2018 Fiscal Year Annual Research Report
A population genetic study of subsistence and cultural/behavioral styles of Hill tribes in Thailand
Publicly Offered Research
| Project Area | Cultural history of PaleoAsia -Integrative research on the formative processes of modern human cultures in Asia |
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| Project/Area Number |
17H05132
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| Research Institution | Kitasato University |
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Principal Investigator |
太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | sex-biased migration / 少数民族 / 古人骨 / ゲノム網羅的SNP解析 / 古人骨DNA / 古代ゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【研究の目的】出アフリカ以降、現生人類は５～7 万年という短かい期間で、世界各地の様々な環境に適応しながら拡散したので、その環境適応は生業形態や文化・行動様式の変化がゲノムの変化より先行した。今回の研究計画では東南アジアの少数民族および古人骨のゲノム解析を実施することにより、生業形態および文化・行動様式が常染色体を含めたゲノムに与える影響を明らかにする。
【研究計画の実施状況】①東南アジア出土古人骨（25検体）と愛知県渥美半島・伊川津貝塚遺跡出土古人骨（IK002）のゲノム配列にもとづく比較解析を行った。その結果、ホアビニアン文化をもっていた東南アジア出土古人骨とIK002の間で高い近縁性が示された。②現在タイ王国に住んでいる焼畑農耕を行っている山岳民族5民族6集団［アカ族、リス族（メイホンソン県）、リス族（チェンライ県）（以上、夫方居住）；カヤー族（赤カレン）、カレン族（白カレン）、ラフ族（以上、妻方居住）］に加え、狩猟採取を行っている2民族（ムラブリ、マニ）の計7民族8集団192人について、白血球由来のDNAを用い、Infinium Global Screening Array（Illumina社）によって、約60万SNPのタイピングを行い、集団遺伝学的解析を行った。その結果、焼き畑農耕民は狩猟採集民よりは有効集団サイズ（Ne）が大きいものの、大規模農耕を行う集団や都市部の人々よりNeが小さい傾向が示された。③アゼルバイジャンから出土したホモ・サピエンスの骨試料からのDNA抽出し、次世代シークエンサー（NGS）ライブラリーを作製、イルミナ社MiSeqでシークエンスを行った。その結果、mtDNAハプログループはIと推定された。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] A new targeted capture method using bacterial artificial chromosome (BAC) libraries as baits for sequencing relatively large genes2018
Author(s)
K. Koganebuchi, T. Gakuhari, H. Takeshima, K. Sato, K. Fujii, T. Kumabe, S. Kasagi, T. Sato, A. Tajima, H. Shibata, M. Ogawa, H. Oota
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Journal Title
PLOS ONE
Volume: 13(7)
Pages: e0200170
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Yonda, H. Ishida, Y. Yamada, H. Shibata, S. Nakagome, E. Willerslev, H. Oota Whole genome analysis of the Jomon remain reveals deep lineage of East Eurasian populations2018
Author(s)
T. Gakuhari, M. Sikora, S. Rasmussen, M. Allentoft, T. Sato, T. Kornrliussen, M. Yonda, H. Ishida, Y. Yamada, H. Shibata, S. Nakagome, E. Willerslev, H. Oota
Organizer
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Complex human histories of Northeast Asia revealed by correlaions between genes, language, and music2018
Author(s)
H. Matsumae, P.E. Savage, B. Bickel, T.E. Currie, T. Sato, A. Tajima, M. Stoneking, K.K. Shimizu, M. Gillan, S. Brown, H. Oota
Organizer
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
Int'l Joint Research
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[Presentation] Human population history in the southwestern coastal region of Sea of Okhotsk, inferred from ancient genome analysis2018
Author(s)
T. Sato, N. Adachi, R. Kimura, M. Yoneda, H. Oota, A. Tajima, A. Toyoda, H. Matsumae, K. Koganebuchi, K.K. Shimizu, T. Hanihara, A. Weber, H. Kato, H. Ishida
Organizer
The Society for Molecular Biology and Evolution, Annual Meeting
Int'l Joint Research
