2017 Fiscal Year Annual Research Report
造血幹細胞の機能維持を司るリボソーム生合成経路の検証
Publicly Offered Research
| Project Area | Establishing a new paradigm of the pathogenesis of diseases through the understanding of stem cell aging |
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| Project/Area Number |
17H05649
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
松井 啓隆 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (60379849)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 老化造血幹細胞 / リボソームプロファイリング / 造血器腫瘍 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、造血幹細胞領域を中心に、加齢によるリボソームの変化が注目されつつある。リボソームの機能は過剰に過ぎても抑制されてもHSCの可塑性維持に不都合が生じることがわかってきた。リボソームを構成する因子は約80種類のリボソームタンパク質と4種類のリボソームRNA(rRNA)であるが、この生合成には多くの因子が必要で、とりわけpre-rRNAのプロセシングは、数百に及ぶトランス因子の作用で段階的に秩序だって行われる。また、リボソームDNA(rDNA)領域は、合計数百のrDNA遺伝子により構成され、数多くの服制開始点を有することが知られる。最近、この領域のDNA複製障害の蓄積が老化造血細胞の特徴のひとつであることが示され、リボソーム生合成のコントロールを起点とした細胞制御システムが加齢現象に深く関わることが注目されつつある。
こうしたことを背景とし、本研究では造血細胞の加齢や、加齢とともに発症リスクの増大する造血器腫瘍をリボソーム機能の変化と対比して検証することに主眼を置いた解析を実施してきた。H29年度には白血病細胞株をモデルとし、リボソームプロファイリング解析の基盤構築に力を注いできた。この解析手法は、リボソームの中に取り込まれているmRNAのみを分離精製し次世代シーケンサーでデータ取得するもので、まさに翻訳を受けつつある遺伝子配列を知ることができる。これにより、細胞の加齢や腫瘍化に伴う、遺伝子ごとの翻訳効率の変化やスプライスフォームの選択性に踏み込んだ解析を実施することができるが、データ取得が煩雑でテクニックを要することが障壁となる。初年度には細胞株をモデルとしたデータ取得に成功し大きな弾みがついたので、H30年度には、遺伝子改変を施した細胞や初代培養細胞を用いた同様の解析を実施することを計画している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度計画の最大の目標であった、リボソームプロファイリング手法の構築に成功したので、研究計画はほぼ順調に進展しているといえる。また、並行して進めてきた遺伝子改変マウス(リボソーム生合成に異常をきたすことが想定されるDDX41遺伝子変異ノックインマウス)の作出にも成功した。
こうしたモデルや実験手法を造血幹細胞の老化現象といかに直接的に結びつける解析が実施できるかという点が、次年度以降の課題である。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究実績の概要に記載の通り、H29年度にはリボソームプロファイリング解析手法の構築に注力し、細胞株モデルを用いてデータ取得を実施することができた。このリボソームプロファイリング解析では、遺伝子のうち翻訳されつつある部分のみを選択的に次世代シーケンサーで読めるので、mRNAシーケンスによる遺伝子発現データと対比させることで、網羅的に遺伝子ごとの翻訳効率を調べることができる。また、翻訳フレームの変化なども得ることが可能である。
今後は、造血細胞の老化に関わる遺伝子のうち、リボソーム生合成に関わる遺伝子に改変を加えた細胞を用いてリボソームプロファイリング解析を実施し、加齢に伴っていかに翻訳の「品質」が変容していくか明らかにすることを目指す。
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Research Products
(27 results)
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[Journal Article] A novel ASXL1-OGT axis plays roles in H3K4 methylation and tumor suppression in myeloid malignancies.2018
Author(s)
Inoue D, Fujino T, Sheridan P, Zhang YZ, Nagase R, Horikawa S, Li Z, Matsui H, Kanai A, Saika M, Yamaguchi R, Kozuka-Hata H, Kawabata K, Yokoyama A, Goyama S, Inaba T, Imoto S, Miyano S, Xu M, Yang FC, Oyama M, Kitamura T.
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Journal Title
Leukemia
Volume: in press
Pages: in press
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Loss of CYLD promotes cell invasion via ALK5 stabilization in oral squamous cell carcinoma.2018
Author(s)
Shinriki S, Jono H, Maeshiro M, Nakamura T, Guo J, Li JD, Ueda M, Yoshida R, Shinohara M, Nakayama H, Matsui H, Ando Y (Matsui and Ando: co-senior authors).
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Journal Title
J Pathol.
Volume: 244(3)
Pages: 367-379
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetic and clinical characteristics of hereditary transthyretin amyloidosis in endemic and non-endemic areas: experience from a single-referral center in Japan.2018
Author(s)
Yamashita T, Ueda M, Misumi Y, Masuda T, Nomura T, Tasaki M, Takamatsu K, Sasada K, Obayashi K, Matsui H, Ando Y.
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Journal Title
J Neurol.
Volume: 265(1)
Pages: 134-140
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A case of pulmonary thromboembolism due to coagulation factor V Leiden in Japan ~Usefulness of next generation sequencing~.2017
Author(s)
Sueta D, Ito M, Uchiba M, Sakamoto K, Yamamoto E, Izumiya Y, Kojima S, Kaikita K, Shinriki S, Hokimoto S, Matsui H, Tsujita K.
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Journal Title
Thromb. J
Volume: 15(8)
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Inflammatory state exists in familial amyloid polyneuropathy that may be triggered by mutated transthyretin.2017
Author(s)
Suenaga G, Ikeda T, Masuda T, Motokawa H, Yamashita T, Takamatsu K, Misumi Y, Ueda M, Matsui H, Senju S, Ando Y.
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Journal Title
Sci. Rep
Volume: 7(1)
Pages: 1579, 2017.
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] A novel LSD1 inhibitor NCD38 ameliorates MDS-related leukemia with complex karyotype by attenuating leukemia programs via activating super-enhancers.2017
Author(s)
Sugino N, Kawahara M, Tatsumi G, Kanai A, Matsui H, Yamamoto R, Nagai Y, Fujii S, Shimazu Y, Hishizawa M, Inaba T, Andoh A, Suzuki T, Takaori-Kondo A.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 31(11)
Pages: 2303-2314
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Impact of combinatorial dysfunctions of Tet2 and Ezh2 on the epigenome in the pathogenesis of myelodysplastic syndrome.2017
Author(s)
Hasegawa N, Oshima M, Sashida G, Matsui H, Koide S, Saraya A, Wang C, Muto T, Takane K, Kaneda A, Shimoda K, Nakaseko C, Yokote K, Iwama A.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 31(4)
Pages: 861-871
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 血液培養よりHelicobacter cinaediを分離した5症例の検討 (YIAシンポジウム)2017
Author(s)
荻 泰裕, 山本 景一, 吉永 浩子, 土橋 紗央里, 福嶋 理香, 大隈 雅紀, 池田 勝義, 富田 純子, 河村 好章, 馬場 秀夫, 松井 啓隆
Organizer
第57回日本臨床化学会年次学術集会
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[Presentation] 当院における安全な輸血療法の為の取り組み 院内輸血ラウンドをとおして2017
Author(s)
石原 綾子, 福吉 葉子, 米村 雄士, 有山 朝子, 吉田 朝子, 下山 治香, 井上 有子, 富永 るみ子, 齋藤 寿子, 眞鳥 千晶, 森川 由梨, 池田 勝義, 内場 光浩, 松井 啓隆
Organizer
第65回日本輸血細胞治療学会総会
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