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2019 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム倍数性がもたらす進化可能性~揺らぎと安定性の両立~

Publicly Offered Research

Project AreaEvolutionary theory for constrained and directional diversities
Project/Area Number 18H04827
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

大林 龍胆  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 特任助教 (90778333)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywordsゲノム複製 / シアノバクテリア / ゲノム倍数性 / ゲノム遺伝
Outline of Annual Research Achievements

ゲノム倍数化は、現存する様々な生物種において観測される形質である。古くから倍数体生物は環境変動などへの適応能力が高いことが示唆されているが、その基本原理の解明には至っていない。大野乾のゲノム重複説によれば、ゲノムの倍数化により冗長性がもたらされ、元々の遺伝子の機能を保持したまま重複した遺伝子の機能が改変され、新規形質の進化が促進されうる。他方、進化速度を考えた場合、1細胞あたりのゲノムのコピー数が多い場合、1つのゲノムに変異が入ってもその効果が弱められる、つまり表現型の揺らぎが小さくなるため、進化速度は遅くなりうる。本研究では、この一見矛盾するゲノム倍数性の進化に対する影響を、実験と理論の両面から定量的に捉え、ゲノム倍数化と進化の関に存在する普遍原理の解明を目指す。
昨年度は以下の2項目において研究を実施した。
(1)複数コピーゲノムの遺伝様式の解析
進化可能性を解明するためには、変異がすべてのゲノムに固定される速度を定量する必要がある。そこで、複数コピーゲノムのうちどのゲノムを複製し、どのゲノムを遺伝するのかを詳細に解析するため、1細胞イメージング系を確立し染色体トラッキングをおこなった。その結果、ゲノム複製の選択性はなく、ほぼランダムに選択されることがわかってきた。さらに、このランダムな複製、遺伝においても、わずか約5世代で8割の細胞はどれかひとつのゲノムに固定されることも明らかになった。
(2)ゲノム倍数化の分子基盤
そもそもなぜ倍数化するのかという分子基盤を理解するため、様々な倍数性を持つシアノバクテリアを用いて解析した。その結果、倍数性が多いシアノバクテリアは、バクテリア型の複製機構とは別の新規なゲノム複製機構を持つことが示唆された。この結果は複製開始機構の進化によって、1細胞分裂あたりの複製回数が変化したことが考えられ、倍数化との因果関係が示唆された。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Specific binding of DnaA to the DnaA box motif in the cyanobacterium <i>Synechococcus elongatus</i> PCC 79422020

    • Author(s)
      Watanabe Satoru、Saito Shunsuke、Suezaki Yasuhiro、Seguchi Takeshi、Ohbayashi Ryudo
    • Journal Title

      The Journal of General and Applied Microbiology

      Volume: 66 Pages: 80~84

    • DOI

      10.2323/jgam.2019.11.005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evolutionary Changes in DnaA-Dependent Chromosomal Replication in Cyanobacteria2020

    • Author(s)
      Ohbayashi Ryudo、Hirooka Shunsuke、Onuma Ryo、Kanesaki Yu、Hirose Yuu、Kobayashi Yusuke、Fujiwara Takayuki、Furusawa Chikara、Miyagishima Shin-ya
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.00786

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Coordination of Polyploid Chromosome Replication with Cell Size and Growth in a Cyanobacterium2019

    • Author(s)
      Ohbayashi Ryudo、Nakamachi Ai、Hatakeyama Tetsuhiro S.、Watanabe Satoru、Kanesaki Yu、Chibazakura Taku、Yoshikawa Hirofumi、Miyagishima Shin-ya
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.1128/mBio.00510-19

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Integration of aGaldieriaplasma membrane sugar transporter enables heterotrophic growth of the obligate photoautotrophic red algaCynanidioschyzon merolae2019

    • Author(s)
      Fujiwara Takayuki、Hirooka Shunsuke、Mukai Mizuna、Ohbayashi Ryudo、Kanesaki Yu、Watanabe Satoru、Miyagishima Shin-ya
    • Journal Title

      Plant Direct

      Volume: 3 Pages: e00134~e00134

    • DOI

      10.1002/pld3.134

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Replication and inheritance mechanism of multi-copy genomes in bacteria and organelle2020

    • Author(s)
      Ryudo Ohbayashi
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Remarks] 大林龍胆のホームページ

    • URL

      https://ryudoohbayashi.wixsite.com/website

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Published: 2024-12-25  

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