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2018 Fiscal Year Annual Research Report

ミジンコの性決定を制御する長鎖ノンコーディングRNAの作動装置の解明

Publicly Offered Research

Project AreaNeo-taxonomy of noncoding RNAs
Project/Area Number 17H05602
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

加藤 泰彦  大阪大学, 工学研究科, 講師 (60415932)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywords長鎖ノンコーディングRNA / 性決定 / ミジンコ / ダブルセックス遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

長鎖ノンコーディング RNA (lncRNA) は、無脊椎動物から脊椎動物まで存在し、少なく見積もってもその数は数千から万のオーダーにのぼる。しかしながら、機能解析が行われた lncRNA は未だ多くなく、中でもタンパク質をコードする遺伝子と同じ向きでオーバラップして転写される lncRNA の解析は、特に遅れている。我々はに甲殻類オオミジンコにおけるオス決定遺伝子 Dsx1 の転写後制御機構を解析している過程で、予想外に Dsx1 5´ UTR のみをコードする RNA を卵に注入するとオス化が生じることを発見した。この発見がきっかけとなり、Dsx1 の上流から同じ向きで転写され Dsx1 5´ UTR の配列を含む lncRNA、DAPALR (Dsx1 Alpha Promoter Associated Long RNA) がオス特異的に発現し、これが Dsx1 を活性化しオス化を誘導することを見出した。また、DAPALR は Dsx1 をトランスに活性化することが可能であり、Dsx1 活性化に必要な作動エレメントは Dsx1 の 5´ UTR と重なる 205 塩基の中に存在することを明らかにした。そして、DAPALR の作用機構を明らかにするために、作動エレメントに結合する タンパク質を複数同定した。平成30年度は、これらのタンパク質が結合する配列の候補が作動エレメント中に存在することを見出した。候補因子をコードする遺伝子のノックダウン、過剰発現解析を行うことで、これらの因子が翻訳レベルでDsx1の発現を制御していることを示唆する結果を複数得た。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (19 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Atrazine exposed phytoplankton causes the production of non-viable offspring on Daphnia magna2019

    • Author(s)
      Religia Pijar、Kato Yasuhiko、Fukushima Ery Odette、Matsuura Tomoaki、Muranaka Toshiya、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      Marine Environmental Research

      Volume: 145 Pages: 177~183

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2019.02.007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A 5′ UTR-Overlapping LncRNA Activates the Male-Determining Gene doublesex1 in the Crustacean Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Kato Yasuhiko、Perez Christelle Alexa G.、Mohamad Ishak Nur Syafiqah、Nong Quang D.、Sudo Yuumi、Matsuura Tomoaki、Wada Tadashi、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 28 Pages: 1811~1817.e4

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.cub.2018.04.029

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic integration and ligand-dependent activation of the human estrogen receptor α in the crustacean Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Toerner Kerstin、Nakanishi Tsuyoshi、Matsuura Tomoaki、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 13 Pages: e0198023

    • DOI

      https://doi.org/10.1371/journal.pone.0198023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Monitoring ecdysteroid activities using genetically encoded reporter gene in Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Adhitama Nikko、Matsuura Tomoaki、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      Marine Environmental Research

      Volume: 140 Pages: 375~381

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2018.07.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantitative analysis of cell-free synthesized membrane proteins at the stabilized droplet interface bilayer2018

    • Author(s)
      Elfaramawy Maie A.、Fujii Satoshi、Uyeda Atsuko、Osaki Toshihisa、Takeuchi Shoji、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime、Matsuura Tomoaki
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 54 Pages: 12226~12229

    • DOI

      https://doi.org/10.1039/C8CC06804F

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Generation of white-eyed Daphnia magna mutants lacking scarlet function2018

    • Author(s)
      Ismail Nur Izzatur Binti、Kato Yasuhiko、Matsuura Tomoaki、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 13 Pages: e0205609

    • DOI

      https://doi.org/10.1371/journal.pone.0205609

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 作り出したものは安全ですか?2018

    • Author(s)
      加藤泰彦、渡邉肇
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 96 Pages: 342~345

  • [Presentation] A 5´ UTR-overlapping LncRNA Activates the Male-determining Gene doublesex1 in the Crustacean Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Yasuhiko Kato, Christelle Alexa G. Pelez, Nur Syafiqah Mohamad Ishak, Quang D. Nong, Tomoaki Matsuura, Tadashi Wada, Hajime Watanabe
    • Organizer
      第 20 回 日本 RNA 学会年会
  • [Presentation] Monitoring of chemical and metal contaminants using engineered Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Yasuhiko Kato, Hajime Watanabe
    • Organizer
      Second Interdisciplinary and Research Alumni Symposium iJaDe2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オオミジンコにおける内分泌かく乱物質検出のためのGAL4/UASシステムの確立2018

    • Author(s)
      加藤泰彦、山崎勇人、松浦友亮、渡邉肇
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
  • [Presentation] Visualization of ecdysteroid activities using genetically encoded reporter gene in Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Nikko Adhitama, Yasuhiko Kato, Tomoaki Matsuura, Hajime Watanabe
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
  • [Presentation] オオミジンコの遺伝子操作法の開発と応用2018

    • Author(s)
      加藤泰彦、志賀靖弘、時下進一、山形秀夫、渡邉肇
    • Organizer
      東京薬科大学生命科学部25周年記念シンポジウム
  • [Presentation] 環境応答により雌雄を産み分けるミジンコの性スペクトラム2018

    • Author(s)
      Yasuhiko Kato、Christelle Alexa G. Perez、Quang D. Nong、Hajime Watanabe
    • Organizer
      新学術領域研究 性スペクトラム 第二回 領域班会議
  • [Presentation] A 5 ' UTR-Overlapping LncRNA Activates the Male- Determining Gene doublesex1 in the Crustacean Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Yasuhiko Kato、Christelle Alexa G. Perez、Quang D. Nong、Hajime Watanabe
    • Organizer
      JAJ RNA 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] オオミジンコにおけるHSP70プロモーターを利用した熱誘導型遺伝子発現系の開発2018

    • Author(s)
      加藤泰彦、清水里奈、渡邉肇
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 環境応答により雌雄を産み分けるミジンコの性スペクトラム2018

    • Author(s)
      加藤泰彦、Quang Dang Nong、渡邉肇
    • Organizer
      「先進ゲノム支援」2018年度拡大班会議
  • [Presentation] Alterations in the activity of the sex determination factor dsx1 resulted in different intersex phenotypes in Daphnia magna2018

    • Author(s)
      Quang Dang Nong , Yasuhiko Kato , Hajime Watanabe
    • Organizer
      「先進ゲノム支援」2018年度拡大班会議
  • [Presentation] Possibility of chemical communication among Daphnia individuals for reproductive strategy2018

    • Author(s)
      Yasuhiko Kato, Hajime Watanabe
    • Organizer
      Frontier Research on Chemical Communications (ISCC2019)
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] RNAが操るミジンコの性決定

    • URL

      https://resou.osaka-u.ac.jp/ja/research/2018/20180525_1

URL: 

Published: 2021-01-27  

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