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2019 Fiscal Year Annual Research Report

光合成マンガンクラスターに酸素発生機能をもたらす基本原理の抽出と検証

Publicly Offered Research

Project AreaCreation of novel light energy conversion system through elucidation of the molecular mechanism of photosynthesis and its artificial design in terms of time and space
Project/Area Number 18H05167
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

磯部 寛  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 特任准教授 (00379281)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2020-03-31
Keywords光合成 / 光化学系II / マンガンクラスター / 水分解反応 / 機能発現
Outline of Annual Research Achievements

水を分解し生物の生存に必要な酸素を作り出す触媒であるMn4CaO5クラスターは、電子の授受に伴ってその構造を巧妙に変化させることで触媒活性を示す。本研究では、機能を発現する上で本質的に重要だと考えられる概念や原理・法則を見出すため、電子の属性である「電荷」と「スピン」に着目して、触媒がどのように化学反応を進めているのかを調べた。その結果、Mnクラスターが外部刺激に応答してその物理化学的挙動を変化させるスイッチング機能をもっていることが判明した。スイッチングは、基質水分子が高い酸化状態にあるクラスターの配位不飽和金属サイトに結合することでトポロジカル構造が異なる構造異性体と金属の電荷状態の間の対応関係が反転する現象を利用して、分子レベルで起こる。この機構において重要な役割を果たしているのが、基本構成原子であるMnイオンの電荷とスピンの可変性である。特に、Mn3+はヤーン・テラー(JT)効果によりeg軌道から生じる極めて強い方向性をもち、配位子の原子軌道と効果的な重なりを形成する。基質が捕捉されてスイッチがONになると、各MnイオンのJT歪みに起因する局所配位構造変化と電荷状態変化が協応し、ある特定の全体構造変化が誘起されることで、JT軸が1つに集まるクラスター内部の疎水空間において金属と基質間の共有結合性が高まる。この協同効果により、基質の結合により引き起こされる金属の電荷状態変化を金属と基質間の多電子移動として効率よく取り出せるようになる。つまり、スイッチ機能により、非常に困難な水の酸化反応を、適切なタイミングで、高い収率で、限りなく低い過電圧で触媒することができるようになると同時に、電荷担体の流れに整流性が発現する。このような触媒・整流器としての作動が分子レベルで可能になるのは、JT効果を鍵要素とする構成原子が「歪んだ椅子」を形成するように配置されているからに他ならない。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2020 2019

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] UNO(ULO) active space for multireference calculations on classical and quantum computers. Revisit to the iron-sulfur complexes2020

    • Author(s)
      Miyagawa Koichi、Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Yamanaka Shusuke、Kawakami Takashi、Okumura Mitsutaka、Yamaguchi Kizashi
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 746 Pages: 137252~137252

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2020.137252

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theory of chemical bonds in metalloenzymes XXIII fundamental principles for the photo-induced water oxidation in oxygen evolving complex of photosystem II2020

    • Author(s)
      Yamaguchi K.、Yamanaka S.、Isobe H.、Shoji M.、Miyagawa K.、Kawakami T.
    • Journal Title

      Molecular Physics

      Volume: 印刷中 Pages: 1725168~1725168

    • DOI

      10.1080/00268976.2020.1725168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical and computational investigations of geometrical, electronic and spin structures of the CaMn4OX (X=5,6) cluster in the Kok cycle Si (i=0-3) of oxygen evolving complex of photosystem II2019

    • Author(s)
      Yamaguchi Kizashi、Yamanaka Shusuke、Isobe Hiroshi、Shoji Mitsuo、Miyagawa Kouichi、Nakajima Takahito、Kawakami Takashi、Okumura Mitsutaka
    • Journal Title

      Physiologia Plantarum

      Volume: 166 Pages: 44~59

    • DOI

      10.1111/ppl.12960

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Elucidation of the entire Kok cycle for photosynthetic water oxidation by the large-scale quantum mechanics/molecular mechanics calculations: Comparison with the experimental results by the recent serial femtosecond crystallography2019

    • Author(s)
      Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Shen Jian-Ren、Suga Michihiro、Akita Fusamichi、Miyagawa Koichi、Shigeta Yasuteru、Yamaguchi Kizashi
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 730 Pages: 416~425

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.06.026

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of six different S1 structures of oxygen evolving complex of photosystem II. Proposal of multi-intermediate models for the S1 state2019

    • Author(s)
      Miyagawa K.、Kawakami T.、Isobe H.、Shoji M.、Yamanaka S.、Nakatani K.、Okumura M.、Nakajima T.、Yamaguchi K.
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 732 Pages: 136660~136660

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.136660

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of fourteen different S2 intermediates for water oxidation in the Kok cycle of OEC of PSII. Re-visit to one LS-two HS model for the S2 state2019

    • Author(s)
      Miyagawa K.、Isobe H.、Kawakami T.、Shoji M.、Yamanaka S.、Okumura M.、Nakajima T.、Yamaguchi K.
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 734 Pages: 136731~136731

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.136731

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An oxyl/oxo mechanism for oxygen-oxygen coupling in PSII revealed by an x-ray free-electron laser2019

    • Author(s)
      Suga Michihiro、et al.(24人中20番目)
    • Journal Title

      Science

      Volume: 366 Pages: 334~338

    • DOI

      10.1126/science.aax6998

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of strongly correlated electron systems: Examination of dynamic equilibrium models based on multiple intermediates in S1 state of photosystem II2019

    • Author(s)
      Miyagawa K.、Kawakami T.、Suzuki Y.、Isobe H.、Shoji M.、Yamanaka S.、Okumura M.、Nakajima T.、Yamaguchi K.
    • Journal Title

      Molecular Physics

      Volume: 印刷中 Pages: 1666171~1666171

    • DOI

      10.1080/00268976.2019.1666171

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 光化学系IIマンガンクラスターの電子スピン状態解析2019

    • Author(s)
      磯部寛、鈴木孝義、沈建仁、庄司光男、山口兆
    • Organizer
      新学術領域「光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光―物質変換系の創製」第2回合同班会議
  • [Presentation] Theoretical Analysis of the Electronic and Spin Structures of the Oxygen-Evolving Complex2019

    • Author(s)
      Hiroshi Isobe, Misuto Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi
    • Organizer
      International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019)
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-01-27  

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