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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanism that iIntegrates neo-self antigen recognition into cell differentiation.

Publicly Offered Research

Project AreaCreation, function and structure of neo-self
Project/Area Number 17H05805
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

谷内 一郎  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (20284573)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywords抗原認識 / T細胞 / TCR信号 / 転写因子
Outline of Annual Research Achievements

当該新学術領域ネオ・セルフでは新たな抗原提示形態を介した抗原認識が関与する免疫応答のメカニズムを多角的な視点で解明することを中心課題に据えている。本研究は、ネオ・セルフ抗原認識に伴うTCR信号の変化が如何に病的なT細胞分化に繋がるか理解することを目的に、ヘルパー/キラー系列決定を制御する核内機構をモデルに、Thpok遺伝子座内のThpokサイレンサー上で起こる分子応答の解明を目指した研究を行った。Thpokサイレンサー領域の機能制御にはBcl11b転写因子のC末端のZn-finger領域が重要であることを解明したことから、本研究では以下の2項目を設定し、研究を実施した。
1. Bcl11b転写因子と会合する分子の同定とBcl11b翻訳後修飾の生理的意義の解析.
2. Site-specific ChIP法の応用によるThpokサイレンサー上の制御分子の同定.
1についてはBirA酵素により生体内でBcl11bタンパクをビオチン化する実験系を構築し、野生型とC末端Zn-finger領域を欠損する変異型Bcl11bに会合する分子の網羅的同定と比較により、C末端Zn-finger領域を介してBcl11bと会合する候補分子群を同定した。またBcl11b翻訳後修飾の生理的意義について、TCR信号下流でリン酸化されるBcl11bタンパク内の24残基のセリン/スレオニン残基のうち23残基をアラニンに置換した変異マウスを作製し解析を行った結果、リン酸化はBcl11bのヘルパー/キラー系列決定制御での機能において重要でない結果を得た。
2について新規実験手法として目的のゲノム領域上のタンパク質をビオチン化するOn -site BioID法の樹立を目的に基礎的な条件検討を行い、遊離のBirAタンパクによる非特異的なビオチン化を減弱させることが必要である結果から、今後の改良の方向性が明らかとなった.

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Runx/Cbfβ complexes protect group 2 innate lymphoid cells from exhausted-like hyporesponsiveness during allergic airway inflammation2019

    • Author(s)
      Miyamoto Chizuko、Kojo Satoshi、Yamashita Motoi、Moro Kazuyo、Lacaud Georges、Shiroguchi Katsuyuki、Taniuchi Ichiro、Ebihara Takashi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-019-08365-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Differential Requirement of Cd8 Enhancers E8I and E8VI in Cytotoxic Lineage T Cells and in Intestinal Intraepithelial Lymphocytes2019

    • Author(s)
      Gulich Alexandra Franziska、Preglej Teresa、Hamminger Patricia、Alteneder Marlis、Tizian Caroline、Orola Maria Jonah、Muroi Sawako、Taniuchi Ichiro、Ellmeier Wilfried、Sakaguchi Shinya
    • Journal Title

      Frontiers in Immunology

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fimmu.2019.00409

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Runx-dependent and silencer-independent repression of a maturation enhancer in the Cd4 gene2018

    • Author(s)
      Kojo Satoshi、Yasmin Nighat、Muroi Sawako、Tenno Mari、Taniuchi Ichiro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05803-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Tle corepressors are differentially partitioned to instruct CD8+ T cell lineage choice and identity2018

    • Author(s)
      Xing Shaojun、Shao Peng、Li Fengyin、Zhao Xudong、Seo Wooseok、Wheat Justin C.、Ramasamy Selvi、Wang Jianfeng、Li Xiang、Peng Weiqun、Yu Shuyang、Liu Chengyu、Taniuchi Ichiro、Sweetser David A.、Xue Hai-Hui
    • Journal Title

      The Journal of Experimental Medicine

      Volume: 215 Pages: 2211~2226

    • DOI

      10.1084/jem.20171514

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CD4 Helper and CD8 Cytotoxic T Cell Differentiation2018

    • Author(s)
      Taniuchi Ichiro
    • Journal Title

      Annual Review of Immunology

      Volume: 36 Pages: 579~601

    • DOI

      10.1146/annurev-immunol-042617-053411

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Gene regulation by local and long-range chromatin loops during CD4/CD8 lineage choice2019

    • Author(s)
      Ichiro Taniuchi
    • Organizer
      The Keystone Symposia
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Regulation of Dendritic Cell Development by Runx Factors2018

    • Author(s)
      Ichiro Taniuchi
    • Organizer
      The 1st International Symposium on NEO-SELF
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 皮膚免疫細胞の分化過程におけるRunx 転写因子の働き2018

    • Author(s)
      Ichiro Taniuchi
    • Organizer
      第67 回 日本アレルギー学会
    • Invited
  • [Presentation] Unraveling pathogenesis of human primary immune deficiency by mouse models2018

    • Author(s)
      Ichiro Taniuchi
    • Organizer
      The 6th Kyoto Course on Bioinformatics for Genomic Medicine International Symposium on Disease Genomics.
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 新たなT細胞分化制御機構を発見 -Cd4サイレンサー非依存的なCd4遺伝子発現制御-

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2018/20180905_1/

  • [Remarks] ランゲルハンス細胞の分化機構を解明

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2017/20170828_1/

URL: 

Published: 2019-12-27  

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