蛍光イメージングは非侵襲的に細胞や個体を観察可能なことから,それまで明らかでなかった細胞内イベントを解明することに役立っている。ゲノム編集技術は主にゲノム上の標的配列を特異的に切断するヌクレアーゼの作用によって修復時に変異が導入され,タンパク質のノックアウトに利用される。ここ数年でのCRISPR-Cas9の開発によって従来と比較して研究期間の大幅な短縮が実現されている。また,ゲノム上でのタンパク質配列の改変などこれまでとは異なる利用方法の実現が望まれている。本研究ではゲノム上の標的タンパク質遺伝子にタグ遺伝子を導入して,恒常的なタンパク質発現という条件下での観察手法を開発する。そのために,蛍光イメージング法とゲノム編集技術を組み合わせた,より高精度なタンパク質挙動観察の手法を確立する。これまでに開発してきたタグ-プローブシステムはタンパク質に遺伝子工学的に導入することができ,タグ-プローブペアの会合とほぼ同時に蛍光の増大が見られる。この特長を利用してタンパク質蛍光イメージングの問題点を克服するシステムを構築する。本年度は従来タグ配列として用いてきた二本鎖へリックスに環境応答性蛍光基NBDを導入し,より低分子量の1本鎖へリックスをタグ配列とするシステムの可能性を検討した。タグペプチドによる標的タンパク質機能への影響を抑制するためである。このシステムにおいてもストップトフローを利用した測定によって1秒以内での蛍光増大が確認され,細胞内にタグ融合型タンパク質を発現させた場合,プローブの導入によってタンパク質の局在解析が可能であることが示唆された。今回は核内に局在するヒストンタンパク質H2Bを対象としたが,細胞内,細胞膜表面などで発現するどのようなタンパク質にも利用できると期待できる。また,ゲノム上へのタグ組込みの可能性を引き続き検討する。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Synthesis of a Chloroalkene Dipeptide Isostere-Containing Peptidomimetic and Its Biological Application2018

    • Author(s)
      Takuya Kobayakawa, Yudai Matsuzaki, Kentaro Hozumi, Wataru Nomura, Motoyoshi Nomizu, Hirokazu Tamamura
    • Journal Title

      ACS Med. Chem. Lett.

      Volume: 9 Pages: 6-10

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.7b00234

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNAメチル化制御から精密エピゲノム編集へ2017

    • Author(s)
      野村 渉
    • Journal Title

      MEDCHEM NEWS

      Volume: 27 Pages: 200-207

  • [Journal Article] 生体分子間相互作用を基盤とする機能分子の創製とケミカルバイオロジーへの展開2017

    • Author(s)
      野村 渉
    • Journal Title

      Yakugaku Zasshi

      Volume: 137 Pages: 1223-1231

    • DOI

      10.1248/yakushi.17-00125

    • Open Access
  • [Journal Article] Synthesis and Evaluation of Dimeric Derivatives of Diacylglycerol-lactones as PKC Ligands2017

    • Author(s)
      Nami Ohashi, Ryosuke Kobayashi, Wataru Nomura, Takuya Kobayakawa, Agnes Czikora, Brienna Herold, Nancy E. Lewin, Peter M. Blumberg, Hirokazu Tamamura
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem.

      Volume: 28 Pages: 2135-2144

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.7b00299

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Distinct chemically inducible system for orthogonal differential regulation of endogenous genes2018

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Takuya Kobayakawa, Taisuke Sugii, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Keystone Symposia Conference A2: Precision Genome Engineering
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genome editing with a FokI-based chemically inducible nuclease system2018

    • Author(s)
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Keystone Symposia Conference A2: Precision Genome Engineering
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Orthogonal differential regulation of endogenous genes by distinct chemically inducible systems2018

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Takuya Kobayakawa, Taisuke Sugii, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      武田薬科学シンポジウム
  • [Presentation] Development of tools for the modification, regulation, and molecular imaging of gene and epigenetic functions2018

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      NCU Global Young Investigator Forum 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 標的タンパク質の動きをみるペプチド性蛍光イメージングツール2018

    • Author(s)
      野村渉 ,神村拓美 ,森あつみ ,小早川拓也 ,玉村啓和
    • Organizer
      日本薬学会第 138年会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] FokIを DNA切断ドメインとして用いた化合物誘導型配列特異的ヌクレアーゼの開発2017

    • Author(s)
      松本大亮 ,野村 渉 ,杉井太亮 ,玉村啓和
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第 12回年会
  • [Presentation] Development of chemical-inducible artificial transcription factors based on sequence-specific DNA binders2017

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Tsukasa Hashimoto, Taisuke Sugii, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      The 254th ACS National Meeting and Exposition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 生体分子間相互作用を制御する機能性ペプチド/タンパク質の設計と応用2017

    • Author(s)
      野村 渉
    • Organizer
      熊本大学先端科学研究部セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Development of genome editing and gene regulation systems utilizing specific DNA binding domains2017

    • Author(s)
      Wataru Nomura
    • Organizer
      熊本大学 HIGO program seminar
    • Invited
  • [Presentation] Differential regulation of endogenous genes in an orthogonal manner by distinct chemically inducible systems2017

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Takuya Kobayakawa, Taisuke Sugii, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      International Conference on Epigenetics and Bioengineering
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 東京医科歯科大学生体材料工学研究所メディシナルケミストリー分野ホームページ

    • URL

      http://tamamura-tmd.sakura.ne.jp/members/teachers/nomura/

URL: 

Published: 2018-12-17  

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