• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

祖先的シロイヌナズナ系統から探る自殖と新種誕生の原理

Publicly Offered Research

Project AreaDetermining the principles of the birth of new plant species: molecular elucidation of the lock-and-key systems in sexual reproduction
Project/Area Number 17H05833
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

土松 隆志  千葉大学, 大学院理学研究院, 准教授 (60740107)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
Keywords自家不和合性 / 自殖 / 集団ゲノミクス
Outline of Annual Research Achievements

本年度は主に以下の3つの課題について研究を行った:
(1) ゲノムワイド関連解析による自殖に関わる花形質の遺伝変異の解析:清水グループ(瀬々班)と共同で,主にユーラシアの系統を用いて,ゲノムワイド関連解析(GWAS)から花粉数に関わる遺伝変異の解析を行っている.その結果,花粉数に関わる複数の遺伝子座に自然選択の痕跡が見られることが明らかになっている(論文改訂中).また,アフリカ・地中海の105系統についても表現型計測を行いGWASを実施した結果,ユーラシア系統でのGWASとは異なるピークが見られた.この結果は,地域集団により異なるアリルが表現型に関わることを示唆している.現在さらに系統数を増やし,200以上のアフリカ・地中海系統で解析を進めている.
(2) アフリカ系統を用いた,種間不和合性に関わる遺伝変異の解析:高山班が進めている,GWASにより同定された種間不和合性に関わる遺伝子について,アフリカ系統を用いて多型解析を行った.その結果,「種間和合型」のアリルがシロイヌナズナのユーラシア進出(約8万年前)に伴って最近急激に頻度を増したことが示唆された.この結果は,自殖の進化の後に種間不和合性は失われやすいという予測を支持している(論文改訂中).
(3) ナス科自家不和合性システムにおける鍵・鍵穴の進化過程:高山班と共同で,ナス科自家不和合性システムにおける鍵と鍵穴(S-RNase遺伝子およびSLF遺伝子)の分子集団遺伝学的解析を進めている.

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (19 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] チューリッヒ大学(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      チューリッヒ大学
  • [Int'l Joint Research] グレゴール・メンデル研究所(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      グレゴール・メンデル研究所
  • [Int'l Joint Research] リール大学(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      リール大学
  • [Journal Article] Exploring Genetic Diversity and Signatures of Horizontal Gene Transfer in Nodule Bacteria Associated with Lotus japonicus in Natural Environments2019

    • Author(s)
      BAMBA Masaru、Aoki Seishiro、Kajita Tadashi、Setoguchi Hiroaki、Watano Yasuyuki、Sato Shusei、Tsuchimatsu Takashi
    • Journal Title

      Molecular Plant-Microbe Interactions

      Volume: 印刷中 Pages: -

    • DOI

      10.1094/MPMI-02-19-0039-R

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant adaptation and speciation studied by population genomic approaches2018

    • Author(s)
      Bamba Masaru、Kawaguchi Yawako W.、Tsuchimatsu Takashi
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation

      Volume: 61 Pages: 12~24

    • DOI

      10.1111/dgd.12578

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evolutionary Dynamics of Plant Populations Studied by Population Genomics: Genomics of Adaptation2018

    • Author(s)
      TSUCHIMATSU Takashi
    • Journal Title

      KAGAKU TO SEIBUTSU

      Volume: 56 Pages: 317~323

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.56.317

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 自家受精の平行進化のゲノム基盤2019

    • Author(s)
      土松隆志
    • Organizer
      神戸大学大学院農学研究科インターゲノミクスセミナー
    • Invited
  • [Presentation] 植物の適応形質のゲノム科学2018

    • Author(s)
      土松隆志
    • Organizer
      京都大学生態学研究センター研究集会「異なるマクロ生物学分野のインタープレイ」
    • Invited
  • [Presentation] アブラナ科植物における自家不和合性と自家受精の進化2018

    • Author(s)
      土松隆志
    • Organizer
      日本育種学会ワークショップ「アブラナ科植物における自家不和合性研究の最前線と育種現場での利用」
    • Invited
  • [Presentation] 南米産ペチュニア属植物の自家和合系統を用いたS遺伝子座の配列解析2018

    • Author(s)
      坂本奈緒子,渡辺均,上原浩一,土松隆志
    • Organizer
      日本植物学会
  • [Presentation] 接合藻ヒメミカヅキモ種内系統間にみられるゲノム構造の変異:生殖様式の進化との関連2018

    • Author(s)
      川口也和子,土金勇樹,西山智明,関本弘之,土松隆志
    • Organizer
      日本植物学会
  • [Presentation] 植物における自家不和合性と自家受精の進化:アブラナ科・ナス科植物を例に2018

    • Author(s)
      土松隆志
    • Organizer
      日本進化学会シンポジウム「生態発生進化」
    • Invited
  • [Presentation] 南米産ペチュニア属植物を用いた自家不和合性遺伝子座配列解析2018

    • Author(s)
      坂本奈緒子,渡辺均,上原浩一,土松隆志
    • Organizer
      日本進化学会
  • [Presentation] 2種類の生殖様式を持つ接合藻ヒメミカヅキモにおけるゲノム構造の系統間比較2018

    • Author(s)
      川口也和子,土金勇樹,西山智明,関本弘之,土松隆志
    • Organizer
      日本進化学会
  • [Presentation] 全ゲノム配列解析と交互接種実験から探るマメ科植物-根粒菌間の共生特異性の進化2018

    • Author(s)
      番場大,青木誠志朗,梶田忠,瀬戸口浩彰,綿野泰行,佐藤修正,土松隆志
    • Organizer
      日本進化学会
  • [Presentation] Diversity and horizontal gene transfer of nodule bacteria associated with Lotus japonicus in natural environments2018

    • Author(s)
      Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Watano, Y., Setoguchi, H., Sato, S., Tsuchimatsu, T.
    • Organizer
      Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 植物における自家不和合性と自家受精の進化2018

    • Author(s)
      土松隆志
    • Organizer
      遺伝学研究所研究会「マクロ生態学と遺伝学の融合」
    • Invited
  • [Book] 分子生物学2018

    • Author(s)
      J. Zlatanova、K. E. van Holde、田村 隆明
    • Total Pages
      608
    • Publisher
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807909490
  • [Remarks] Tsuchimatsu Lab

    • URL

      https://tsuchimatsu.wordpress.com

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi