• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

糖鎖間相互作用のアシンメトリックな階層構造の解明と制御

Publicly Offered Research

Project AreaCoordination Asymmetry: Design of Asymmetric Coordination Sphere and Anisotropic Assembly for the Creation of Functional Molecules
Project/Area Number 19H04569
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

山口 拓実  北陸先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 准教授 (60522430)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Keywords糖鎖 / NMR / 多価相互作用 / 過渡的相互作用 / ランタニド
Outline of Annual Research Achievements

非対称配位圏を生み出す分子群としての糖鎖に着目している。本研究では、糖鎖の生命機能発現機構の詳細を解明するとともに、糖鎖が秘める配位アシンメトリーの生物学的要素を物質化学の機能設計指針へと還元することを目指している。
細胞間接着に代表される糖鎖の生物機能発現プロセスでは、金属イオンの配位とクラスター化による多点相互作用が重要な要素となっている。2019年度では、細胞間の接着において重要な役割を担う分岐型糖鎖を対象に、糖鎖のタンパク質親和性を制御することを行なった。常磁性ランタニドイオンを活用したNMR計測と、大規模分子シミュレーションによる動的構造解析を基に、立体配座を改変する人工配列をもった糖鎖を創出した。その結果、化学合成した糖鎖の、対象タンパク質に対する親和性を顕著に向上させることに成功した。また、新規常磁性プローブを応用した相互作用解析法や、固体NMR技術を使った糖鎖の解析法の基盤を築くこともできた。
さらに、神経細胞上の糖鎖構造をモデルとした人工糖脂質の開発と、それを用いた機能性糖鎖クラスターの開発にも取り組んだ。まず、脂質膜上でネオ糖脂質へと変換可能な糖鎖カートリッジの設計と合成を行った。調製した糖鎖カートリッジを水中で脂質分子と反応させることで、人工糖脂質の生成にともなうジャイアントベシクルの自発的な形成に成功した。この際、用いる糖鎖構造によってベシクルの形態が変化することを見出した。また、糖鎖間の相互作用を通してベシクルの曲率が制御されることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では、糖鎖機能の発現機構解明と新たな機能創発という本研究目的の達成に向け、研究期間を通して「糖鎖の化学合成と修飾」、「糖鎖間相互作用の構造基盤解明」、「糖鎖集積による細胞様機能の創出」に取り組んでいる。
2019年度には生理活性糖鎖の化学合成とカートリッジ化に取り組み、配座空間制御によってタンパク質への高い親和性を獲得した人工糖鎖や、細胞様サイズのベシクルを自発形成する人工糖脂質の合成を達成した。こうした結果は、生体内での糖鎖の役割や機能メカニズムの解明にも繋がるものであり、生体膜を模倣した人工脂質膜やモデル細胞の開発において、糖鎖構造に由来する新たな機能の付与や制御を行うことも期待できる。また、新規常磁性プローブの調製と糖鎖への導入を行い、相互作用解析法の基盤を築くこともできた。こうした成果の一部については、各種国内学会や学術雑誌にて発表することができた。さらに、NMR法を利用した超分子錯体の構造解析など、領域内共同研究にも着手している。以上のように、本研究の進捗状況は順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、糖鎖の相互作用解析を進めるとともに、ジャイアントベシクルへの糖鎖組み込みと機能制御を行う。糖鎖相互作用解析では、高磁場NMR計測とともに、レプリカ交換分子動力学法による分子シミュレーションを活用する。さらに、ナノ空間を利用した糖鎖の構造解析も実施する。一方、細胞様機能の創出へ向けては、合成した糖鎖カートリッジを用いて糖鎖を集積化し、糖鎖が担う分子認識能などを付与した糖鎖クラスターを創出する。神経細胞に存在するガングリオシド型糖鎖を主なグライコトープとし、脂質膜上で複合糖質構造へと変換可能な分子システムへと組み込む。さらに、これらのネオグライコ分子をマイクロメートルサイズのジャイアントベシクルへ導入することで、人工細胞モデルの創出に取り組む。また、NMR法を中心とした技術基盤を活用し、領域内外との共同研究を推進していく。本研究によって得られる成果に関しては、学術雑誌、学術集会においての発表に加え、ホームページやマスメディア、アウトリーチ活動を最大限に活用して広く社会に発信していく。

  • Research Products

    (7 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Solid-state 17O NMR analysis of synthetically 17O-enriched D-glucosamine2020

    • Author(s)
      Kazuhiko Yamada, Yoshiki Yamaguchi, Yoshinori Uekusa, Kazumasa Aoki, Ichio Shima, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 749 Pages: 137455

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2020.137455

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Remodeling of the Oligosaccharide Conformational Space in the Prebound State To Improve Lectin-Binding Affinity2019

    • Author(s)
      Suzuki Tatsuya、Yanaka Saeko、Watanabe Tokio、Yan Gengwei、Satoh Tadashi、Yagi Hirokazu、Yamaguchi Takumi、Kato Koichi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b00594

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ネオ糖脂質の動的形成を利用したジャイアントベシクルの形態制御2020

    • Author(s)
      稲葉秋星, 松尾 宗征, 栗原 顕輔, 山口拓実
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
  • [Presentation] 糖鎖コンフォメーション空間の改変による糖-タンパク質間相互作用の制御2019

    • Author(s)
      山口拓実, 鈴木達哉, 龍岡博亮, 谷中冴子, 矢木宏和, 佐藤匡史, 加藤晃一
    • Organizer
      第17回ホスト-ゲスト超分子化学シンポジウム
  • [Presentation] シッフ塩基形成を利用した糖鎖の動的集積2019

    • Author(s)
      稲葉秋星, 森 一樹, 栗原顕輔, 山口拓実
    • Organizer
      生体機能関連化学部会若手の会 第31回サマースクール
  • [Presentation] 常磁性NMR計測を活用した糖鎖の動的立体構造解析法の開発2019

    • Author(s)
      山口拓実
    • Organizer
      第38回日本糖質学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 未結合状態の糖鎖のコンフォメーション空間の改変によるレクチン親和性の向上2019

    • Author(s)
      鈴木達哉, 谷中冴子, 渡邉東紀男, Gengwei Yan, 佐藤匡史, 矢木宏和, 山口拓実, 加藤晃一
    • Organizer
      第38回日本糖質学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi