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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Construction and formation of heterochromatin bodies in mammalian cells

Publicly Offered Research

Project AreaChromosome Orchestration System
Project/Area Number 18H04713
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

小布施 力史  大阪大学, 理学研究科, 教授 (00273855)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywordsクロマチンボディー / HP1 / ヘテロクロマチン
Outline of Annual Research Achievements

私たちがヘテロクロマチン因子の一つとして同定したAHDC1を増量することにより、まるいヘテロクロマチンボディーがほどけて太いひも状になることに気がついた。このことは、AHDC1がHP1に結合してその性質を変えることが、ヘテロクロマチンボディーの形態に影響を及ぼしていることを示唆している。本課題では、ヘテロクロマチンボディーの成り立ちを、AHDC1がヘテロクロマチンボディーの形成にどのように働きかけているのかを明らかにしつつ、1)内在する物理化学的な性質や構造、2)核や核小体など核構造との親和性、3)ボディーの外から働きかける力や構造、の3つの要素に還元しながら行う。また、AHDC1や核構造との相互作用に寄与する因子の増減でヘテロクロマチンボディーの形態と核内配置を操作することにより、ヘテロクロマチンボディーの形態や配置と、転写、複製、修復などクロマチン上の制御について議論することを目指す。
当該年度は、以下の結果を得た。ヘテロクロマチンボディーの状態を客観的に比較するために、おもにマウスNIH3T3細胞を用いて、クロモセンターに着目して解析することとした。この細胞に、リポフェクションを用いてAHDC1を一過的に発現すると、丸いクロモセンターがひも状に変形する。また、画像解析により、この変化を定量的に測定することに成功した。HP1、SCAIに結合できない点変異、AT-hookの点変異、それらの組み合わせた変異タンパク質の発現系を用いて検証したところ、HP1結合能とC末側に散在する配列の2つの要素が、クロモセンターの形態変化を及ぼす活性に必須であることを見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

AHDC1のクロモセンターの形態、存在様式への影響を観察するのに適した細胞を見出し、機械学習による画像解析により、客観的に形態、存在様式を計測、評価できる系が確立した。この系を用いて、AHDC1上の、HP1結合能とC末側に散在する配列の2つの要素が、クロモセンターの形態変化を及ぼす活性に必須であることを見出した。このように、ほぼ計画通りに進捗していること、機械学習による定量評価が予想以上に良好であることが判明し、この点においては計画以上に進展した。

Strategy for Future Research Activity

本年度は、C末端からAHDC1を決失すると、クロモセンターの変形活性を徐々に失うことから、活性に必要な要素が散在していると想定していが、その実態を明らかにすることを目指す。さらに、増量した時の表現型に加えて、減量した時の表現型を観察するために、AHDC1のノックアウト細胞をNIH3T3を用いて作成する。クロモセンターはペリセントロメア領域のメジャーサテライトに形成されるヘテロクロマチンであることから、セントロメア機能やメジャーサテライトからの転写に着目して、AHDC1の機能を洗い出す。

  • Research Products

    (14 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Genome-wide stability of the DNA replication program in single mammalian cells2019

    • Author(s)
      Takahashi Saori、Miura Hisashi、Shibata Takahiro、Nagao Koji、Okumura Katsuzumi、Ogata Masato、Obuse Chikashi、Takebayashi Shin-ichiro、Hiratani Ichiro
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 51 Pages: 529~540

    • DOI

      10.1038/s41588-019-0347-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of SmcHD1 in establishment of epigenetic states required for the maintenance of the X-inactivated state in mice2018

    • Author(s)
      Sakakibara Yuki、Nagao Koji、Blewitt Marnie、Sasaki Hiroyuki、Obuse Chikashi、Sado Takashi
    • Journal Title

      Development

      Volume: 145 Pages: 806-821

    • DOI

      10.1242/dev.166462

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nucleosomes around a mismatched base pair are excluded via an Msh2-dependent reaction with the aid of SNF2 family ATPase Smarcad12018

    • Author(s)
      Terui Riki、Nagao Koji、Kawasoe Yoshitaka、Taki Kanae、Higashi Torahiko L.、Tanaka Seiji、Nakagawa Takuro、Obuse Chikashi、Masukata Hisao、Takahashi Tatsuro S.
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 32 Pages: 806~821

    • DOI

      10.1101/gad.310995.117

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] X染色体不活性化過程におけるSmchd1-Hbix1の役割2018

    • Author(s)
      長尾恒治、榊原祐樹、元田裕佳里、坂口武久、木村宏、佐渡敬、小布施力史
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] RIF1-PP1複合体のDNA損傷における機能解析2018

    • Author(s)
      磯部 真也、長尾 恒治、野崎 直仁、木村 宏、小布施 力史
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 染色体不活性化における非コードXIST RNAとSmchd1-Hbix1Xの役割2018

    • Author(s)
      長尾 恒治、榊原 祐樹、坂口 武久、木村 宏、佐渡 敬、小布施 力史
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Smchd1-Hbix1依存的な不活性化X染色体の区画化2018

    • Author(s)
      長尾 恒治、榊原 祐樹、柴田 幸子、野澤 竜介、坂口 武久、木村 宏、佐渡 敬、小布施 力史
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 分裂酵母に特異的な核膜孔複合体の構造と機能2018

    • Author(s)
      淺川 東彦、糀谷 知子、楊 恵如、大槻 千鶴、小坂田 裕子、松田 厚志、岩本 政明、近重 裕次、高木 尚充、長尾 恒治、小布施 力史、平岡 泰、原口 徳子
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Single-cell DNA replication timing profiling and 3D genome organization dynamics during development2018

    • Author(s)
      Hisashi Miura, Saori Takahashi, Takahiro Shibata, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Shin-ichiro Takebayashi, Ichiro Hiratani
    • Organizer
      Nuclear Organization & Function on Cold Spring Harbor Meeting
  • [Presentation] 分化前後のES細胞における複製ドメインは細胞間で極めて均一なプロファイルを示す2018

    • Author(s)
      高橋沙央里、三浦尚、柴田隆豊、長尾恒治、小布施力史、竹林慎一郎、平谷伊智朗
    • Organizer
      第12回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Remarks] 染色体構造機能学研究室

    • URL

      http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/obuse/

  • [Remarks] 染色体構造機能学研究室

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/dbs01/re-paper-temp.php?id=98

  • [Remarks] 乳がん、卵巣がんの抑制遺伝子の働きを助けるタンパク質SCAIを新発見

    • URL

      https://resou.osaka-u.ac.jp/ja/research/2017/20170712_1

  • [Remarks] 女性の"働かない"X染色体の仕組みを解明

    • URL

      http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/obuse/nsmb2013/

URL: 

Published: 2019-12-27  

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