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2018 Fiscal Year Annual Research Report

フロリゲン複合体の立体構造解析と低分子化合物による花成制御

Publicly Offered Research

Project AreaDetermining the principles of the birth of new plant species: molecular elucidation of the lock-and-key systems in sexual reproduction
Project/Area Number 17H05836
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

児嶋 長次郎  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (50333563)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2019-03-31
KeywordsNMR / 蛋白質 / 立体構造
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、花成ホルモン・受容体・転写因子・DNA4者複合体の立体構造解析と、花成の制御が可能な低分子化合物の創製によって、植物の生産性や生体機能の 精密制御の基盤とすることを目的としている。平成29年度から継続して、(1)全自動NMR構造解析システムMagROの開発、(2)花成ホルモン受容体をターゲットとしたスクリーニングと化合物最適化、を進めるとともに、独自のアミノ酸選択標識技術などと組み合わせ、平成30年度から新たに、(3)複合体構成蛋白質単体の立体構造決定、(4)花成ホルモン受容体複合体と薬剤複合体の構造解析、に取り組んだ。本年度の具体的な研究成果は以下の通り。
(1)昨年度開発した全自動NMR構造解析システムについては、様々な蛋白質への適用が可能であることを確認した。また、花成ホルモンと受容体に適用した。(2)受容体-転写因子相互作用を標的とし、4万化合物から花成制御化合物を得ることに成功した。しかし得られた化合物の類縁化合物では溶解度を向上させることができなかったため、標的とすべき蛋白質間相互作用を変えて再度スクリーニングを行った。(3)(4)立体構造解析では、花成ホルモン・受容体・転写因子・DNAの4者複合体をハイブリッド法で立体構造解析するための基盤として、複合体の構成蛋白質個々に単体での立体構造決定と複合体の安定化を進めた。手法としてX線とNMRの両方を用い、花成ホルモンと受容体・転写因子複合体の構造解析を進め、受容体・転写因子複合体については立体構造決定に成功した。低分子化合物の創製では、19F-NMRを活用した蛋白質薬剤構造構築法を新たに開発した。また、花成ホルモンと薬剤との相互作用解析を進めた。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2018 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The Helix Rearrangement in the Periplasmic Domain of the Flagellar Stator B Subunit Activates Peptidoglycan Binding and Ion Influx2018

    • Author(s)
      Kojima Seiji、Takao Masato、Almira Gaby、Kawahara Ikumi、Sakuma Mayuko、Homma Michio、Kojima Chojiro、Imada Katsumi
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 26 Pages: 590~598.e5

    • DOI

      10.1016/j.str.2018.02.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Amino Acid Selective 13C Labeling and 13C Scrambling Profile Analysis of Protein α and Side-Chain Carbons in Escherichia coli Utilized for Protein Nuclear Magnetic Resonance2018

    • Author(s)
      Sugiki Toshihiko、Furuita Kyoko、Fujiwara Toshimichi、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 57 Pages: 3576~3589

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00182

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphoinositide binding by the PH domain in ceramide transfer protein (CERT) is inhibited by hyperphosphorylation of an adjacent serine-repeat motif2018

    • Author(s)
      Sugiki Toshihiko、Egawa Daichi、Kumagai Keigo、Kojima Chojiro、Fujiwara Toshimichi、Takeuchi Koh、Shimada Ichio、Hanada Kentaro、Takahashi Hideo
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 293 Pages: 11206~11217

    • DOI

      10.1074/jbc.RA118.002465

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] NMR spectroscopic characterization of a model RNA duplex reflecting the core sequence of hammerhead ribozymes2018

    • Author(s)
      Hattori Yoshikazu、Yamanaka Daichi、Morioka Saori、Yamaguchi Taishi、Tomonari Honoka、Kojima Chojiro、Tanaka Yoshiyuki
    • Journal Title

      Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids

      Volume: 37 Pages: 383~396

    • DOI

      10.1080/15257770.2018.1473877

  • [Journal Article] Noise peak filtering in multi-dimensional NMR spectra using convolutional neural networks2018

    • Author(s)
      Kobayashi Naohiro、Hattori Yoshikazu、Nagata Takashi、Shinya Shoko、Guentert Peter、Kojima Chojiro、Fujiwara Toshimichi
    • Journal Title

      Bioinformatics

      Volume: 34 Pages: 4300~4301

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bty581

  • [Presentation] 創薬 NMR 技術の開発とその植物生理学分野への応用2018

    • Author(s)
      児嶋長次郎
    • Organizer
      日本蛋白質科学会第18回年会
    • Invited
  • [Presentation] NMR tools developed for protein-drug and protein-protein interaction studies2018

    • Author(s)
      Chojiro Kojima
    • Organizer
      The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 植物構造生物学研究と創薬2018

    • Author(s)
      児嶋長次郎
    • Organizer
      植物科学シンポジウム 2018
    • Invited
  • [Remarks] Kojima Lab top page

    • URL

      http://nmrlab.ynu.ac.jp/labotop.php

URL: 

Published: 2019-12-27  

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