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2019 Fiscal Year Annual Research Report

環境応答により雌雄を産み分けるミジンコの性スペクトラム

Publicly Offered Research

Project AreaSpectrum of the Sex: a continuity of phenotypes between female and male
Project/Area Number 18H04884
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

加藤 泰彦  大阪大学, 工学研究科, 准教授 (60415932)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywordsオオミジンコ / 性スペクトラム / ダブルセックス遺伝子 / 長鎖ノンコーディングRNA
Outline of Annual Research Achievements

前年度に行ったオス化の程度が異なるオス決定因子Dsx1変異体を用いたRNA-seqデータから、Dsx1と相関のある449個の遺伝子を見出した。これらの遺伝子の発現は Dsx1の変異に依存して変化しており、Dsx1の下流因子であることが示唆された。興味深いことに、これらの遺伝子の大半(398個)は Dsx1 発現と負の相関を示しており、Dsx1によって直接的または間接的に抑制されていることを示唆された。RNA-Seq解析において見いだされたメスで高発現する遺伝子群には「輸送」と「代謝」に関わる遺伝子が多く、これらの中にはアミノ酸や糖の生合成遺伝子が多く含まれていた。一方で、オスで高発現する遺伝子群には、「シグナル伝達経路」に関係する遺伝子が多かった。この結果は、Dsx1が転写因子として複数のシグナル伝達経路を活性化して器官形成をオス型に向かわせる一方で、抑制因子として代謝を低下させていることを示唆している。以上の解析から、性スペトラム上の位置を変動させるDsx1の下流で働く因子をリストアップすることができた。
一方で、 Dsx1 を活性化する長鎖ノンコーディングRNAの性スペトラム上の位置決定における役割を明らかにするために、長鎖ノンコーディングRNAに結合するタンパク質を探索も行った。長鎖ノンコーディングRNAのコア配列に結合するタンパク質をトラップして質量分析を行い、2つの結合タンパク質を見出すことに成功した。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2021 2020

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 3 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Mutation of the Cytochrome P450 CYP360A8 Gene Increases Sensitivity to Paraquat in Daphnia magna2021

    • Author(s)
      Religia Pijar、Nguyen Nhan Duc、Nong Quang Dang、Matsuura Tomoaki、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      Environmental Toxicology and Chemistry

      Volume: 40 Pages: 1279-1288

    • DOI

      10.1002/etc.4970

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete mitochondrial genome of the freshwater water flea Daphnia magna NIES strain (Cladocera, Daphniidae): Rearrangement of two ribosomal RNA genes2020

    • Author(s)
      Lee Jin-Sol、Kim Duck-Hyun、Choi Beom-Soon、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime、Lee Jae-Seong
    • Journal Title

      Mitochondrial DNA Part B

      Volume: 5 Pages: 1822~1823

    • DOI

      10.1080/23802359.2020.1750995

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Oligosaccharides derived from dragon fruit modulate gut microbiota, reduce oxidative stress and stimulate toll-pathway related gene expression in freshwater crustacean Daphnia magna2020

    • Author(s)
      Sangkuanun Thanwarat、Wichienchot Santad、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime、Peerakietkhajorn Saranya
    • Journal Title

      Fish & Shellfish Immunology

      Volume: 103 Pages: 126~134

    • DOI

      10.1016/j.fsi.2020.04.046

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two Doublesex1 mutants revealed a tunable gene network underlying intersexuality in Daphnia magna2020

    • Author(s)
      Nong Quang Dang、Matsuura Tomoaki、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 15 Pages: e0238256

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0238256

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Roles of and cross-talk between ecdysteroid and sesquiterpenoid pathways in embryogenesis of branchiopod crustacean Daphnia magna2020

    • Author(s)
      Adhitama Nikko、Kato Yasuhiko、Matsuura Tomoaki、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 15 Pages: e0239893

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0239893

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Caloric restriction upregulates the expression ofDNMT3.1, lacking the conserved catalytic domain, inDaphnia magna2020

    • Author(s)
      Nguyen Nhan Duc、Matsuura Tomoaki、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      genesis

      Volume: 58 Pages: e23396

    • DOI

      10.1002/dvg.23396

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Production of genome-edited Daphnia for heavy metal detection by fluorescence2020

    • Author(s)
      Arao Takuto、Kato Yasuhiko、Nong Quang Dang、Yamamoto Hiroshi、Watanabe Haruna、Matsuura Tomoaki、Tatarazako Norihisa、Tani Kazune、Okamoto Akira、Matsumoto Takeru、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 21490

    • DOI

      10.1038/s41598-020-78572-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reduction of histamine and enhanced spinning behavior of Daphnia magna caused by scarlet mutant2020

    • Author(s)
      Ismail Nur Izzatur Binti、Kato Yasuhiko、Matsuura Tomoaki、G?mez‐Canela Cristian、Barata Carlos、Watanabe Hajime
    • Journal Title

      genesis

      Volume: 59 Pages: e23403

    • DOI

      10.1002/dvg.23403

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Variations in effects of ectosymbiotic microbes on the growth rates among different species and genotypes of Daphnia fed different algal diets2020

    • Author(s)
      Zhang Xuan、Ohtsuki Hajime、Makino Wataru、Kato Yasuhiko、Watanabe Hajime、Urabe Jotaro
    • Journal Title

      Ecological Research

      Volume: 36 Pages: 303~312

    • DOI

      10.1111/1440-1703.12194

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミジンコの性 決定を制御する long noncoding RNA2020

    • Author(s)
      加藤泰彦
    • Organizer
      日本遺伝学会第 92 回大会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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